构建野生型及突变型HBV质粒和S蛋白表达质粒
建立实验工具以研究C138R突变对HBsAg功能的影响。
构建全长HBV基因组质粒HBV 1.3及其突变体HBV C138R,并构建HA标签的S蛋白表达质粒sWT及C138R突变体sC138R,以及C107R、C124R、C147R突变体用于研究其他二硫键的作用。
Dual defects in HBsAg antigenicity and secretion caused by the C138R mutation in the S gene trigger occult hepatitis B virus infection.
包含细胞水平(Huh7、HepG2、HEK293T)功能验证、HBV DNA及RNA定量、Western blot和免疫荧光,以及小鼠体内模型验证,机制涉及二硫键和二聚体形成。
Huh7细胞系 HepG2细胞系 HEK293T细胞系 BALB/c小鼠
HBV 1.3质粒(野生型)和HBV C138R突变质粒 HA标签的S蛋白表达质粒(sWT和sC138R) 转染试剂Lipofectamine 3000 细胞类型(Huh7、HepG2、HEK293T) 体内模型:BALB/c小鼠(6-8周龄,雄性)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立实验工具以研究C138R突变对HBsAg功能的影响。
构建全长HBV基因组质粒HBV 1.3及其突变体HBV C138R,并构建HA标签的S蛋白表达质粒sWT及C138R突变体sC138R,以及C107R、C124R、C147R突变体用于研究其他二硫键的作用。
在体外细胞模型中评估C138R突变对HBsAg表达、分泌和抗原性的影响。
将野生型或突变型质粒转染至Huh7、HepG2和HEK293T细胞,转染后48小时收集细胞和上清进行检测。
评估C138R突变对HBsAg表达的影响以及是否影响其他病毒复制步骤。
通过化学发光、ELISA、Western blot和免疫荧光检测HBsAg水平;通过定量PCR检测HBV RNA和DNA;通过化学发光和Western blot检测HBeAg和HBcAg。
区分C138R突变对HBsAg抗原性的影响和对分泌的影响。
使用HA标签的S蛋白质粒,通过检测细胞内和细胞外的HA和HBsAg水平,以及计算EC/IC比率,评估抗原性和分泌效率。
验证C138R突变是否破坏关键二硫键并导致异常二聚体形成,以及这些异常是否影响抗原性和分泌。
构建C107R、C124R和C147R突变体,破坏特定的二硫键,用非还原性WB检测二聚体形成,用还原性WB检测单体水平,并用AlphaFold 3预测SHBs二聚体构象。
在动物体内验证C138R突变对HBsAg抗原性、分泌和免疫原性的影响。
通过尾静脉高压注射将HBV 1.3或HBV C138R质粒注入BALB/c小鼠,在不同时间点采集血清和肝脏组织,检测HBsAg、抗-HBs水平和肝内HBsAg表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000-015 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 蛋白检测 | 抗-HBs抗体 | Bioss | bs-1557G |
| 抗HA标签抗体 | CST | C29F4 | |
| 抗HBcAg抗体 | Abcam | ab8637 | |
| GAPDH抗体 | Huabio | ET1601-4 | |
| RNA检测 | SYBR Premix Ex Taq | Vazyme | Q311 |
| DNA检测 | 乙型肝炎病毒核酸测定试剂盒 | Shengxiang | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒1 | InTec PRODUCTS, INC. (Xiamen) | -- |
| ELISA试剂盒2 | Beijing Wantai Biological Pharmacy Enterprise Co., Ltd. | -- | |
| ELISA试剂盒3 | Shanghai Rongsheng Biotech Co., Ltd. | -- | |
| ELISA试剂盒4 | Shanghai Kehua Bio-Engineering Co., Ltd. | -- | |
| 仪器设备 | Abbott ARCHITECT i2000SR全自动免疫分析仪 | Abbott | -- |
| 荧光显微镜 | ZEISS正置荧光显微镜 | ZEISS | -- |
| 结构预测 | AlphaFold 3 | -- | -- |
| 结构可视化 | PyMOL | -- | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 质粒构建 | HBV 1.3质粒(基因型B,adw2亚型,GenBank: AY220698.1)及其C138R突变质粒;HA标签的sWT和sC138R质粒 阅读提示:材料与方法中“Construction of various plasmids”部分 |
| 细胞培养与转染 | 细胞系(Huh7、HepG2、HEK293T);培养条件(DMEM+10%FBS+1%青霉素-链霉素,37°C,5% CO2);转染条件(1.5μg DNA + 3μL Lipofectamine 3000,Opti-MEM中孵育15分钟,6小时后换液,继续培养48小时) 阅读提示:材料与方法中“Cell culture and transfection”部分 |
| HBsAg抗原性和分泌检测 | 使用Abbott ARCHITECT i2000SR检测HBsAg和HBeAg;使用四种商业ELISA试剂盒检测细胞内和细胞外HBsAg;使用非还原性WB检测二聚体形成;使用还原性WB检测单体表达;计算EC/IC比率评估分泌效率 阅读提示:材料与方法中“Quantification of various viral proteins”部分及图4图例 |
| RNA和DNA检测 | RNA检测使用SYBR Premix Ex Taq,β-actin作为内参;HBV DNA检测使用商业试剂盒(Shengxiang) 阅读提示:材料与方法中“Quantification of intracellular RNA”和“Quantification of HBV DNA”部分 |
| 免疫荧光 | 细胞固定用4%多聚甲醛,透化用0.25% Triton X-100,封闭用1% BSA;一抗孵育过夜(4°C),二抗孵育1小时(室温) 阅读提示:材料与方法中“Immunofluorescence (IF) staining”部分 |
| 动物实验 | 雄性BALB/c小鼠(6-8周龄);尾静脉高压注射10μg质粒(0.1mL/g体重);采样时间点:第1、3、5、7、10、14、21天采血,第3、7、21天取肝脏 阅读提示:材料与方法中“Construction of HBV model in mice”和“Serological testing and liver immunohistochemical detection”部分 |
| 结构预测 | AlphaFold 3预测SHBs二聚体结构;PyMOL可视化 阅读提示:材料与方法中“Analysis of structural characteristics of SHBs dimers”部分 |