sEV的分离与表征
获取并验证胚胎干细胞来源的sEV。
超速离心法提纯sEV,TEM、DLS、Western blot表征形态、粒径和标志蛋白。
Small extracellular vesicle-integrated by herbal hydrogels for spatiotemporal immunomodulation and neurovascular repair following traumatic brain injury.
包含材料表征、体外细胞验证、TBI小鼠模型、转录组学及多维度功能验证。
小鼠TBI模型(CCI诱导) HUVECs Bend.3 BV2小胶质细胞
TBI模型:C57BL/6J雄性小鼠,CCI参数(速度5.0 m/s,深度1.5 mm,停留80 ms) 治疗分组:Sham、TBI、GA-gel、Free sEV、EG-gel,局部注射20 μL sEV剂量:EG-gel含10 μg sEV 行为学测试:NSS、抓绳、foot-fault,术后1、3、7天 转录组学:术后第3天,每组6只,DEG标准(FC≥1.5,p<0.05,q<0.05)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并验证胚胎干细胞来源的sEV。
超速离心法提纯sEV,TEM、DLS、Western blot表征形态、粒径和标志蛋白。
制备EG-gel并验证共组装机制及物理化学性质。
将GA溶于0.1 M PBS(80°C),冷却至37°C加入sEV(体积分数1/4),形成EG-gel;通过SEM、FT-IR、Raman、UV-Vis、XRD等表征结构。
评估EG-gel的机械性能和可注射性。
应变扫描、阶跃应变恢复、频率扫描、时间扫描和流动曲线测试。
评估EG-gel的缓释和降解特性。
释放GA和sEV,监测7天内的累积释放和降解率。
评估EG-gel在脑内的滞留和生物分布。
在CCI小鼠模型中注射DiR标记的sEV或EG-gel,进行荧光成像。
评估EG-gel对TBI小鼠神经功能和病理的改善作用。
行为学测试、HE/Nissl染色、TUNEL、AQP4免疫荧光、IgG染色。
探索EG-gel治疗TBI的分子机制。
对损伤周围皮层进行mRNA测序,分析DEGs、KEGG和GO富集。
验证EG-gel的促血管生成和抗炎作用。
HUVECs管形成实验、Bend.3划痕实验、BV2细胞炎症模型。
验证EG-gel在动物水平的抗炎和促神经血管修复作用。
ELISA检测血清炎症因子和VEGF,免疫组化检测IL-6、TNF-α、IL-1β,免疫荧光检测HMGB1、GFAP、Iba-1、NeuN、β3-tubulin、GAP43、CD31。
评估EG-gel的体内安全性和生物相容性。
肿胀实验、溶血实验、体重监测、肝肾功能指标、组织病理学检查、体内分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 材料制备 | 甘草酸 | Yuanye Bio-Technology | S24734 |
| 溴化钾 | Yuanye Bio-Technology | S24048 | |
| sEV分离 | Amicon®超滤管 | Millipore | -- |
| 体内成像 | DiR | Yeasen Biotechnology | 40757ES25 |
| 组织学 | 伊红 | Servicebio | G1001 |
| 缓冲液 | 磷酸盐缓冲液粉末 | Servicebio | G0002 |
| 抗原修复 | 20×柠檬酸抗原修复缓冲液(pH 6.0) | Servicebio | G1202 |
| 透化 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| 封闭 | 牛血清白蛋白V | Solarbio | A8020 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | PM150210B |
| 胎牛血清 | Cellmax | SA211.02 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 内皮细胞培养基 | Sciencell | 1001 | |
| 管形成实验 | 基质胶 | BD Biosciences | 354230 |
| 炎症诱导 | 脂多糖 | Sigma | L4391-1 MG |
| 白细胞介素-4 | Sangon Biotech | C600050 | |
| 免疫荧光 | 抗iNOS抗体 | Abcam | Ab178945 |
| CD206抗体 | Cell Signaling Technology | E6TSJ | |
| 免疫组化 | 抗IL-6抗体 | Bioss | bs-0782R |
| 抗TNF-α抗体 | ImmunoWay | YT4689 | |
| 抗IL-1β抗体 | AiFang biological | AF02479 | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP抗体 | Cusabio | MA009369AOm |
| 抗Iba-1抗体 | Cell Signaling Technology | 17198 | |
| 抗HMGB1抗体 | Cell Signaling Technology | 3935 | |
| 抗NeuN抗体 | Cell Signaling Technology | 24307 | |
| 抗β3-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 45058 | |
| 抗GAP43抗体 | Cell Signaling Technology | 8945 | |
| 抗CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 77699 | |
| Alexa Fluor® 488 AffiniPure 驴抗小鼠IgG | Jackson Immunoresearch | 715-155-150 | |
| Cy™3 AffiniPure 驴抗兔IgG | Jackson Immunoresearch | 711-165-152 | |
| 组织学 | 尼氏染色液 | Servicebio | G1036 |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Meilunbio | MA0224 |
| 免疫荧光 | 抗荧光淬灭封片剂(含DAPI) | Beyotime Biotechnology | P0131 |
| 免疫组化 | 聚合物HRP抗兔二抗试剂盒 | AiFang biological | AFIHC003 |
| DAB显色试剂盒 | ZSGB-BIO | ZLI-9019 | |
| RNA提取 | RaPure总RNA提取试剂盒 | Magen | MD021 |
| 逆转录 | RNA逆转录试剂盒 | TaKaRa | RR047A |
| qPCR | ChamQ™通用SYBR® qPCR预混液 | Vazyme | Q711 |
| IgG染色 | 多聚体HRP抗小鼠IgG试剂盒 | Boster Biological Technology | SV0001 |
| ELISA | 小鼠IL-6 MPCLIA试剂盒 | Boster Biological Technology | GLM0004 |
| SEM | Mini Coater镀膜仪 | SuPro Instruments | -- |
| MIRA LMS扫描电子显微镜 | TESCAN | -- | |
| UV-Vis | GENESYS 180分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| XRD | SmartLab SE X射线粉末衍射仪 | Rigaku | -- |
| FT-IR | Nicolet iS20傅里叶变换红外光谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NMR | Ascend TM 600 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| 拉曼光谱 | LabRAM HR Evolution拉曼光谱仪 | Horiba | -- |
| 流变学 | 旋转流变仪 | TA Instruments | -- |
| 动物实验 | TBI-0310撞击器 | Precision Systems and Instrumentation | -- |
| 体内成像 | IVIS Spectrum活体成像系统 | Bio-Tek | -- |
| 细胞培养 | 荧光显微镜 | Carl Zeiss | AXI0 IMAGER M2 |
| 管形成实验 | 倒置显微镜 | Leica | DMi8 |
| RNA-seq | NanoDrop ND-1000分光光度计 | NanoDrop | -- |
| KAPA链特异性RNA-seq文库构建试剂盒 | Roche | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 血液生化 | 全自动生化分析仪 | Chemray | 800 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| sEV分离 | 超速离心参数、sEV量 阅读提示:Materials and Methods: Isolation and purification of sEV |
| EG-gel制备 | GA浓度(14 wt%)、sEV体积分数(1/4) 阅读提示:Materials and Methods: Synthesis of the hydrogel |
| TBI模型 | 小鼠品系、性别、年龄、CCI参数(速度、深度、停留时间) 阅读提示:Materials and Methods: TBI model construction |
| 治疗方案 | 分组、注射体积、sEV剂量(10 μg) 阅读提示:Materials and Methods: Drug administration and treatment |
| 行为学测试 | 测试时间点(1、3、7天)、测试指标 阅读提示:Materials and Methods: Behavioral Tests |
| 转录组学 | 样本采集时间(第3天)、每组样本量(n=6)、DEG筛选标准 阅读提示:Materials and Methods: mRNA sequencing |