建立烧伤诱导AKI模型
模拟烧伤后AKI,确定损伤高峰期。
SD大鼠背部浸入100°C沸水15秒建立烧伤模型,对照组室温水;在24、48、72小时评估肾损伤。
Augmenting the Endogenous RBM3 Response Protects Against Burn-Induced Acute Kidney Injury by Enhancing Macrophage-Mediated Resolution of Inflammation.
包含体内大鼠烧伤模型、腺病毒过表达功能验证、单细胞RNA测序及体外siRNA敲低和挽救实验等多层级验证。
Sprague-Dawley大鼠烧伤诱导急性肾损伤模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)
烧伤模型:100°C沸水背部浸泡15秒,对照组室温水 腺病毒RBM3过表达:肾实质双侧注射,20μL/肾,滴度1×10^11 PFU/mL,烧伤前3天 RBM3表达检测时间点:24、48、72小时 BMDM分化:20 ng/mL GM-CSF培养7天 siRNA敲低:si-2305 (RBM3)及Slfn4 siRNA,浓度50 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟烧伤后AKI,确定损伤高峰期。
SD大鼠背部浸入100°C沸水15秒建立烧伤模型,对照组室温水;在24、48、72小时评估肾损伤。
评估肾功能和组织病理损伤,并检测RBM3在肾组织及巨噬细胞中的表达变化。
检测血清肌酐和尿素氮,组织H&E染色;通过Western blot、qRT-PCR、免疫组化、流式细胞术检测RBM3表达。
验证增强RBM3表达是否改善烧伤诱导的AKI。
通过腺病毒介导RBM3过表达,48小时后评估肾功能、组织学损伤、细胞凋亡、炎症和巨噬细胞极化。
鉴定RBM3调控巨噬细胞功能的关键下游分子。
对肾组织进行单细胞RNA测序,分析细胞亚群,鉴定差异表达基因,重点关注Slfn4。
验证Slfn4敲低是否模拟RBM3保护效应。
在BMDMs中转染siRNA敲低Slfn4,检测M1/M2标志物表达和胞葬能力。
验证Slfn4是RBM3功能的关键下游效应分子。
在BMDMs中同时敲低RBM3和Slfn4,检测其对巨噬细胞极化和胞葬的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Zoletil 50 | -- | -- |
| 肾功能检测 | 肌酐检测试剂盒 | BioBase Biotech | 70127 |
| 尿素检测试剂盒 | BioBase Biotech | 70124 | |
| 组织学分析 | 伊红 | -- | -- |
| 光学显微镜 | Olympus | BX43 | |
| 凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- |
| 蛋白酶K | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus | BX53 | |
| 免疫组织化学 | RBM3抗体 | Abclonal | A20911 |
| CD68抗体 | Affinity | DF7518 | |
| RP-3抗体 | Affinity | DF13698 | |
| 免疫荧光 | KIM-1抗体 | Proteintech | 30948-1-AP |
| CD86抗体 | Bioss | bs-43589R | |
| CD206抗体 | Affinity | DF4149 | |
| F4/80抗体 | -- | -- | |
| Caspase-3抗体 | -- | -- | |
| Cy3标记二抗 | ABclonal | AS007 | |
| 单细胞测序 | 胶原酶I | Sigma-Aldrich | -- |
| 胶原酶II | Sigma-Aldrich | -- | |
| 中性蛋白酶(Dispase II) | Sigma-Aldrich | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| ACK裂解液 | Miltenyi Biotec | 130-094-183 | |
| 台盼蓝 | -- | -- | |
| Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.1 | 10x Genomics | #1000268 | |
| BMDM培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| Opti-MEM培养基 | -- | -- | |
| 胞葬实验 | 星形孢菌素 | -- | -- |
| PKH26红色荧光染料 | -- | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 氯仿 | -- | -- | |
| mRNA超纯提取试剂盒 | CWBIO | CW0581M | |
| mRNA反转录试剂盒 | Vazyme | R223-01 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Applygen | C1053 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Elabscience | E-BC-K318-M | |
| RBM3抗体 | ABclonal | A20911 | |
| β-肌动蛋白抗体 | TransGen Biotech | HC201 | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23301 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 烧伤诱导AKI模型 | 大鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉方法;背部剃毛;水温100°C,浸泡时间15秒;对照组室温水;观察时间点24、48、72小时 阅读提示:见Materials and Methods 2.2节 |
| 腺病毒介导的RBM3过表达 | 腺病毒载体构建、注射剂量(20μL/肾)、滴度(1×10^11 PFU/mL)、注射方式(肾实质双侧)、时间点(烧伤前3天) 阅读提示:见Materials and Methods 2.3节 |
| 肾功能和组织学评估 | 血清肌酐和尿素氮检测试剂盒及步骤;H&E染色步骤;TUNEL检测步骤;免疫组化抗体及稀释比例;免疫荧光抗体及稀释比例 阅读提示:见Materials and Methods 2.4-2.8节 |
| 单细胞RNA测序 | 组织消化酶浓度、消化时间;细胞活力标准(>85%);上样细胞数(约10000);目标捕获细胞数(8000);测序平台及策略;分析软件及参数 阅读提示:见Materials and Methods 2.9节 |
| BMDM培养和转染 | BMDM获取方法;分化培养基成分(RPMI-1640、10% FBS、20ng/mL GM-CSF);分化时间(7天);siRNA序列及浓度(50nM);转染试剂及步骤 阅读提示:见Materials and Methods 2.10-2.11节 |
| 胞葬作用检测 | Jurkat细胞培养条件;STS浓度(1-2μM)及处理时间(4-6小时);ApoBDs制备步骤;PKH26浓度(2μM);共培养比例(1:10)及时间(1-4小时) 阅读提示:见Materials and Methods 2.12节 |