临床样本和细胞系中RNF182、p65、PDL1表达检测
验证RNF182在LUAD中的表达水平及其与临床病理特征和p65/PDL1的相关性。
收集47例LUAD组织和配对癌旁组织,进行IHC染色;对A549、NCI-H1975和BEAS-2B细胞进行RT-qPCR和WB检测。
RNF182 induces p65 ubiquitination to affect PDL1 transcription and suppress immune evasion in lung adenocarcinoma.
包含临床样本IHC、细胞功能实验、Co-IP泛素化验证、ChIP-qPCR和荧光素酶报告基因、T细胞共培养、体内荷瘤模型等多个独立证据层级。
肺腺癌细胞系A549和NCI-H1975 人正常肺上皮细胞BEAS-2B 293T细胞 LUAD组织及配对癌旁组织(47例) C57BL/6J小鼠皮下荷瘤模型
LUAD组织样本量:47对肿瘤及癌旁组织 RNF182过表达后p65蛋白降解的CHX追踪时间点:0、1、2、4小时 Co-IP实验中MG132处理浓度和时间:20μM,12小时 荷瘤小鼠每组数量:n=5,观察周期4周 细胞与CD8+T细胞共培养时靶细胞与效应细胞比例:4×10^5 LUAD细胞与6×10^5 T细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证RNF182在LUAD中的表达水平及其与临床病理特征和p65/PDL1的相关性。
收集47例LUAD组织和配对癌旁组织,进行IHC染色;对A549、NCI-H1975和BEAS-2B细胞进行RT-qPCR和WB检测。
评估RNF182过表达对细胞增殖、集落形成、迁移、侵袭和凋亡的影响。
使用慢病毒载体在A549和NCI-H1975细胞中过表达RNF182,通过CCK-8、集落形成、Transwell和流式细胞术检测细胞功能。
验证RNF182作为E3泛素连接酶是否促进p65的泛素化和降解。
在293T细胞中过表达RNF182和p65,通过MG132和CHX处理,结合Co-IP和WB检测p65的泛素化水平和蛋白稳定性。
验证p65是否结合PDL1启动子激活其转录,以及RNF182是否影响这一过程。
通过ChIP-qPCR检测p65与PDL1启动子的结合,通过荧光素酶报告基因检测p65对PDL1启动子的转录激活,并评估RNF182过表达的影响。
探讨RNF182通过调控p65/PDL1轴在体外和体内对免疫逃逸的影响。
将LUAD细胞与CD8+T细胞共培养,检测LDH释放和IFN-γ、IL-2分泌;构建皮下荷瘤模型,评估肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | RNF182抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-52925 |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| PDL1抗体 | Abcam | ab205921 | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| F12K培养基 | -- | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TaKaRa | RR047A | |
| TB Green Premix Ex Taq II | TaKaRa | RR820A | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | 89901 |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 32209 | |
| RNF182抗体 | Abcam | ab72533 | |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| PDL1抗体 | Abcam | ab205921 | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab115777 | |
| IgG(辣根过氧化物酶) | Abcam | ab6721 | |
| ChIP-qPCR | EZ-Magna ChIP G试剂盒 | Sigma-Aldrich | 17-409 |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 兔IgG | Abcam | ab171870 | |
| 荧光素酶报告实验 | 脂质体转染试剂3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000150 |
| 双荧光素酶检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 11402ES60 | |
| Co-IP | MG132 | Sigma-Aldrich | M7449 |
| 免疫共沉淀试剂盒 | ACE Biotechnology | AM001-01 | |
| HA标签抗体 | Abcam | ab236632 | |
| Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2278 | |
| Flag抗体 | Abcam | ab205606 | |
| CCK-8 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0037 |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC和PI细胞凋亡检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | V13242 |
| LDH释放实验 | 乳酸脱氢酶试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0016 |
| ELISA | IFN-γ试剂盒 | Abcam | ab174443 |
| IL-2试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PI580 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | LUAD组织及配对癌旁组织样本量:47例;患者术前未接受抗肿瘤治疗;伦理批准号LLSC-2019032710。 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| 细胞培养 | 细胞系:BEAS-2B, A549, NCI-H1975, 293T;培养基:DMEM、F12K、RPMI-1640;血清浓度10% FBS;培养条件37°C、5% CO2。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 过表达实验 | 慢病毒载体oe-RNF182和oe-p65的构建与转染;筛选抗生素浓度和筛选时间(48小时);未明确抗生素浓度。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| p65泛素化检测 | CHX浓度100μM,处理时间0、1、2、4小时;MG132浓度20μM,处理12小时;Co-IP使用HA抗体。 阅读提示:Materials and Methods 2.8, 2.9 |
| ChIP-qPCR | 细胞数量1×10^7;使用p65抗体和兔IgG对照;未明确超声条件等。 阅读提示:Materials and Methods 2.6 |
| 荧光素酶报告实验 | 野生型和突变型PDL1启动子载体;293T细胞;Lipofectamine 3000转染;检测时间48小时。 阅读提示:Materials and Methods 2.7 |
| 细胞功能实验 | CCK-8:每孔2000细胞,检测时间0、24、48、72h;集落形成:每孔1000细胞,14天;Transwell:4×10^4细胞,48小时;凋亡:5×10^4细胞, Annexin V/PI染色15分钟。 阅读提示:Materials and Methods 2.10-2.13 |
| 免疫共培养 | 靶细胞(LUAD)4×10^5,效应细胞(CD8+T)6×10^5,共培养24小时;LDH释放检测,ELISA检测IFN-γ和IL-2。 阅读提示:Materials and Methods 2.14, 2.15 |
| 体内动物实验 | C57BL/6J小鼠,每组5只,共20只;A549细胞皮下注射;肿瘤体积每周测量,观察4周;处死剂量150mg/kg 1%戊巴比妥。 阅读提示:Materials and Methods 2.16 |