临床样本和数据库分析
评估NRF2在卵巢癌中的表达及其与转移的关联
从TCGA数据库提取转录组数据分析NFE2L2表达;对51例患者的原发和转移肿瘤进行免疫组化检测NRF2表达。
Synergistic suppression of ovarian cancer by combining NRF2 and GPX4 inhibitors: in vitro and in vivo evidence.
包含体外细胞实验(贴壁、悬浮、3D培养)、机制验证(ROS、4-HNE、凋亡检测)及体内小鼠模型验证,证据层级完整。
HM人卵巢癌细胞系 OVCA429人卵巢癌细胞系 ID8-luc小鼠卵巢癌细胞系 C57BL/6小鼠同基因卵巢癌腹腔转移模型
GPX4抑制剂RSL3浓度梯度(如0.3125-5μM)下细胞活力变化 NRF2抑制剂ML385浓度梯度(如5-50μM)下细胞活力变化 shRNA敲低NRF2后GPX4抑制剂对细胞活力的影响 体内实验中药物剂量:trigonelline 1mpk, ML385 30mpk, clobetasol propionate 0.5mpk, RSL3 3mpk, ML210 5mpk 体内实验中每组小鼠数量(5只对照组,4只处理组)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NRF2在卵巢癌中的表达及其与转移的关联
从TCGA数据库提取转录组数据分析NFE2L2表达;对51例患者的原发和转移肿瘤进行免疫组化检测NRF2表达。
验证NRF2在球体形成中的表达变化及对GPX4抑制剂的敏感性影响
使用HM和OVCA429细胞,通过悬浮培养诱导球体形成,检测NRF2、KEAP1、p62、HO-1、GPX4蛋白和NFE2L2 mRNA水平;通过shRNA敲低NRF2,检测GPX4抑制剂对细胞活力的影响。
评估NRF2抑制剂与GPX4抑制剂联合对贴壁、悬浮和3D培养细胞生长的影响
使用CCK8检测细胞活力,PI染色检测细胞死亡,评估球体形成和3D培养球体生长。
阐明联合治疗诱导细胞死亡的机制
通过流式细胞术检测BODIPY C11染色的脂质ROS水平,免疫荧光检测4-HNE积累,Annexin V-FITC/PI检测凋亡,caspase-3活性检测。
验证联合治疗在同基因小鼠卵巢癌模型中的抗肿瘤效果
将ID8-luc细胞腹腔注射到C57BL/6小鼠,建立腹腔转移模型,分组给药,通过活体成像监测肿瘤生长和腹水产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 8121334 |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1ACS | |
| 青霉素-链霉素液体 | Solarbio | P1400 | |
| 胰蛋白酶 | Solarbio | T1350 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0006C |
| Western blot | 抗Tubulin抗体 | CST | 2125 |
| 抗actin抗体 | Proteintech | 6009-1-Ig | |
| 抗NRF2抗体 | CST | 12721T | |
| 抗GPX4抗体 | CST | 52455S | |
| 抗p62抗体 | Proteintech | 00106301 | |
| 抗KEAP1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| 抗HO-1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| 免疫荧光 | 抗4-HNE抗体 | MyBioSource | MBS808700 |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| 报告基因 | PL-luciferase | Addgene | 21471 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | Biosharp | BL110A |
| Caspase-3活性检测 | GreenNuc™ 活细胞Caspase-3检测试剂盒 | Biosharp | C1168S |
| ROS检测 | BODIPY™ 581/591 C11 | Thermofisher | D3861 |
| 细胞染色 | Hoechst染料 | Beyotime | C1011 |
| 体内成像 | 荧光素 | Beyotime | ST196 |
| 药物处理 | 葫芦巴碱 | yuanye Bio-Technology | B20521 |
| ML385 | yuanye Bio-Technology | S86700 | |
| RSL3 | AdooQ BioScience | A15865 | |
| ML210 | AdooQ BioScience | A20475 | |
| 3D培养 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| 无酚红培养基 | Procell | PM150223 | |
| 细胞染色 | 碘化丙啶 | Beyotime | ST511 |
| 免疫荧光 | 抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime | P0133 |
| RNA提取 | AG RNAex Pro试剂盒 | Accurate Biology | AG21101 |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper) 试剂盒 | Vazyme | R323-01 |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | 1 μg/mL |
| 体内实验 | D-荧光素 | -- | 3 mg/mice |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | Cytek | -- |
| Western blot | 成像系统 | Sally Sue, Proteinsimple | -- |
| 荧光显微镜 | 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | -- |
| 体内成像 | In-vivo Xtreme活体成像系统 | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | HM和OVCA429细胞接种密度(2.0×10^3/孔),药物处理时间(48小时),CCK8孵育时间(2小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assay |
| 球体形成实验 | 6孔板用0.5%琼脂糖包被,细胞接种密度(3000细胞/孔),培养时间(7-10天),结晶紫染色 阅读提示:Materials and Methods: Spheroids formation assay |
| 3D培养 | 细胞在5% Matrigel中重悬,接种密度(300细胞/孔),药物浓度(2×浓度),培养基更换频率(每3天) 阅读提示:Materials and Methods: 3D culture |
| 凋亡检测 | 细胞处理时间(48小时),Annexin V-FITC(5μL)和PI(10μL)用量,孵育条件(37℃10分钟) 阅读提示:Materials and Methods: Apoptosis assay |
| ROS分析 | BODIPY C11浓度(1.5μM),染色时间(30分钟),孵育条件(37℃) 阅读提示:Materials and Methods: ROS analysis |
| Caspase-3活性检测 | 药物处理时间(48小时),染料浓度(5μM),孵育时间(30分钟) 阅读提示:Materials and Methods: Caspase-3 activity assay |
| Western blotting | 蛋白上样量(20-30μg),一抗稀释比例(1:1000),二抗稀释比例(1:5000) 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting analysis |
| shRNA介导的基因沉默 | shRNA序列(shNRF2-1和shNRF2-3),嘌呤霉素筛选浓度(1μg/mL)和处理时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods: shRNA mediated gene silencing |
| 体内实验 | 小鼠品系(C57BL/6)和性别(雌性)及年龄(5周龄),ID8-luc细胞注射数量(5×10^6),给药方案(隔天一次共10次),药物剂量(trigonelline 1mpk, ML385 30mpk, clobetasol propionate 0.5mpk, RSL3 3mpk, ML210 5mpk),每组小鼠数量(对照组5只,处理组4只) 阅读提示:Materials and Methods: The mouse ovarian cancer peritoneal spreading model |