临床样本分析
评估BST2在EOC组织中的表达及其与患者预后的关联
从TCGA获取EOC转录组和临床数据,进行免疫浸润分析和生存分析;对31例EOC患者肿瘤组织进行H&E和IHC染色,评估BST2蛋白表达和病理特征。
BST2 Drives Epithelial Ovarian Cancer Progression via Macrophage M2 Polarization, Neural Remodeling, and Immunosuppressive Microenvironment Formation.
结合TCGA数据分析和患者组织IHC验证,细胞系功能实验(增殖、凋亡、迁移/侵袭、巨噬细胞极化共培养)、体内异种移植模型,以及机制研究(IL-4/STAT6通路)。
SKOV3和OVCAR3人上皮性卵巢癌细胞系 THP-1来源的M0巨噬细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 EOC患者肿瘤组织样本
BST2在EOC组织中的表达水平及与预后的关联(TCGA分析及IHC) SKOV3和OVCAR3细胞中BST2的敲低和过表达效率(qRT-PCR和Western blot) 体外功能实验中的细胞增殖(CCK-8)、凋亡(流式)、迁移侵袭(Transwell)条件 体内异种移植模型:细胞接种量、动物分组、肿瘤体积测量和终点检测(IHC、IF) 巨噬细胞极化分析:共培养体系、M1/M2标记物(CD86/CD206)的流式检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估BST2在EOC组织中的表达及其与患者预后的关联
从TCGA获取EOC转录组和临床数据,进行免疫浸润分析和生存分析;对31例EOC患者肿瘤组织进行H&E和IHC染色,评估BST2蛋白表达和病理特征。
验证BST2在EOC细胞系中表达是否上调
通过qRT-PCR和Western blot检测SKOV3、OVCAR3和正常卵巢上皮细胞系IOSE-80中BST2的mRNA和蛋白水平。
探究BST2对EOC细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响
在SKOV3细胞中敲低BST2,OVCAR3细胞中过表达BST2,然后进行CCK-8、集落形成、Transwell、流式凋亡和周期检测。
评估BST2对巨噬细胞极化的影响
将BST2敲低或过表达的EOC细胞与M0巨噬细胞共培养,通过流式检测M1/M2标志物,ELISA检测IL-10、IL-4、CCL22分泌。
验证BST2对肿瘤生长和肿瘤微环境的影响
将BST2敲低或过表达的EOC细胞接种于裸鼠皮下,测量肿瘤体积和重量,IHC检测Ki67、CD163、CD86,免疫荧光检测Nestin和GFAP。
阐明BST2促进M2极化的分子机制
通过qRT-PCR检测免疫相关基因表达,免疫共沉淀验证BST2与IL-4/JAK1的相互作用,并使用STAT6抑制剂和Lipoxin A4进行功能验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | -- | 16561-29-8 |
| 质检 | MycoAlert支原体检测试剂盒 | Lonza | -- |
| 基因操作 | 慢病毒载体LV-0683 | -- | -- |
| 慢病毒载体LV-0684 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Vazyme | -- |
| cDNA合成 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| qRT-PCR | Green Master Mix预混液 | TaKaRa | -- |
| 寡核苷酸引物 | DynaPro Bio | -- | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 流式凋亡 | Annexin V-FITC和碘化丙啶溶液 | Procell | -- |
| 流式周期 | RedNucleus I溶液 | Procell | -- |
| Transwell | 8μm孔径小室 | Corning | -- |
| 结晶紫 | Solarbio | 548-62-9 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | KeyGene Biotech | -- | |
| PVDF膜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗BST2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | -- | |
| ECL底物 | -- | -- | |
| ELISA | IL-10、IL-4、CCL22 ELISA试剂盒 | Beyotime | -- |
| IHC | BST2一抗 | Cell Signaling Technology | -- |
| CD163一抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| CD86一抗 | Bioss | -- | |
| Ki67一抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAB显色试剂盒 | GTVision Detection System/Mo&Rb | -- | |
| 免疫荧光 | 抗NSE抗体 | Servicebio | -- |
| 抗GFAP抗体 | Servicebio | -- | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG二抗 | -- | -- | |
| DAPI | -- | 28718-90-3 | |
| 统计分析 | SPSS统计软件 | -- | -- |
| GraphPad Prism统计软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SKOV3和OVCAR3使用DMEM或RPMI-1640培养基,补充10% FBS,37°C、5% CO2;THP-1培养在含10% FBS和0.05mM 2-巯基乙醇的RPMI-1640中;M0分化用100ng/mL PMA刺激24小时 阅读提示:见Materials and Methods 2.6节 Cell Culture and Authentication |
| 基因操作 | BST2过表达慢病毒载体LV-0683(pLV-EF1a-BST2-CMV-EGFP-T2A-Puro)转导OVCAR3细胞;BST2敲低慢病毒载体LV-0684(pLVX-U6-shRNA(BST2)-CMV-Puro)转导SKOV3细胞;shRNA靶向BST2 mRNA的3'UTR 阅读提示:见Materials and Methods 2.7节 Lentiviral Construction and Transfection,及Supplementary Figure S1 |
| 细胞功能实验 | CCK-8:5×10^3细胞/孔,检测0、24、48、72、96小时;Transwell:6×10^4细胞于无血清培养基,8μm孔径,孵育48小时,结晶紫染色;凋亡检测:Annexin V-FITC/PI染色后用BD流式细胞仪分析;集落形成:超低吸附24孔板培养6天,EVOS成像 阅读提示:见Materials and Methods 2.9-2.13节及Results 3.3节 |
| 巨噬细胞共培养 | THP-1分化M0后与BST2修饰的EOC细胞共培养;流式检测CD86和CD206;ELISA检测IL-10、IL-4、CCL22 阅读提示:见Materials and Methods 2.11、2.15节及Results 3.3节 |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠(4-6周龄,~20g)皮下接种5×10^6细胞/0.1mL PBS在右前腋窝;随机分为4组(n=6):对照SKOV3、SKOV3+BST2 KD、对照OVCAR3、OVCAR3+BST2 OE;每2天记录体重和肿瘤尺寸,体积=0.5×长×宽^2;肿瘤取材后固定、石蜡包埋 阅读提示:见Materials and Methods 2.16节 Tumor Xenografts |
| IHC和免疫荧光 | IHC使用抗BST2(1:2000)、抗CD163(1:500)、抗CD86(1:300)、抗Ki67(1:200)抗体,DAB显色,H-score评分;IF使用抗NSE和抗GFAP(1:200)抗体,FITC二抗(1:2000),DAPI复染 阅读提示:见Materials and Methods 2.18、2.19节及Results 3.4节 |
| 机制研究 | qRT-PCR检测IL-4、STAT6、IL-10、SOCS3、TGFB1、SMAD3、PPARG、CD163、P-P65、IκBα;免疫共沉淀验证BST2与IL-4或JAK1相互作用;STAT6抑制剂AS1517499处理BST2过表达组;Lipoxin A4处理BST2敲低组,检测M2/M1比例和CCL22、IL-10分泌 阅读提示:见Materials and Methods 2.8、2.15节及Results 3.5节及Figure 5 |