RNF8缺失对肿瘤进展和免疫浸润的影响
评估基质中RNF8缺失对黑色素瘤生长和肿瘤微环境中免疫细胞浸润的影响。
将B16F10细胞皮下注射到RNF8+/+和RNF8−/−小鼠,比较肿瘤生长、HE染色淋巴细胞数量及CyTOF分析免疫细胞亚群。
RNF8 enhances the sensitivity of PD-L1 inhibitor against melanoma through ubiquitination of galectin-3 in stroma.
包含体外泛素化实验、细胞模型、RNF8敲除小鼠模型、CyTOF免疫分析及联合治疗体内实验,功能与机制验证较完整。
RNF8基因敲除小鼠(RNF8−/−) B16F10黑色素瘤细胞皮下移植瘤模型 A375和293T细胞系
宿主小鼠RNF8基因型(RNF8+/+ vs RNF8−/−) B16F10细胞皮下注射剂量(5×10^6) gal-3抑制剂LacNAc(LAC)给药剂量(0.1 μmol/肿瘤,瘤内注射) PD-L1抑制剂给药剂量(1 μmol/小鼠,腹腔注射) 实验重复数(n=3或n=6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估基质中RNF8缺失对黑色素瘤生长和肿瘤微环境中免疫细胞浸润的影响。
将B16F10细胞皮下注射到RNF8+/+和RNF8−/−小鼠,比较肿瘤生长、HE染色淋巴细胞数量及CyTOF分析免疫细胞亚群。
检测RNF8缺失对肿瘤中IL-12和IFN-γ表达及分布的影响。
通过Western blot和免疫组化检测肿瘤中心和边缘的IL-12、IFN-γ、CXCL-9、CXCL-10表达。
验证gal-3是否结合IL-12和IFN-γ。
将重组人gal-3包被磁珠,与IL-12或IFN-γ孵育,加入乳糖或LacNAc后检测上清中细胞因子含量。
确定RNF8是否负调控gal-3表达。
在293T和A375细胞中敲低或过表达RNF8,检测gal-3蛋白水平,并通过免疫荧光和Co-IP验证相互作用。
阐明RNF8是否通过K48泛素化促进gal-3降解。
使用CHX追踪实验、MG132处理、泛素化检测,构建K176R突变体,检测K48和K63泛素化水平。
评估gal-3抑制剂LAC对免疫细胞浸润和肿瘤生长的影响。
向RNF8+/+和RNF8−/−小鼠的肿瘤内注射LAC或DMSO,检测肿瘤生长、免疫细胞浸润和细胞因子水平。
评估gal-3抑制联合PD-L1抑制剂对黑色素瘤的治疗效果。
对荷瘤小鼠分别给予PD-L1抑制剂、LAC或联合治疗,比较肿瘤生长、细胞增殖和免疫细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | SH30022.01 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10100147C | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 1640培养基 | Cytiva | SH30809.01 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L3000001 |
| 动物实验 | LacNAc | FuShen | FS0234 |
| PD-L1抑制剂1 | AbMole | M8959 | |
| 质谱流式 | 小鼠细胞内细胞因子I panel试剂盒 | Fluidigm | -- |
| 肿瘤浸润组织淋巴细胞分离液 | Solarbio | P9000 | |
| EQ四元素校准微球 | Fluidigm | -- | |
| Western blot | RNF8抗体 | Proteintech | 14112-1-AP |
| β-微管蛋白抗体 | Affinity | T0023 | |
| 免疫组织化学 | CD3抗体 | Affinity | DF6594 |
| Western blot | IL-12抗体 | Affinity | AF5133 |
| IFN-γ抗体 | Affinity | DF6045 | |
| CXCL-9抗体 | Affinity | DF9920 | |
| CXCL-10抗体 | Affinity | DF6417 | |
| 半乳糖凝集素-3抗体 | Proteintech | 14979-1-AP | |
| HIF-1α抗体 | Proteintech | 66730-1-Ig | |
| p-IκBα抗体 | Abcam | ab133462 | |
| NF-κB抗体 | Abcam | ab16502 | |
| 磷酸化NF-κB抗体 | Santacruze | sc-101752 | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 60097-1-Ig | |
| Flag抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| HA抗体 | Proteintech | 66006-2-Ig | |
| His抗体 | Proteintech | 66005-1-Ig | |
| 泛素抗体 | CST | 91112S | |
| K48抗体 | CST | 12805 | |
| K63抗体 | CST | 5621S | |
| 抗小鼠二抗 | Proteintech | SA00001-1 | |
| 抗兔二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 免疫共沉淀 | BeaverBeads蛋白A免疫沉淀试剂盒 | BeaverBeads | 22202-20 |
| 泛素化检测 | MG132 | MCE | HY-13259 |
| Epoxomicin | MCE | HY-13821 | |
| PR-619 | MCE | HY-13814 | |
| gal-3结合实验 | Dynabeads M-280链霉亲和素磁珠 | Invitrogen | 11-205-D |
| 重组人gal-3 | sinobiological | 10289-H08H1 | |
| 乳糖 | Solarbio | L8911 | |
| 重组IFN-γ | sinobiological | 11725-HNAS | |
| 重组IL-12 | sinobiological | 10052-H02H | |
| ELISA | IFN-γ ELISA试剂盒 | JiangLai | JL12152 |
| IL-12 ELISA试剂盒 | JiangLai | JL29081 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(A375、A549、B16F10、293T)的来源和培养条件(培养基、FBS浓度、抗生素) 阅读提示:Materials and methods: Cells lines and cells culture |
| 动物模型 | 小鼠品系(RNF8−/−和RNF8+/+),年龄(3月龄),性别(雄性),B16F10细胞注射剂量和途径 阅读提示:Materials and methods: Animals, Mouse xenograft tumor models |
| 药物处理 | LacNAc和PD-L1抑制剂的剂量、给药途径(瘤内/腹腔)、给药频率和开始时间 阅读提示:Materials and methods: Mouse xenograft tumor models, Figure legends |
| 质谱流式 | CyTOF抗体panel、细胞数量、数据分析软件和参数(t-SNE、SPADE) 阅读提示:Materials and methods: Mass cytometry, t-SNE analysis, SPADE analysis |
| 泛素化检测 | CHX浓度、MG132浓度和处理时间、泛素化检测方法(IP和western blot) 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, Figure 5 |