体外细胞凋亡检测
验证Chr-A是否诱导U251和U87-MG细胞的凋亡。
使用Annexin V-EGFP/PI染色和流式细胞术检测不同浓度Chr-A处理48小时后的细胞凋亡率;使用Caspase-3/7活性检测试剂盒测定caspase 3/7活性。
Chrysomycin A Regulates Proliferation and Apoptosis of Neuroglioma Cells via the Akt/GSK-3β Signaling Pathway In Vivo and In Vitro.
包含异种移植小鼠模型、RNA-seq、流式凋亡检测、Western blot等多层级实验,并进行了体内外功能与机制验证。
U87-MG异种移植无毛小鼠模型 U251人胶质母细胞瘤细胞系 U87-MG人胶质母细胞瘤细胞系
Chr-A给药剂量:3 mg/kg和10 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续18天 细胞处理浓度:U87-MG细胞0、0.2、0.6、1.8 μM;U251细胞0、0.2、0.4、0.8 μM,处理48小时 凋亡检测:Annexin V-EGFP/PI染色,流式细胞术 蛋白质表达验证:Western blot检测Bax、Bcl-2、caspase 3/7/9、Akt、p-Akt、GSK-3β、p-GSK-3β等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Chr-A是否诱导U251和U87-MG细胞的凋亡。
使用Annexin V-EGFP/PI染色和流式细胞术检测不同浓度Chr-A处理48小时后的细胞凋亡率;使用Caspase-3/7活性检测试剂盒测定caspase 3/7活性。
评估Chr-A在体内的抗肿瘤作用。
将U87-MG细胞皮下植入无毛小鼠,待肿瘤体积达100-150 mm³后,随机分组并腹腔注射Chr-A或溶媒,每日一次,连续18天,测量肿瘤体积和体重。
评估Chr-A对肿瘤细胞增殖的影响。
对肿瘤组织切片进行Ki67免疫荧光染色,计算Ki67阳性细胞百分比。
鉴定Chr-A调控的基因及潜在机制。
提取肿瘤组织总RNA进行RNA-seq,筛选差异表达基因,并与数据库中的胶质母细胞瘤相关靶点取交集,进行GO和KEGG富集分析。
验证Chr-A对Akt/GSK-3β信号通路及凋亡相关蛋白的影响。
提取肿瘤组织蛋白,通过Western blot检测Akt、p-Akt、GSK-3β、p-GSK-3β、Bax、Bcl-2、caspase 3/7/9及cleaved forms的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco BRL | -- |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-50 | |
| 动物实验 | 雌性BALB/c无毛小鼠 | Beijing Vital River Laboratory Animal Technology Co., Ltd. | SCXK(Jing) 2021-0006 |
| 免疫荧光 | 抗Ki67抗体 | Servicebio | GB111141 |
| 牛血清白蛋白 | Servicebio | G5001 | |
| Cy3标记的二抗 | -- | -- | |
| 4,6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- | |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 细胞培养 | U251和U87-MG细胞 | Cell Bank of the Chinese Academy of Sciences | -- |
| 凋亡检测 | TransDetect® Annexin V-EGFP/PI细胞凋亡检测试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| BD FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| BD Accuri C6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| caspase活性检测 | Caspase-3/7活细胞荧光实时检测试剂盒 | KeyGenBioTECH | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | ApplyGen | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | ApplyGen | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| 抗Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗Cleaved Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗Caspase 7抗体 | Cell Signaling Technology | 12827 | |
| 抗Cleaved Caspase 7抗体 | Cell Signaling Technology | 8438 | |
| 抗Caspase 9抗体 | Cell Signaling Technology | 9508 | |
| 抗Cleaved Caspase 9抗体 | Cell Signaling Technology | 20750 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗p-Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗GSK-3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| 抗p-GSK-3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9323 | |
| 抗Slug抗体 | Cell Signaling Technology | 9585 | |
| 抗MMP2抗体 | Cell Signaling Technology | 87809 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 异种移植小鼠模型 | 细胞接种量、给药剂量、给药途径、给药频率、动物品系、年龄、体重、样本量 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.2 |
| 细胞培养和药物处理 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件、药物浓度、处理时间 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.6 |
| 凋亡检测 | 细胞接种密度、处理时间、检测试剂盒、流式细胞仪型号 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.7 and 4.8 |
| Western blot | 蛋白提取方法、上样量、凝胶浓度、抗体稀释比例、孵育时间、内参 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.9 |
| RNA-seq分析 | 测序平台、差异表达基因筛选阈值、交集基因筛选方法、富集分析方法 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.4 and 4.5 |