检测SGK1磷酸化水平及其调节
观察静息和生长因子刺激下SGK1的磷酸化状态,并验证磷酸酶对SGK1磷酸化的影响。
在多种细胞系中,使用商业和自制抗体检测SGK1的pS422和pT256水平,并用磷酸酶抑制剂处理细胞。
Phosphatases maintain low catalytic activity of SGK1: DNA damage resets the balance in favor of phosphorylation.
包含细胞系实验、敲除/敲低、免疫沉淀、体外激酶筛选、质粒突变及药物处理等多种验证,且机制验证充分。
293T细胞 HeLa细胞 293T基因敲除细胞系(FAM122A KO、PP5 KO、DNA-PK KO、RICTOR KO) 293T稳定表达SGK1-HA、SGK1-S422D-HA、mCherry的细胞系
SGK1磷酸化检测需经免疫沉淀富集 磷酸酶抑制剂处理(Calyculin A 100 nM,okadaic acid 1 μM) 基因敲除(PP5 KO、FAM122A KO、DNA-PK KO、RICTOR KO) DNA损伤诱导剂(BLM 30 μg/ml,etoposide 1 μM) 特异性抑制剂(AZD7648、Torkinib、AZD5363)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察静息和生长因子刺激下SGK1的磷酸化状态,并验证磷酸酶对SGK1磷酸化的影响。
在多种细胞系中,使用商业和自制抗体检测SGK1的pS422和pT256水平,并用磷酸酶抑制剂处理细胞。
确定PP5和PP2A在SGK1去磷酸化中的作用及其分子机制。
通过表达野生型或催化失活的PP5、敲除PP5,进行共免疫沉淀和pull-down实验,检测SGK1与PP5/Hsp90/CDC37复合物的相互作用及其对SGK1磷酸化的影响;通过表达PP2A内源性抑制剂和B亚基,验证PP2A对SGK1的调控,并鉴定关键B亚基和FAM122A的作用。
检验FAM122A的S37磷酸化是否影响其对PP2A的抑制及SGK1磷酸化水平。
通过点突变(S37A/D)和磷酸化特异性抗体检测FAM122A的磷酸化状态,并检测对SGK1磷酸化的影响;进行质谱分析确定磷酸化位点。
确定DNA损伤诱导的SGK1磷酸化是否由DNA-PK介导,并探究与mTORC2的关系。
用DNA损伤药物处理细胞,检测SGK1磷酸化变化;使用DNA-PK抑制剂或敲除DNA-PK,以及mTORC1/2抑制剂和RICTOR敲除,确定信号通路。
检验SGK1在DNA损伤和AKT抑制条件下对细胞存活的作用。
过表达SGK1-WT或组成性激活的SGK1-S422D,或用siRNA敲低SGK1,在BLM和AKT抑制剂存在下测定细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | 抗SGK1抗体 | Cell Signaling Technology | 12103 |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化AKT抗体(Ser473) | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 磷酸化AKT抗体(Thr308) | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| Chk1抗体 | Cell Signaling Technology | 2360 | |
| 磷酸化Chk1抗体(Ser345) | Cell Signaling Technology | 2348 | |
| 磷酸化组蛋白H2A.X抗体(Ser139) | Cell Signaling Technology | 2577 | |
| NDRG1抗体 | Cell Signaling Technology | 9395 | |
| 磷酸化NDRG1抗体(Thr346) | Cell Signaling Technology | 3217 | |
| 磷酸化NEDD4L抗体(Ser448) | Cell Signaling Technology | 8063 | |
| Hsp90抗体 | Cell Signaling Technology | 4877 | |
| CDC37抗体 | Cell Signaling Technology | 4793 | |
| HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| FLAG标签抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 磷酸化SGK1抗体(S422) | Invitrogen | 44-1264G | |
| FAM122A抗体 | Invitrogen | MA5-24510 | |
| V5-HRP抗体 | Invitrogen | R961-25 | |
| NEDD4-2抗体 | Abcam | ab131167 | |
| PP5抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271816 | |
| FAM122A抗体 | Novus Biologicals | NBP2-31646 | |
| GAPDH-HRP抗体 | Easybio | BE0034-100 | |
| 肌动蛋白-HRP抗体 | ABGENT | AM8502b | |
| 抗兔IgG HRP二抗 | Invitrogen | A16110 | |
| 抗鼠IgG HRP二抗 | Invitrogen | A16072 | |
| 分子克隆 | Q5高保真DNA聚合酶 | NEB | M0491 |
| PfuTurbo DNA聚合酶 | Agilent | 600257 | |
| 抗体生产 | 钥孔血蓝蛋白(mcKLH) | Thermo Fisher Scientific | 77666 |
| 磷酸肽层析柱 | Thermo Fisher Scientific | 20401 | |
| 蛋白处理 | Lambda蛋白磷酸酶 | NEB | P0753S |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Hyclone | -- | |
| 药物处理 | 胰岛素 | Invitrogen | 12585-014 |
| 胰岛素样生长因子1 | Invitrogen | PMG0075 | |
| Torin 1 | Selleck | S2827 | |
| Torkinib | MedChemExpress | HY-10474 | |
| Pictilisib | Cayman Chemical | 11600 | |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | HY-10219 | |
| 花萼海绵诱癌素A | Cell Signaling Technology | 9902 | |
| 冈田酸 | Cell Signaling Technology | 5934 | |
| Tautomycetin | APEBIO | B7009 | |
| 博来霉素 | Selleck | S1214 | |
| 依托泊苷 | Selleck | S1225 | |
| Prexasertib | Selleck | S6385 | |
| AZD7648 | Selleck | S8843 | |
| AZD5363 | Selleck | S8019 | |
| 细胞裂解和免疫沉淀 | 杜氏磷酸盐缓冲液 | Macgene | CC010 |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 4693132001 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 04906837001 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| FLAG磁珠 | Sigma-Aldrich | M8823 | |
| HA磁珠 | Pierce | 88837 | |
| Protein G琼脂糖 | Pierce | 20398 | |
| 免疫沉淀 | Strep-Tactin XT Superflow | Neuromics | 2-4010-010 |
| 生物素 | IBA | 6-6325-001 | |
| Western blot | 12% SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | 1610175 |
| PVDF膜 | PALL | BSP0161 | |
| Immobilon Western HRP底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| Bio-Rad ChemiDoc XRS+ | Bio-Rad | -- | |
| 质谱分析 | Imperial蛋白染色剂 | Thermo Fisher Scientific | 24615 |
| Thermo-Dionex Ultimate 3000高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q Exactive质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| ProtoScript II第一链cDNA合成试剂盒 | NEB | E6560S | |
| RealStar Green Fast Mixture with ROX | GenStar | A303-05 | |
| StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo试剂盒 | Promega | G7570 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(293T、HeLa等),培养基成分(DMEM、10% FBS、青霉素/链霉素),培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:实验方法:Cell culture |
| 药物处理 | 药物浓度和处理时间:胰岛素20 μg/ml 30 min,IGF1 250 ng/ml 30 min,Calyculin A 100 nM 15 min等 阅读提示:实验方法:Drug treatments |
| 基因敲除 | sgRNA序列(FAM122A、PP5、DNA-PK),筛选浓度1 μg/ml puromycin,RICTOR KO细胞来源 阅读提示:实验方法:Generation of stable cell lines |
| 免疫沉淀和Western blot | 裂解缓冲液(TENT 1%)、蛋白酶和磷酸酶抑制剂、抗体稀释比例 阅读提示:实验方法:Cell lysis and immunoprecipitation, Western blots |
| 细胞活力检测 | 细胞种植密度(293T 1000细胞/孔,HeLa 2000细胞/孔),处理方案(BLM 30 μg/ml,AZD5363 1 μM),检测时间(2天或5天) 阅读提示:实验方法:Cell viability assays |