鉴定SjD中Nrip1表达上调
筛选SjD发病中的关键调控因子
对SjD小鼠模型(NOD和OVX)的颌下腺进行RNA-seq,通过GSEA和重叠分析鉴定NRIP1,并在临床样本和细胞模型中验证表达。
NRIP1 disrupts ERα signal in Sjögren's disease via AQP5 suppression and MYC-driven salivary dysfunction.
包含细胞模型、两种小鼠模型、患者样本、RNA-seq/scRNA-seq/ChIP-seq、Co-IP、ChIP、双荧光素酶报告基因、分子对接及功能验证(凋亡、免疫、代谢)等多个独立证据层级。
A253上皮细胞系 NOD小鼠模型 OVX小鼠模型 Nrip1-KO/OVX小鼠 干燥综合征患者唾液腺活检样本
A253细胞中NRIP1过表达或敲低处理 IFN-γ浓度为100 ng/ml处理48小时模拟炎症模型 E2(10 nM)和氟维司群(1 μM)共处理模拟雌激素缺乏模型 小鼠分组:sham、OVX、Nrip1-KO/OVX,观察12周 抗SSA/SSB抗体水平检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选SjD发病中的关键调控因子
对SjD小鼠模型(NOD和OVX)的颌下腺进行RNA-seq,通过GSEA和重叠分析鉴定NRIP1,并在临床样本和细胞模型中验证表达。
确认NRIP1与ERα在SjD中形成复合物
通过免疫荧光、Co-IP、分子对接和STRING数据库分析,验证NRIP1与ERα的相互作用和共定位。
确定NRIP1在SjD发病中的关键作用
使用Nrip1-KO/OVX小鼠,测量唾液分泌、饮水、免疫浸润、自身抗体水平等。
阐明NRIP1-ERα复合物对下游靶基因的调控机制
通过ChIP-seq、ChIP、双荧光素酶报告基因、免疫荧光、Western blot等,检测NRIP1-ERα对AQP5和MYC启动子结合及表达的影响。
探索MYC下游效应
通过sh-MYC敲低A253细胞,检测凋亡、免疫和代谢相关蛋白表达变化。
提供NRIP1破坏E2-ERα信号的结构基础
使用AutoDock和AlphaFold3进行分子对接,分析NRIP1、E2与ERα的结合能和结合位点。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Onco Information Technology | -- |
| 胎牛血清 | Angke Information Technology | -- | |
| 药物处理 | 雌二醇 | Baoji Herbest Bio-Tech | -- |
| 干扰素γ | Guangzhou Ruigan Bio-Tech | -- | |
| 氟维司群 | MCE | -- | |
| RT-qPCR | 总RNA提取试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- |
| 实时荧光定量PCR试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- | |
| RT-qPCR引物 | Sangon Biotech | -- | |
| Western blot | 小鼠抗AQP5抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 小鼠抗ERα抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 小鼠抗NRIP1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 兔抗MYC抗体 | ABclonal | -- | |
| 兔抗BAX抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗LTF抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗CASP7抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗IKBKG抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗PLA2G7抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗RCN1抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗DAB2IP抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗CFLAR抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗HMG20A抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗S100A1抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗GLANT4抗体 | Bioss | -- | |
| 兔抗STX4抗体 | Solarbio | -- | |
| 小鼠抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| HRP偶联二抗 | Bioss | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | 荧光素酶报告基因检测试剂 | Promega | -- |
| 免疫共沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Beyotime | -- |
| 染色质免疫沉淀 | 染色质免疫沉淀试剂盒 | ABclonal | -- |
| 动物实验 | ICR小鼠 | Hua Fukang Biotechnology | -- |
| NOD小鼠 | Hua Fukang Biotechnology | -- | |
| Nrip1敲除小鼠 | Cyaye Biotechnology | -- | |
| 测序 | HiSeq测序平台 | Illumina | -- |
| ChIP-seq | 抗ERα抗体(兔多克隆) | Abcam | ab???? |
| 测序 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
| 细胞培养 | 脂质体2000 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL3-AQP5启动子质粒 | -- | -- |
| pGL3-MYC启动子质粒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | A253细胞系来源和培养条件(RPMI 1640含10% FBS,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 细胞模型建立 | IFN-γ浓度100 ng/ml处理48小时;E2浓度10 nM和氟维司群浓度1 μM共处理 阅读提示:Results, Figure 2j, and Materials and methods |
| 动物模型 | ICR和NOD小鼠年龄、性别、体重;OVX和Nrip1-KO/OVX小鼠构建;观察周期12周 阅读提示:Materials and methods, Animal studies |
| 共免疫沉淀 | 裂解液和Protein G-琼脂糖珠来源;抗体孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Co-IP assay |
| ChIP分析 | 抗ERα抗体;ERE位点引物序列 阅读提示:Materials and methods, ChIP assay |