观察P4HA1在缺氧和HLI模型中的表达
确定P4HA1在缺血条件下的表达变化及其在EC中的定位。
在HUVECs中通过Western blot检测缺氧(3、6、12小时)下P4HA1蛋白水平;在HLI小鼠模型中对腓肠肌组织进行Western blot和免疫荧光染色,检测P4HA1与CD31共定位。
Hypoxia-induced P4HA1 overexpression promotes post-ischemic angiogenesis by enhancing endothelial glycolysis through downregulating FBP1.
包含体外细胞实验(EdU、迁移、管形成)、体内HLI模型及血管密度检测、糖酵解功能测定(Seahorse、葡萄糖摄取、乳酸)、RNA-seq及机制验证(ChIP、双荧光素酶)。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 后肢缺血(HLI)小鼠模型 内皮细胞-周细胞球体共移植模型 人微血管周细胞(PCs)
细胞类型:HUVECs和PCs,培养条件(ECM培养基,37°C,5% CO2) 缺氧条件:1% O2,5% CO2,处理时间(3, 6, 12小时) 腺病毒感染:Ad-P4HA1、Ad-shP4HA1、Ad-NC、Ad-shNC,感染时间24小时 2-DG处理浓度:5 mM,处理时间24小时 octyl-α-KG处理浓度:1 mM,处理时间24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定P4HA1在缺血条件下的表达变化及其在EC中的定位。
在HUVECs中通过Western blot检测缺氧(3、6、12小时)下P4HA1蛋白水平;在HLI小鼠模型中对腓肠肌组织进行Western blot和免疫荧光染色,检测P4HA1与CD31共定位。
验证P4HA1过表达是否在体外和体内促进血管生成。
体外:HUVECs感染Ad-P4HA1后,进行EdU掺入、Transwell迁移和管形成实验。体内:HLI小鼠腓肠肌注射Ad-P4HA1,通过激光多普勒检测血流恢复,免疫荧光检测CD31阳性血管密度。
验证P4HA1敲低是否抑制血管生成。
体外:HUVECs感染Ad-shP4HA1后,进行增殖、迁移和管形成实验。体内:HLI小鼠注射Ad-shP4HA1,评估血流恢复和血管密度。
验证P4HA1是否通过调节糖酵解促进血管生成。
通过RNA-seq分析P4HA1过表达组的GSVA和GSEA富集,RT-PCR检测糖酵解酶mRNA水平,测量葡萄糖摄取和乳酸产生,Seahorse分析ECAR。
确认P4HA1通过糖酵解促进血管生成。
P4HA1过表达HUVECs用2-DG处理,检测增殖、迁移和管形成变化。
确定P4HA1通过下调FBP1增强糖酵解。
RNA-seq显示FBP1下调;RT-PCR和Western blot验证P4HA1过表达/敲低对FBP1的影响;过表达FBP1观察能否逆转P4HA1介导的糖酵解增强。
阐明P4HA1通过TET2下调FBP1的机制。
双荧光素酶报告基因实验定位FBP1启动子关键区域;ChIP检测TET2结合;Western blot检测TET2和HNF4α蛋白水平;过表达TET2观察能否逆转P4HA1介导的FBP1下调及血管生成。
证明P4HA1通过消耗α-KG降低TET2水平。
测量细胞内α-KG水平;使用octyl-α-KG处理观察能否恢复TET2和FBP1表达及逆转P4HA1诱导的血管生成。
确认在体内P4HA1过表达通过下调内皮TET2-FBP1通路促进血管生成。
在HLI模型中分离EC和非EC组分,检测TET2和FBP1蛋白水平;进行球体基于血管生成测定,比较P4HA1过表达及同时过表达FBP1或TET2的血管密度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 (1001, ScienCell) | ScienCell | 1001 |
| 周细胞培养基 (CM-H169) | Procell | CM-H169 | |
| 缺氧处理 | 培养箱 (3131, Thermo Scientific) | Thermo Scientific | 3131 |
| 细胞分离 | CD31偶联磁珠 | Thermo Scientific | 11061D |
| 球体生成 | 甲基纤维素 | MCE | HY-125,861 |
| 球体移植 | 基质胶 | BD Biosciences | 354234 |
| 纤维蛋白原 | Sigma | 341576 | |
| 凝血酶 | Sigma | 10602400001 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Servicebio | G2026 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 化学发光试剂 | Servicebio | G2014 | |
| Clinx成像系统 | -- | -- | |
| 抗P4HA1抗体 | Proteintech | 12658-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗TET2抗体 | AbClonal | A5682 | |
| 抗FBP1抗体 | AbClonal | A11664 | |
| 抗P4HA2抗体 | AbClonal | A22150 | |
| 抗P4HA3抗体 | AbClonal | A13767 | |
| 抗P4HB抗体 | AbClonal | A19239 | |
| 抗HIF-1α抗体 | Gene Tex | GTX127309 | |
| 抗Flag抗体 | Thermo Scientific | MA1-91878 | |
| 免疫荧光 | 驴血清 | Servicebio | G1217 |
| DAPI | Servicebio | GDP1024 | |
| 抗NG2抗体 | Abcam | ab275024 | |
| 抗肌球蛋白抗体 | Abcam | ab37484 | |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab182981 | |
| 腺病毒构建 | Gateway LR Clonase II酶 | Thermo Fisher Scientific | 11791020 |
| PacI限制酶 | Thermo Fisher Scientific | FD2204 | |
| EdU实验 | EdU细胞增殖试剂盒 | Beyotime | C0075L |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | 9108 |
| RNA浓度测定 | Nanodrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | ND-LITE |
| RT-PCR | PrimeScript™反转录试剂盒 | Takara | RR037A |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | Q121-02/03 | |
| 代谢检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Solarbio | BC2505 |
| 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A019-2 | |
| α-酮戊二酸含量检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK054 | |
| ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 | |
| 糖酵解应激分析 | Seahorse XF96细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 谷氨酰胺 | MCE | HY-N0390 | |
| 葡萄糖 | MCE | HY-B0389 | |
| 寡霉素 | MCE | HY-N6782 | |
| 2-脱氧葡萄糖 | MCE | HY-13966 | |
| ChIP | ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗TET2抗体 (MABE 462) | Millipore | MABE 462 | |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL3荧光素酶报告载体 | Promega | -- |
| pRL-TK内参质粒 | Miaoling | P0372 | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
| 动物实验 | 激光多普勒系统 | Perimed | -- |
| CD31偶联磁珠 | Thermo Scientific | 11061D |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与缺氧处理 | HUVECs分离方法、ECM培养基成分、缺氧条件(1% O2,5% CO2)及处理时间(3、6、12小时) 阅读提示:Methods中Cell culture and adenovirus infection部分,以及Figure 1A图注 |
| P4HA1过表达和敲低 | 腺病毒构建方法(Gateway系统)、感染复数(MOI)或感染剂量、感染时间(24小时) 阅读提示:Methods中Recombinant adenovirus construction和Cell culture and adenovirus infection部分 |
| 体外血管生成实验 | EdU浓度(0.1%)、处理时间(12小时);Transwell上室细胞数、下室FBS浓度(5%);Matrigel包被浓度、HUVECs接种数(2×10^4)及管形成观察时间(4小时) 阅读提示:Methods中5-Ethynyl-2′-deoxyuridine (EdU) incorporation assay, Transwell migration assay, 和Tube formation assay部分,以及Figure 2图注 |
| 体内HLI模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄(6周)、麻醉剂量(50 mg/kg戊巴比妥钠)、手术方法(股动脉结扎并切除)、腺病毒注射剂量(100 μL,1×10^9 PFU)及时间点(术后第1、7天) 阅读提示:Methods中Murine model of hindlimb ischemia部分,以及Figure 2E-G图注 |
| 糖酵解功能检测 | 葡萄糖摄取、乳酸产生、ATP和α-KG检测试剂盒及操作步骤;Seahorse实验细胞数(2.5×10^4)、谷氨酰胺浓度(2 mM)、葡萄糖(20 mM)、寡霉素(2 μM)、2-DG(50 mM)注射顺序 阅读提示:Methods中Measurement of glucose uptake, lactate production, cellular ATP, and cellular α-KG levels和Glycolysis stress assay部分,以及Figure 4E-J图注 |
| 机制研究(TET2和FBP1) | 双荧光素酶报告基因质粒构建(pGL3-FBP1截短体,-200至-1000)、ChIP实验中TET2抗体(MABE 462)及FBP1引物序列、ChIP DNA检测方法;octyl-α-KG处理浓度(1 mM) 阅读提示:Methods中Dual-luciferase reporter assay和Chromatin immunoprecipitation assay部分,以及Figure 7和8图注 |