PPP4R1在肝细胞癌中的诊断、预后、药物敏感性和ceRNA网络分析

背景：近期研究报道了蛋白磷酸酶4调节亚基1（PPP4R1）在癌症发展中的作用。然而，其在肝细胞癌（LIHC）中的表达、诊断意义、预后价值和生物学功能尚不清楚。方法：通过分析加州大学圣克鲁兹分校（UCSC）Xena数据库中公开可用的数据，评估了PPP4R1在泛癌中的表达水平。使用受试者工作特征（ROC）曲线评估PPP4R1对肿瘤的诊断价值，而使用Kaplan-Meier生存曲线确定PPP4R1对肿瘤预后的影响，并使用Cox回归分析建立了LIHC的预后模型。此外，使用Spearman相关系数分析了PPP4R1与抗癌药物之间的相关性。使用四个数据库，即miRWalk（mRNA-miRNA相互作用）、MicroT-CDS（mRNA-miRNA相互作用）、LncBase（miRNA-lncRNA相互作用）和RNA相互作用组百科全书（ENCORI），预测PPP4R1的竞争性内源RNA（ceRNA）调控网络。最后，通过实验验证了PPP4R1蛋白水平的表达。结果：研究结果表明，癌组织中PPP4R1的表达水平显著高于癌旁组织（P<0.05）。基于ROC曲线结果（曲线下面积>0.7），PPP4R1对14种肿瘤具有诊断意义。此外，Kaplan-Meier生存图显示PPP4R1对所有五种肿瘤均具有预后意义（P<0.05）。根据Cox回归分析，LIHC患者的预后受病理分期、M分期和PPP4R1的独立影响（P<0.05）。药物敏感性分析显示，PPP4R1的表达水平与氟达拉滨的半抑制浓度（IC50）呈正相关。此外，ceRNA网络预测表明，FGD5反义RNA1（FGD5-AS1）–hsa-miR-22-3p–PPP4R1 ceRNA网络可能促进LIHC的进展。实验结果显示，癌组织中PPP4R1蛋白的表达水平高于癌旁组织。结论：PPP4R1在大多数癌症中具有诊断价值，且PPP4R1的高表达与不良预后、耐药和自然杀伤细胞介导的毒性相关，尤其是在LIHC中。因此，PPP4R1可能是LIHC的预后生物标志物和免疫治疗的潜在靶点。