患者分组
根据MRS谱脂质峰将患者分为pLP和非pLP组
由经验丰富的技术人员根据MRS谱中1.3 ppm处最高峰判定,患者进行两次MRS扫描,结果不一致时进行第三次扫描。
Magnetic Resonance Spectroscopy Lipids Peak May Serve as a Potential Biomarker for Back Pain in Intervertebral Disc Degeneration: An Integrative Metabolomics and Proteomics Study Investigating the Role of the Lipid Droplets-Interleukin-17 Inflammatory Axis.
研究包含患者样本的MRS分组、脂质组学、蛋白质组学、免疫组化、ELISA和功能抑制实验,多个证据层级且包含功能验证。
pLP组患者髓核组织 非pLP组患者髓核组织 原代髓核细胞 BODIPY-high/低组分离的髓核细胞
MRS脂质峰分组为pLP和非pLP,依据1.3 ppm最高峰,双侧扫描,必要时第三次扫描 髓核组织取自接受椎间盘切除术和融合术的患者 原代髓核细胞培养条件:DMEM,10%胎牛血清,100单位/mL青霉素和100 mg/mL链霉素,37°C,5% CO2 脂质组学样品:1×10^6个细胞,BODIPY染色和流式分选 免疫组化染色阳性细胞率:每张切片5个视野,每个视野计数200个有核细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
根据MRS谱脂质峰将患者分为pLP和非pLP组
由经验丰富的技术人员根据MRS谱中1.3 ppm处最高峰判定,患者进行两次MRS扫描,结果不一致时进行第三次扫描。
验证pLP组髓核细胞内脂质积聚
提取原代髓核细胞脂质,通过LC-MS/MS进行脂质组学分析,使用PCA和OPLS-DA模型区分组间差异,鉴定差异表达脂质。
鉴定脂滴富集髓核细胞中差异表达蛋白和通路
通过流式分选BODIPY-high和BODIPY-low细胞,进行DIA蛋白质组学分析,并进行KEGG通路富集分析。
确认脂滴在细胞内的存在
使用透射电镜观察细胞内脂滴,并通过TG检测试剂盒测定相对甘油三酯含量。
验证pLP组IL-17炎症通路激活及其下游炎症因子的表达
通过免疫组化染色检测人髓核组织中IL-17、IL-6、IL-1β、TNF-α和PGE2的表达;在BODIPY-high和pLP组细胞中使用IL-17抑制剂Secukinumab处理后检测炎症因子表达变化。
评估IL-17表达和脂质含量与患者报告症状的关系
使用Pearson相关分析检验术前VAS-背部、VAS-腿部和ODI评分与IL-17阳性细胞率和相对TG含量的相关性;使用多元线性回归模型分析变量对症状的贡献。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MRS分析 | GE Discovery MR 750W 3.0T磁共振扫描仪 | GE | -- |
| LCModel(版本6.2) | -- | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 脂质组学 | Q Exactive Plus质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| UHPLC Nexera LC-30A超高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- | |
| Waters ACQUITY PREMIER CSH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| LipidSearch软件4.1版 | Thermo Scientific | -- | |
| 蛋白质组学 | 高效液相色谱系统(Rigol L3000) | Rigol | -- |
| EASY-nLC 1200超高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Q Exactive HF-X质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Proteome Discoverer 2.2 | Thermo Scientific | -- | |
| ELISA检测 | IL-6、IL-1β、TNF-α、PGE2的ELISA试剂盒 | Solarbio | -- |
| 流式分选 | BODIPY 493/503荧光染料 | Beyotime | -- |
| TG测定 | 甘油三酯检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 免疫组化 | 抗IL-17抗体 | Servicebio | GB11110 |
| 抗IL-6抗体 | Servicebio | GB11117 | |
| 抗IL-1β抗体 | Servicebio | GB11113 | |
| 抗TNF-α抗体 | Servicebio | GB11188 | |
| 抗PGE2抗体 | Bioss | bs-2639R | |
| 透射电镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MRS分析 | MRS分组标准:1.3 ppm峰高最高判为pLP;两次扫描不一致时第三次扫描 阅读提示:Methods section 3 (MRS Analysis) and Study Group |
| 患者纳入 | 纳入标准:慢性腰痛>3个月,诊断为椎间盘突出、椎管狭窄或退变性腰椎滑脱,接受单节段椎间融合手术,年龄18-80岁;排除标准:腰椎手术史、骨折、侧凸>15度、骨质疏松等 阅读提示:Methods section 1 (Patient and Samples) |
| 原代髓核细胞培养 | 培养条件:DMEM,10%胎牛血清,100 U/mL青霉素,100 mg/mL链霉素,37°C,5% CO2 阅读提示:Methods section 1 (Patient and Samples) |
| 脂质组学 | 细胞数量:1×10^6;提取流程:200 μL水、20 μL内标、800 μL MTBE、240 μL甲醇,涡旋、超声、14,000 g离心15分钟 阅读提示:Methods section 5 (Lipidomics) |
| 蛋白质组学 | 细胞分选:BODIPY染色,流式分选;DIA分析条件:色谱柱、梯度、质谱参数 阅读提示:Methods section 6 (Proteomics) |
| 免疫组化染色 | 组织固定、切片厚度5 μm;抗体稀释度:IL-17 1:200, IL-6 1:400, IL-1β 1:400, TNF-α 1:200, PGE2 1:200 阅读提示:Methods section 11 (Immunohistochemical Staining) |