体外抗病毒活性评估
评估维拉帕米在细胞水平对H1N1病毒的抗病毒活性。
在MDCK细胞中,用不同浓度维拉帕米处理H1N1-UI182感染细胞,通过CCK-8检测细胞活力,Western blot和免疫荧光检测NP表达。
Drug Repurposing of Verapamil for H1N1 Influenza Virus Infection: A Multi-Target Strategy Revealed by Network Pharmacology and Experimental Validation.
包含体外细胞实验(CCK-8、WB、IF)、体内小鼠模型(生存、肺指数、病毒载量)、分子动力学模拟和网络药理学分析,并进行功能验证(NF-κB通路)。
MDCK细胞 BALB/c小鼠(H1N1-UI182致死性感染模型)
体外实验使用MDCK细胞,病毒感染(MOI=0.5) 维拉帕米浓度梯度(3.125、6.25、12.5、25、50 µM) 体内实验使用BALB/c小鼠,维拉帕米剂量(6.25、3.125、1.5625 mg/kg/天) 给药方式:腹腔注射(i.p.) 生存率和体重监测至14天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估维拉帕米在细胞水平对H1N1病毒的抗病毒活性。
在MDCK细胞中,用不同浓度维拉帕米处理H1N1-UI182感染细胞,通过CCK-8检测细胞活力,Western blot和免疫荧光检测NP表达。
评估维拉帕米在致死性H1N1感染小鼠模型中的保护作用。
BALB/c小鼠感染H1N1-UI182后,给予不同剂量维拉帕米处理,监测体重和生存率,并分析肺指数、肺组织病理、病毒载量和炎症因子表达。
比较维拉帕米预治疗、后治疗及预+后联合治疗对致死性H1N1感染小鼠的效果。
BALB/c小鼠感染H1N1-UI182,分别给予维拉帕米预治疗、后治疗或联合治疗,监测体重、生存率、肺病变和NP表达。
预测维拉帕米与L型钙通道亚基的结合模式和动态相互作用。
使用PDB结构6JPA,通过CDOCKER打分评价结合构象,进行100ns分子动力学模拟,分析RMSD、RMSF、Rg、氢键和结合自由能。
预测维拉帕米治疗H1N1的潜在多靶点和信号通路。
通过SwissTargetPrediction和GeneCards数据库获取维拉帕米靶点与H1N1疾病靶点,取交集后构建PPI网络并进行KEGG和GO富集分析。
验证维拉帕米对NF-κB通路和炎症因子表达的影响。
通过Western blot检测肺组织中p65、p-p65及炎症因子(IL-6、IL-10、IL-1β、TNF-α)表达,qPCR和ELISA检测mRNA和蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | 10438026 | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0039 |
| 药物处理 | 维拉帕米 | MCE | 52-53-9 |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3569 |
| 磷酸盐缓冲液 | Solabio | P1020 | |
| 曲拉通X-100 | Beyotime | P0096 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | 9048-46-8 | |
| 抗甲型流感病毒核蛋白抗体 | GeneTex | GTX125989 | |
| FITC标记二抗 | Bioss | bs-0295G-FITC | |
| Western blot | NP抗体 | Abcam | ab104870 |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab6276 | |
| IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| IL-10抗体 | CST | D13A11 | |
| IL-6抗体 | CST | D5W4V | |
| IFN-β抗体 | CST | D2J1D | |
| p65抗体 | CST | D14E12 | |
| p-p65抗体 | CST | 93H1 | |
| 山羊抗兔IgG | Beyotime | A0208 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Beyotime | A0216 | |
| RNA提取 | HiPure通用RNA提取试剂盒 | Magen | R4130-03 |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR047A |
| ELISA | 小鼠细胞和趋化因子ELISA检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010S | |
| 分子动力学模拟 | AlphaFold3 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外实验 | 细胞系:MDCK;病毒株:H1N1-UI182;维拉帕米浓度梯度(3.125-50 µM);感染复数(MOI=0.5);检测时间点(36和48小时) 阅读提示:参见Methods第4.1、4.2节及Figure 1图注 |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c)、年龄(6-8周)、体重(15-20g);病毒接种途径(鼻内);维拉帕米剂量(高/中/低);给药途径(腹腔注射);给药时间(感染前2天预给药,感染后5天);样本量(n=10/组) 阅读提示:参见Methods第4.4.1节及Figure 2图注 |
| 给药方案比较 | 给药方案(pre、post、pre+post);维拉帕米剂量(6.25 mg/kg/天);给药途径(腹腔注射);监测时间(14天) 阅读提示:参见Methods第4.4.2节及Figure 5图注 |
| 分子动力学模拟 | 靶蛋白结构(PDB ID: 6JPA);力场参数;模拟时间(100 ns);温度(300 K);压力(1 atm) 阅读提示:参见Methods第4.5节 |
| 网络药理学 | 数据库版本(SwissTargetPrediction、GeneCards、STRING、Cytoscape、DAVID);阈值(概率>0.1,置信度0.4) 阅读提示:参见Methods第4.6节 |