临床样本分析
验证子宫内膜炎组织中巨噬细胞M1极化及炎症因子表达情况。
收集健康及子宫内膜炎奶牛子宫内膜组织,通过免疫荧光、qPCR和IHC检测iNOS、Arg1及IL-1β、IL-6、TNF-α的表达。
Exosomal lncRNA OTUD6B-AS1 as a pathogenic nanocarrier promotes inflammatory macrophage polarization in endometritis via a targetable ceRNA circuit.
包含临床组织样本验证、体外细胞模型(EECs和巨噬细胞)、外泌体功能实验、RNA-seq、机制验证(ceRNA、双荧光素酶、RIP)及多个独立证据层级。
原代牛子宫内膜上皮细胞(EECs) 牛巨噬细胞系BoMac 产后荷斯坦奶牛子宫内膜组织(健康与子宫内膜炎) HEK293T细胞
LPS浓度:100 μg/mL,处理EECs 24小时 外泌体分离:超速离心100,000×g,70分钟 外泌体处理巨噬细胞剂量:以等颗粒数归一化 Notch2抑制剂DAPT预处理巨噬细胞1小时 GW4869浓度:10 μM抑制EECs外泌体释放
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证子宫内膜炎组织中巨噬细胞M1极化及炎症因子表达情况。
收集健康及子宫内膜炎奶牛子宫内膜组织,通过免疫荧光、qPCR和IHC检测iNOS、Arg1及IL-1β、IL-6、TNF-α的表达。
建立LPS诱导的EEC损伤模型并分离纯化外泌体。
从健康奶牛子宫组织分离原代EECs,用LPS处理诱导损伤,通过超速离心提取外泌体,并用TEM、NTA、Western blotting和流式细胞术进行鉴定。
探究LPS促进外泌体释放的分子机制。
检测EECs中外泌体相关基因表达,敲低ATG16L1等基因观察外泌体分泌变化,并验证AKT/ATG16L1通路。
验证EECs来源外泌体是否诱导巨噬细胞M1极化。
将外泌体与巨噬细胞共培养,检测NF-κB磷酸化、iNOS和Arg1表达;Transwell共培养和GW4869处理验证外泌体的作用。
寻找介导外泌体促炎作用的关键lncRNA。
对外泌体RNA进行测序,筛选差异表达lncRNA,并通过qPCR验证;RNase A和Triton X-100处理确认lncRNA被包裹于外泌体内。
证明lncRNA OTUD6B-AS1是外泌体诱导巨噬细胞M1极化的必要且充分条件。
在巨噬细胞中过表达或敲低lncRNA OTUD6B-AS1,检测M1/M2标志物;敲低EECs中lncRNA OTUD6B-AS1后提取外泌体处理巨噬细胞,观察极化变化。
阐明lncRNA OTUD6B-AS1/miR-128/Notch2轴的ceRNA调节机制。
通过双荧光素酶报告实验、RNA pull-down、Ago2 RIP验证lncRNA与miR-128及Notch2的靶向关系;共转染miR-128 mimic或抑制剂及DAPT处理验证信号轴。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | HYcezmbio | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 外泌体分离 | 链霉蛋白酶 | Sigma | -- |
| PKH67染料 | Beyotime | -- | |
| GW4869 | Sigma | -- | |
| 外泌体RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 外泌体表征 | FITC标记的抗CD81抗体 | BD Pharmingen | -- |
| 鲎试剂内毒素检测 | -- | -- | |
| Nanosight NS300纳米颗粒分析仪 | Malvern | -- | |
| 细胞处理 | LY294002 | -- | -- |
| 转染 | 小干扰RNA | GenePharma | -- |
| 过表达质粒 | GenePharma | -- | |
| miR-128模拟物 | GenePharma | -- | |
| miR-128抑制剂 | GenePharma | -- | |
| RNA分析 | TRIzol试剂 | Vazyme | -- |
| PerfectStart Green qPCR预混液 | TRANS | -- | |
| Western blotting | PVDF膜 | -- | -- |
| 抗TSG101抗体 | Genuin Biotech | 51942 | |
| 抗CD81抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-18877 | |
| 抗AKT抗体 | Abcam | AB81283 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Abcam | AB179463 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Abcam | AB32536 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| 抗Notch2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-51869 | |
| 抗RBP-Jκ抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271128 | |
| 抗β-actin抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| 免疫荧光 | 抗iNOS抗体 | Proteintech | 18985-1-AP |
| 抗Arg1抗体 | Proteintech | 18985-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG | Bioss | bs-0295G | |
| 山羊抗小鼠IgG | Bioss | bs-0296Gs | |
| 双荧光素酶报告实验 | psiCHECK-2载体 | Promega | -- |
| RNA pull-down和RIP | RNA免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗Ago2抗体 | -- | -- | |
| FISH | RNA FISH试剂盒 | GenePharma | -- |
| 外泌体标记 | 外泌体标记追踪试剂盒 | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 奶牛数量n=5,产后21-60天,中位胎次5(范围4-6),健康与子宫内膜炎对照 阅读提示:Materials and methods - Animal sample collection (2.1) |
| 细胞培养 | 原代EECs分离方法(1% pronase消化)、BoMac细胞培养条件(DMEM+10% FBS) 阅读提示:Materials and methods - Endometrial epithelial cell and macrophage culture (2.2) |
| 外泌体分离与鉴定 | 超速离心参数(100,000×g,70 min,4°C)、LPS浓度(100 μg/mL 24h)、外泌体标记物(CD81, TSG101)、内毒素检测 阅读提示:Materials and methods - Isolation and characterization of EECs-Derived exosomes (2.3) |
| 外泌体处理巨噬细胞 | 外泌体剂量以粒子数归一化、共培养时间24h、PKH67标记检测摄取 阅读提示:Materials and methods - Cell treatments (2.6) 和 Results 3.4 |
| 机制验证 | miR-128 mimic/抑制剂浓度、siRNA浓度(50 nM, 12h)、DAPT浓度及预处理时间(1h)、双荧光素酶报告实验条件 阅读提示:Materials and methods - Cell treatments (2.6), miRNA mimic/inhibitor (2.10), Luciferase reporter assay (2.11) |