体外抗肿瘤活性评估
评估恩度联合顺铂对NSCLC细胞增殖、迁移和凋亡的影响
使用MTT、集落形成、伤口愈合和流式细胞术检测A549细胞在联合治疗下的活力、增殖、迁移和凋亡变化
Multi-omics sequencing revealed endostar combined with cisplatin treated non small cell lung cancer via anti-angiogenesis.
包含体外细胞实验(A549、HUVECs共培养)、体内裸鼠移植瘤模型、m6A测序与RNA测序等多层级验证,并进行了功能(METTL3敲低/过表达)和机制验证。
A549细胞系 HUVECs BALB/c裸鼠移植瘤模型
细胞系:A549(人肺腺癌细胞系) 动物模型:8周龄雄性BALB/c裸鼠,皮下接种A549细胞 给药方案:恩度和顺铂瘤周注射,剂量均为3 mg/kg,联合组6 mg/kg(3+3 mg/kg),每6天一次,共3次 对照组:0.9%无菌氯化钠溶液5 mL/kg,共3次 检测指标:集落形成、迁移、凋亡(流式、TUNEL)、管形成、蛋白和mRNA表达(Western blot、qPCR)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估恩度联合顺铂对NSCLC细胞增殖、迁移和凋亡的影响
使用MTT、集落形成、伤口愈合和流式细胞术检测A549细胞在联合治疗下的活力、增殖、迁移和凋亡变化
验证联合治疗在裸鼠移植瘤模型中的抗肿瘤效果
建立A549细胞皮下移植瘤模型,分组给药后测量肿瘤体积、重量,并进行HE和TUNEL染色
筛选联合治疗后的差异表达基因和差异m6A甲基化基因
提取肿瘤组织RNA,进行RNA测序和m6A测序,分析差异表达基因和差异甲基化基因,并进行联合分析
验证METTL3在联合治疗中的作用
构建METTL3敲低和过表达A549细胞系,与HUVECs共培养,检测细胞活力、迁移、凋亡和管形成能力
验证METTL3在体内对联合治疗效果的影响
使用METTL3敲低和过表达的A549细胞构建裸鼠移植瘤模型,给予联合治疗,检测肿瘤生长、凋亡及血管生成相关蛋白表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing Huafukang Biotechnology Co., LTD. | SCXK (Beijing) 2019-0008 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Ham's F-12K培养基 | Procell Life Science&Technology Co.,Ltd. | -- | |
| 免疫组织化学 | 柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | Gentihold | A1128 | |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| 蛋白酶抑制剂 | Solarbio | A8260 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| FMOD抗体 | Proteintech Group, Inc | 1:1000 | |
| VEGF抗体 | Proteintech Group, Inc | 1:1000 | |
| TGF-β1抗体 | Proteintech Group, Inc | 1:2000 | |
| FGF-2抗体 | Proteintech Group, Inc | 1:1000 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech Group, Inc | 1:1000 | |
| PDGF-B抗体 | Abcam | 1:2000 | |
| TUNEL染色 | 原位凋亡检测试剂盒 | Beijing Sigma Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 细胞转染 | Lipo2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 细胞功能检测 | 结晶紫 | -- | -- |
| 流式细胞术 | FITC标记的Annexin V | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 管形成实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 测序 | NanoDrop s2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| VAHTS Universal V6 RNA-seq文库制备试剂盒 | -- | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | A549细胞使用RPMI 1640+10% FBS+1%青霉素-链霉素;HUVECs使用Ham's F-12K+0.1 mg/mL肝素+0.03-0.05 mg/mL ECGs+10% FBS+1%青霉素-链霉素;培养条件37℃,5% CO2 阅读提示:Methods: Cell and culture conditions |
| 动物模型 | 8周龄雄性BALB/c裸鼠,皮下接种A549肿瘤块(约2 mm3),每组5只;随机分为模型组、恩度组、联合组;给药剂量:恩度和顺铂各3 mg/kg,联合组6 mg/kg,瘤周注射,每6天一次,共3次;模型组给予0.9%氯化钠5 mL/kg 阅读提示:Methods: Nude mouse Tumor xenograft model and drug intervention; Figure legends |
| 药物处理 | 体外实验中,恩度浓度200 μg/mL,顺铂浓度2 μg/mL,处理48小时 阅读提示:Methods: Colony formation test; Results: 图S1 |
| 分子检测 | qPCR引物序列见表1;Western blotting所用抗体及稀释比例:FMOD 1:1000, VEGF 1:1000, TGF-β1 1:2000, FGF-2 1:1000, GAPDH 1:1000, PDGF-B 1:2000 阅读提示:Methods: qPCR, Western blotting; Table 1 |
| 测序分析 | RNA测序和m6A测序使用Illumina NovaSeq 6000平台,PE150;差异表达基因筛选条件|log2FoldChange|≥1, p<0.05;m6A差异峰筛选条件|peak_diff.log2.fc|≥1 阅读提示:Methods: RNA sequencing and m6A sequencing; Results: 转录组分析 |
| METTL3功能验证 | METTL3敲低使用siRNA(3条序列)和过表达载体(pAdTrack-CMV-METTL3)转染A549;共培养体系:A549与HUVECs共培养48小时;管形成实验:HUVECs密度8×10^4细胞/孔,接种后4小时观察 阅读提示:Methods: Adenovirus Infection and transfection, Tube formation capacity assay |