构建sodA基因缺失及互补菌株
验证sodA基因的缺失及互补对菌株表型的影响
构建了sodA基因缺失突变株ΔsodA和互补菌株CΔsodA,通过RT-PCR和qPCR验证sodA转录。
SodA promotes immune evasion of Streptococcus suis by suppressing ROS accumulation and GSDMD-mediated mitochondrial disruption in neutrophils.
包含体内小鼠感染模型、体外中性粒细胞实验、NETs定量、ROS检测、线粒体膜电位分析、Western blot及免疫荧光验证,多层次功能与机制验证。
小鼠腹膜感染模型 原代小鼠骨髓中性粒细胞 猪链球菌2型野生型及sodA突变株 互补菌株CΔsodA
小鼠品系:C57BL/6,6周龄,性别匹配;感染剂量1×109 CFU,腹腔注射 细菌菌株:WT SS2 (ZJ081101)、ΔsodA、CΔsodA;培养条件:TSB/TSA含5%新生牛血清 感染复数(MOI):10;共孵育时间2小时 NETs抑制:DNase I处理(100 U/mL) 样本量:每组小鼠3只;体外实验n=3或4(如柱状图所示)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证sodA基因的缺失及互补对菌株表型的影响
构建了sodA基因缺失突变株ΔsodA和互补菌株CΔsodA,通过RT-PCR和qPCR验证sodA转录。
探究sodA对感染早期中性粒细胞募集的影响
小鼠腹腔注射WT或ΔsodA菌株,12小时后收集腹腔灌洗液,用血液分析仪和流式细胞术检测中性粒细胞数量和比例。
检测sodA对中性粒细胞吞噬及胞内细菌存活的影响
将中性粒细胞与WT或ΔsodA共孵育,用庆大霉素杀灭胞外菌,裂解细胞后计数CFU计算吞噬率和胞内存活率。
探究sodA对宿主ROS产生的影响
用DCFH-DA探针检测感染WT、ΔsodA或CΔsodA菌株后中性粒细胞内ROS水平。
验证sodA对NET形成的影响
通过免疫荧光染色(MPO/NE标记)和定量cfDNA及MPO-DNA复合物水平,比较不同菌株诱导的NET形成。
评估sodA对细菌抵抗NETs介导杀伤的影响
中性粒细胞与细菌共孵育,加入DNase I降解NETs,比较有无DNase I时细菌存活率;或用PMA诱导的NETs处理细菌。
探究sodA对线粒体功能和ROS产生的影响
用MitoTracker Red和DCFH-DA染色,流式细胞术和活细胞成像检测线粒体膜电位及ROS水平。
检测sodA对GSDMD激活及线粒体定位的影响
用Western blot检测GSDMD和GSDMD-N表达,用免疫荧光和共聚焦观察GSDMD-N与线粒体共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 胰蛋白胨大豆肉汤 | Oxoid | -- |
| 胰蛋白胨大豆琼脂 | Oxoid | -- | |
| 载体构建 | pSET2载体 | -- | -- |
| 中性粒细胞分离 | Ficoll-Hypaque梯度离心液 | Solarbio | P8550 |
| 细胞活力检测 | 台盼蓝 | -- | -- |
| 细胞处理 | 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | -- |
| NETs诱导 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 流式分析 | PE标记小鼠Ly6G抗体 | eBioscience | 12-5931-81 |
| FITC标记小鼠CD11b抗体 | eBioscience | 11-0112-82 | |
| 线粒体膜电位检测 | MitoTracker Red染料 | Biyotime | -- |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Biyotime | -- |
| cfDNA定量 | PicoGreen DNA定量试剂盒 | Invitrogen | -- |
| MPO-DNA检测 | 小鼠MPO-DNA ELISA试剂盒 | MEIMIAN | -- |
| 免疫荧光 | 抗MPO抗体 | Abcam | EPR20257 |
| 抗中性粒细胞弹性蛋白酶抗体 | BIOSS | bs-6982R | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Abcam | EPR20829-408 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488荧光二抗 | yeasen | 33106ES60 | |
| 细胞核染色 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Solarbio | -- |
| 封片 | 抗荧光淬灭封片剂 | Biosharp | BL701A |
| 显微镜 | Zeiss 880激光共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Western blot | 抗GSDMD/GSDMD-N抗体 | Abcam | ab219800 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 增强化学发光试剂 | Solarbio | -- | |
| 凝胶成像系统 | Tanon | Tanon 4200 | |
| 血液分析 | 全自动血液分析仪 | Mindray | BC-5000 Vet |
| 数据分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | 8.0.2 |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| FlowJo软件 | -- | -- | |
| CytExpert软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌菌株和培养 | 野生型(WT)SS2菌株ZJ081101、sodA缺失突变株ΔsodA和互补株CΔsodA的来源;培养条件为TSB/TSA含5%新生牛血清;互补株构建采用pSET2载体电转化 阅读提示:见Materials and Methods 'Bacterial strains and experimental animals' |
| 小鼠感染模型 | 使用6周龄性别匹配的C57BL/6小鼠;腹腔注射WT和ΔsodA剂量为1×10^9 CFU(500 μL PBS),对照组注射PBS;感染12小时后收集腹腔灌洗液 阅读提示:见Materials and Methods 'Intraperitoneal infection and peritoneal lavage fluid collection' |
| 中性粒细胞分离和培养 | 从6周龄SPF小鼠骨髓中分离;Ficoll-Hypaque梯度离心;细胞活力(>90%)和纯度(>90%)需验证 阅读提示:见Materials and Methods 'Neutrophil isolation and identification' |
| 体外感染实验 | MOI=10;共孵育时间2小时;庆大霉素浓度20 μg/mL;胞内杀菌和吞噬率检测具体步骤 阅读提示:见Materials and Methods 'Phagocytosis rate and intracellular survival rate' |
| NETs杀菌实验 | DNase I浓度100 U/mL;PMA诱导NETs时浓度400 nM,处理4小时;细菌与NETs共孵育1.5小时 阅读提示:见Materials and Methods 'Neutrophils and NETs bactericidal assays' |
| ROS检测 | DCFH-DA浓度50 nM;孵育时间20分钟;荧光测量条件(激发560 nm,发射610 nm);结果归一化到对照组 阅读提示:见Materials and Methods 'Measurement of reactive oxygen species' |
| 线粒体膜电位检测 | MitoTracker Red浓度200 nM;孵育30分钟;流式细胞仪分析 阅读提示:见Materials and Methods 'Assessment of the proportion of neutrophils of PLF and mitochondrial membrane potential by flow cytometry' |
| NETs定量 | cfDNA定量使用PicoGreen试剂盒;MPO-DNA使用ELISA试剂盒(MEIMIAN);详细步骤和荧光测量条件 阅读提示:见Materials and Methods 'Quantification of NETs production' 和 'Measurement of MPO-DNA in cell supernatant' |
| Western blot | 抗体稀释比例:抗GSDMD/GSDMD-N 1:1000,抗β-actin 1:1000,二抗1:10000;使用BCA定量;曝光和灰度分析 阅读提示:见Materials and Methods 'Western blotting' |
| 免疫荧光和共聚焦 | 抗体浓度:抗MPO 1:200,抗NE 1:200,抗GSDMD-N 1:200;二抗1:150;DAPI染色;Zeiss 880显微镜 阅读提示:见Materials and Methods 'Immunostaining and confocal microscopy' |