ESC–MSCs的制备与鉴定
获得并验证ESC–MSCs的间充质干细胞特性,为后续EVs提取提供来源。
通过两步法将人胚胎干细胞分化为ESC–MSCs,使用流式细胞术检测表面标志物(CD73、CD90、CD105阳性,CD19、CD45等阴性),并通过成骨、成软骨、成脂诱导分化评估多向分化潜能。
Extracellular vesicles derived from human ESC-MSCs target macrophage and promote anti-inflammation process, angiogenesis, and functional recovery in ACS-induced severe skeletal muscle injury.
包含大鼠ACS模型体内实验、巨噬细胞清除验证、THP-1细胞体外功能实验、转录组测序及miRNA测序,并验证了相关信号通路与靶点,实验层级完整且机制验证明确。
大鼠急性骨筋膜室综合征(ACS)模型 THP-1细胞诱导的巨噬细胞模型
ESC–MSC-EVs给药剂量和时间(100 μg,通过背阴茎静脉在筋膜切开术时给予) ACS模型诱导条件(压力80±10 mmHg持续2 h) 巨噬细胞清除实验(脂质体氯膦酸盐注射方案) 体外巨噬细胞极化实验(PMA 160 ng/ml、LPS 100 ng/ml、IFN-γ 50 ng/ml、EVs 10 μg/ml处理48 h) 主要结果检测时间点(3 d、7 d、14 d)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证ESC–MSCs的间充质干细胞特性,为后续EVs提取提供来源。
通过两步法将人胚胎干细胞分化为ESC–MSCs,使用流式细胞术检测表面标志物(CD73、CD90、CD105阳性,CD19、CD45等阴性),并通过成骨、成软骨、成脂诱导分化评估多向分化潜能。
从ESC–MSCs培养上清中分离并表征细胞外囊泡,确认其形态、粒径和表面标志物。
采用超速离心法提取ESC–MSC-EVs,通过透射电子显微镜(TEM)观察形态,NanoSight分析粒径,Western blot检测表面标志物(HSP70、TSG101、CD63、CD9)及Calnexin表达。
评估ESC–MSC-EVs对ACS诱导的骨骼肌损伤的治疗效果。
构建大鼠ACS模型(压力80±10 mmHg持续2 h),筋膜切开术后通过背阴茎静脉注射ESC–MSC-EVs(100 μg)或PBS,在不同时间点(3 d、7 d、14 d)分析肌肉损伤、凋亡、再生、纤维化及功能。
验证ESC–MSC-EVs被巨噬细胞吞噬,并在炎症环境中直接调节巨噬细胞极化。
使用PKH67标记EVs与THP-1细胞共培养观察吞噬;用PMA诱导THP-1分化为巨噬细胞,LPS和IFN-γ刺激诱导M1极化,再加入EVs共培养48 h,检测标志物表达、细胞因子分泌和M1/M2比例。
探究ESC–MSC-EVs调节巨噬细胞极化的分子机制。
对LPS+IFN-γ和LPS+IFN-γ+EVs组的THP-1细胞进行转录组测序(Illumina Novaseq 6000),鉴定差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
鉴定ESC–MSC-EVs中与巨噬细胞极化相关的miRNA,并验证其靶向机制。
对ESC–MSC-EVs进行小RNA测序,筛选高表达miRNA,合成miRNA mimics转染THP-1细胞,检测靶基因mRNA和蛋白水平及下游信号通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与分化 | MSC增殖培养基 | ExCell Bio | -- |
| 明胶 | -- | -- | |
| 茜素红 | -- | -- | |
| 阿利新蓝 | -- | -- | |
| 油红O | -- | -- | |
| EVs分离 | 超高速离心机 | Beckman | -- |
| EVs表征 | 电子显微镜 | JEOL | -- |
| NanoSight NS500 | Malvern Instruments | -- | |
| 细胞培养与分化 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma | -- |
| 脂多糖 | Sigma | -- | |
| 干扰素-γ | Novoprotein | -- | |
| EVs标记与摄取 | PKH67 | Sigma | -- |
| 离心柱 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | Meilunbio | -- | |
| TRITC标记的鬼笔环肽 | Yeason | -- | |
| 组织病理学分析 | Masson三色染色 | -- | -- |
| 光学显微镜 | Leica | -- | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Roche Inc. | -- |
| 抗dystrophin抗体 | Proteintech | 12715-1-AP | |
| 抗兔IgG Cy3二抗 | Proteintech | SA00009-2 | |
| Western blotting | 蛋白裂解液 | Biosharp | -- |
| 磷酸酶抑制剂 | Biosharp | -- | |
| BCA试剂盒 | Biosharp | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL试剂盒 | Millipore | -- | |
| 抗体 | 抗Calnexin抗体 | abcam | ab133615 |
| 抗HSP70抗体 | abcam | ab181606 | |
| 抗TSG101抗体 | abcam | ab125011 | |
| 抗CD63抗体 | abcam | ab134045 | |
| 抗CD9抗体 | abcam | ab263019 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 4970S | |
| 抗iNOS抗体 | Invitrogen | PA3-030A | |
| 抗Bcl-2抗体 | CST | 3498S | |
| 抗Bax抗体 | CST | 14796S | |
| 抗Cleaved caspase 3抗体 | CST | 9664S | |
| 抗CD206抗体 | CST | 24595 | |
| 抗CD68抗体 | abcam | ab283654 | |
| 抗CD86抗体 | abcam | ab220188 | |
| 抗Arg1抗体 | CST | 93668S | |
| 抗P65抗体 | CST | 8242S | |
| 抗磷酸化P65抗体 | CST | 3033S | |
| 抗IKBα抗体 | CST | 4812S | |
| 抗磷酸化IKBα抗体 | CST | 2859S | |
| 抗JAK1抗体 | CST | 3344T | |
| 抗磷酸化JAK1抗体 | CST | 74129S | |
| 抗STAT6抗体 | CST | 5397S | |
| 抗磷酸化STAT6抗体 | CST | 56554S | |
| 抗STAT3抗体 | CST | 12640S | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | CST | 9145S | |
| 抗PI3K抗体 | CST | 4249T | |
| 抗磷酸化PI3K抗体 | CST | 13857S | |
| 抗AKT抗体 | CST | 9272S | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | CST | 4060T | |
| 抗PTEN抗体 | Biolegend | 4C11A11 | |
| 抗NLRP3抗体 | CST | 15101S | |
| 抗mTOR抗体 | CST | 2983T | |
| 抗TLR3抗体 | CST | 6961S | |
| 血清分析 | 临床化学分析仪 | Landwind Medical | -- |
| ELISA | TNF-α、IL-6、IL-10 ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 肌功能测试 | 握力计 | Handpi HP-5N | -- |
| 免疫荧光染色 | 抗CD86抗体 | Santa Cruz | sc-20060 |
| 抗CD206抗体 | Santa Cruz | sc-58986 | |
| 抗CD31抗体 | R and D Systems | AF3628 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Nanodrop分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| PrimeScript RT试剂盒 | Yeason | -- | |
| Mx3000P实时PCR系统 | Agilent Technologies | -- | |
| SYBR混合物 | Yeason | -- | |
| 巨噬细胞清除 | 脂质体载体 | Vrije Universiteit | -- |
| 免疫组化 | 抗CD68抗体 | Santa Cruz | sc-20060 |
| HRP标记的二抗 | Boster | -- | |
| 亲和素-生物素-过氧化物酶复合物 | Boster | -- | |
| DAB显色液 | VectorLabs | -- | |
| 细胞培养 | THP-1细胞 | -- | -- |
| Procell培养基 | Procell | -- | |
| 流式细胞术 | TrypLE™ Express胰酶 | Biosharp | -- |
| Gamunex(人免疫球蛋白溶液) | -- | -- | |
| 抗CD206抗体 | Biolegend | 321103 | |
| 抗CD86抗体 | Biolegend | 374205 | |
| 流式细胞仪 | Beckman | -- | |
| 测序 | Illumina Novaseq 6000 | Illumina | -- |
| miRNA测序 | mirVana miRNA提取试剂盒 | Ambion | -- |
| TruSeq小RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Illumina HiSeq X Ten | Illumina | -- | |
| miRNA转染 | miRNA模拟物 | Sangon | -- |
| FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad | -- |
| CytExpert 2.4软件 | Beckman | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ACS大鼠模型构建与EVs治疗 | 大鼠品系、年龄、体重;ACS诱导压力和时间;EVs剂量和给药途径;治疗时间点;每组动物数 阅读提示:详见Methods中的Animal studies部分,以及图2和图3的图注 |
| ESC–MSC-EVs的制备与表征 | ESC–MSC培养条件;超速离心参数;EVs表征方法 阅读提示:详见Methods中的Extracellular vesicles (EVs) isolation and identification部分 |
| 巨噬细胞清除实验 | LC剂量、给药时间和途径;巨噬细胞清除效率验证 阅读提示:详见Methods中的Macrophages depletion部分和图5图注 |
| 体外巨噬细胞极化实验 | THP-1细胞分化条件(PMA浓度和时间);炎症刺激条件(LPS和IFN-γ浓度);EVs处理浓度和时间;检测时间点 阅读提示:详见Methods中的Macrophage differentiation and stimulation部分和图6图注 |
| 转录组测序和miRNA测序 | 测序平台;差异基因筛选标准;miRNA测序方法 阅读提示:详见Methods中的Transcriptome sequencing and bioinformatic analysis和Small RNA sequencing部分 |