表达分析
验证BTF3在HCC组织中的表达及其与预后的关系
通过TCGA等数据库分析BTF3在LIHC中的表达和生存率,并在30对HCC组织和癌旁组织中检测BTF3的mRNA和蛋白水平。
BTF3 promotes proliferation and glycolysis in hepatocellular carcinoma by regulating GLUT1.
包含体外细胞实验(增殖、糖酵解检测)、分子机制验证(Co-IP、双荧光素酶报告基因)和体内异种移植瘤模型,功能验证和机制验证均具备。
Huh7细胞系 HCCLM3细胞系 Huh7细胞异种移植BALB/c裸鼠模型
BTF3在HCC组织和细胞系中的高表达 siBTF3#1和siBTF3#2的敲低效率 FOXM1过表达对BTF3敲低效应的恢复 FOXM1与GLUT1启动子的直接结合 sh-BTF3在体内对肿瘤生长的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证BTF3在HCC组织中的表达及其与预后的关系
通过TCGA等数据库分析BTF3在LIHC中的表达和生存率,并在30对HCC组织和癌旁组织中检测BTF3的mRNA和蛋白水平。
评估敲低BTF3对HCC细胞增殖的影响
用siBTF3#1和siBTF3#2转染Huh7和HCCLM3细胞,通过CCK-8和EdU实验检测细胞活力和DNA合成。
评估敲低BTF3对HCC细胞糖酵解的影响
通过Seahorse XF96检测ECAR,并使用试剂盒检测葡萄糖消耗和乳酸产生。
验证BTF3与FOXM1、FOXM1与GLUT1之间的直接相互作用
通过Co-IP验证BTF3与FOXM1蛋白相互作用;通过双荧光素酶报告基因实验验证FOXM1对GLUT1启动子的转录调控。
验证FOXM1过表达能否恢复正常
在BTF3敲低的基础上过表达FOXM1,检测细胞活力、ECAR、葡萄糖消耗和乳酸产生,以及FOXM1和GLUT1蛋白水平。
验证敲低BTF3对HCC肿瘤生长的影响
将转染sh-BTF3的Huh7细胞皮下接种到BALB/c裸鼠,测量肿瘤体积和重量,通过IHC和Western blot检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PM150210 |
| 胎牛血清 | -- | 12103C | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | 9108-1 |
| RT-qPCR | Bio-Rad ScripTM cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 |
| SYBR Green PCR预混液 | Solarbio | SR1110 | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | CA1210 |
| EdU实验 | BeyoClick™ EdU细胞增殖检测试剂盒(Alexa Fluor 647) | Beyotime | C0081S |
| 细胞核染色 | Hoechst 33342染色液 | Beyotime | -- |
| ECAR检测 | Seahorse XF糖酵解压力测试试剂盒 | Seahorse Bioscience | 103020-100 |
| 葡萄糖检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Sigma | CBA086 |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | Biovision | K607 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | E1910 |
| 免疫组化 | 石蜡 | Solarbio | YA0011 |
| 柠檬酸钠缓冲液(pH 6.0) | Beyotime | P0081 | |
| 牛血清白蛋白 | Beyotime | ST2249 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012S | |
| ECL Western印迹检测试剂盒 | Solarbio | SW2030 | |
| 抗体(Western blot/IHC) | 抗BTF3抗体 | Abcam | ab203517 |
| 抗FOXM1抗体 | Abcam | ab207298/ab180710 | |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab128033 | |
| 抗体(IHC) | 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 |
| HRP标记的抗兔IgG抗体 | Abcam | ab288151 | |
| 抗体(Western blot) | 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8227 |
| 山羊抗兔IgG二抗(HRP) | Abcam | ab6721 | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Cyagen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源(Huh7和HCCLM3)、培养条件(DMEM+10%FBS,37℃,5% CO2)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、siRNA序列(siBTF3#1和siBTF3#2)、转染后孵育时间(48小时) 阅读提示:参考Methods 2.3 Cell culture and transfection |
| 细胞增殖检测 | CCK-8实验细胞密度(5000细胞/孔)、EdU实验细胞密度(6×10^5细胞/孔)、孵育时间(CCK-8为2小时)、EdU试剂盒规格 阅读提示:参考Methods 2.5 Cell counting kit-8 (CCK-8) assay 和2.6 EdU incorporation assay |
| 糖酵解检测 | ECAR检测细胞密度(1×10^4细胞/孔)、葡萄糖/寡霉素/2-DG加入时间点(20、40、60分钟)、检测间隔(每6分钟)、葡萄糖和乳酸检测试剂盒型号 阅读提示:参考Methods 2.7 Detection of extracellular acidification rate 和2.8 Measurement of glucose consumption and lactate production |
| 分子相互作用验证 | Co-IP抗体(BTF3、FOXM1、IgG)、双荧光素酶报告基因载体(GLUT1-WT/MUT序列)、共转染质粒量(pGL3-Basic 2μg/ml, pRL-TK 100ng/ml)、检测时间(转染后24小时) 阅读提示:参考Methods 2.9 Dual-luciferase reporter assay 和2.10 Co-immunoprecipitation (Co-IP) assay |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、年龄(4周龄)、分组(sh-NC和sh-BTF3,每组5只)、细胞接种量(1×10^6)、肿瘤测量周期(每周一次,共4周)、处死时间(28天)、麻醉剂量(100mg/kg)、IHC抗体浓度 阅读提示:参考Methods 2.11 Animal experiment 和2.12 Immunohistochemistry |