建立顺铂诱导的AKI动物模型
评估SelH在AKI发病中的作用。
使用SelH敲除(SelH-/-)和野生型(WT)小鼠,腹腔注射顺铂(20 mg/kg,连续3天)建立AKI模型,观察肾损伤指标(HE染色、透射电镜、肾功能指标)。
Selenoprotein H targets MTCH2 to regulate MFN2-dependent mitochondrial quality control to alleviate acute kidney injury.
包含体内动物模型(SelH敲除小鼠CP诱导AKI)、体外细胞模型(HEK293t敲低/过表达)、Co-IP质谱、分子对接及功能验证。
C57BL/6J野生型和SelH基因敲除(SelH-/-)小鼠 HEK293t细胞
SelH敲除小鼠的基因型鉴定方法(PCR和琼脂糖凝胶电泳) CP剂量(20 mg/kg)及给药方式(腹腔注射,连续3天) HEK293t细胞CP处理浓度(筛选后使用20 µM) siRNA敲低浓度(50 nM siSelH,siMTCH2使用#1序列) MFI8和MASM7的干预浓度(文中未明确说明MFI8浓度,MASM7使用1 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SelH在AKI发病中的作用。
使用SelH敲除(SelH-/-)和野生型(WT)小鼠,腹腔注射顺铂(20 mg/kg,连续3天)建立AKI模型,观察肾损伤指标(HE染色、透射电镜、肾功能指标)。
筛选和验证SelH的蛋白质相互作用伙伴。
通过Co-IP结合质谱鉴定SelH相互作用蛋白,利用分子对接预测结合位点,并通过Co-IP和激光共聚焦验证SelH与MTCH2的相互作用。
研究SelH和MTCH2在CP诱导的线粒体质量控制失调和凋亡中的作用。
在HEK293t细胞中敲低或过表达SelH/MTCH2,并用CP刺激,检测氧化应激、线粒体功能、线粒体动力学、线粒体自噬和凋亡指标。
评估SelH/MTCH2对线粒体生物发生、动态、自噬的影响。
检测ATP含量、线粒体膜电位(JC-1)、ROS水平、Mito-SOX、线粒体动态相关蛋白(Drp1、MFN2)、线粒体自噬相关基因和蛋白(PINK1、Parkin、LC3等)的表达。
检测SelH/MTCH2对细胞凋亡的影响。
通过TUNEL染色、AO-EB染色、流式细胞术(Annexin V-FITC/PI)检测凋亡细胞比例,并检测凋亡相关蛋白(Bcl-2、Bax、CytC、Caspase 3、Caspase 9)的表达。
验证氧化应激和MFN2在SelH/MTCH2调控MQC和凋亡中的作用。
使用抗氧化剂NAC抑制ROS,使用MFN2抑制剂MFI8和处理剂MASM7干预,检测对线粒体功能和凋亡的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物基因型鉴定 | 小鼠尾部基因型鉴定试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| PCR扩增 | 2×Taq预混液 | -- | -- |
| 肾功能检测 | 乳酸脱氢酶试剂盒 | -- | -- |
| 血尿素氮试剂盒 | -- | -- | |
| 肌酐试剂盒 | -- | -- | |
| 氧化应激检测 | 过氧化氢酶检测试剂盒 | -- | -- |
| 谷胱甘肽过氧化物酶检测试剂盒 | -- | -- | |
| 超氧化物歧化酶检测试剂盒 | -- | -- | |
| 丙二醛检测试剂盒 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Pricella Life Science & Technology Co., Ltd | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 药物处理 | 顺铂 | -- | -- |
| MFI8 | MedChemExpress | -- | |
| MASM7 | Selleck Chemicals | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 质粒构建 | pcDNA-His或pcDNA-His-SelH质粒 | General Biological Co., Ltd. Anhui, China | -- |
| 蛋白质纯化 | His标签纯化树脂 | Solarbio Science & Technology Co., Lt., Beijing, China | -- |
| Anti-Flag亲和凝胶 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 基因沉默 | 小于扰RNA | GenePharma Biotechnology | -- |
| RNAiMax转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1检测试剂盒 | Biotechnology Co., Ltd | -- |
| 线粒体ROS检测 | Mito-SOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Thermo | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 总RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology Co., Ltd | -- |
| cDNA合成 | cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech Co., Ltd. | -- |
| qPCR反应 | SYBR Green PCR预混液 | TransGen Biotech Co., Ltd. | -- |
| Western blot分析 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PMSF蛋白酶抑制剂 | Beyotime | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 仪器设备 | 酶标仪 | BioTek | -- |
| 透射电子显微镜 | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| QuantGene9600荧光定量PCR仪 | Bioer | -- | |
| Odyssey成像系统 | Li-Cor Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | 抗LC3抗体 | ABclonal | #WL01506 |
| 抗Caspase 3抗体 | ABclonal | #WL04004 | |
| Western blot | 抗Drp1抗体 | Wanleibio | #WL03028 |
| 抗MFN2抗体 | Bioss | #bs-2988R | |
| 抗PGC-1α抗体 | Wanleibio | #WL02254 | |
| 抗PINK抗体 | Wanleibio | #WL04963 | |
| 抗Parkin抗体 | Wanleibio | #WL02512 | |
| 抗P62抗体 | Wanleibio | #WL02385 | |
| 抗LC3抗体 | Wanleibio | #WL01506 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Wanleibio | #WL01556 | |
| 抗Bax抗体 | Wanleibio | #WL01637 | |
| 抗CytC抗体 | Wanleibio | #WL02410 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Wanleibio | #WL04004 | |
| 抗Caspase 9抗体 | Wanleibio | #WL03421 | |
| 抗β-actin抗体 | Wanleibio | #WL01372 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄和体重,CP剂量和给药方案,分组和样本量。 阅读提示:Materials and methods - Animal treatment |
| 细胞培养和处理 | 细胞系来源,培养条件,CP浓度和处理时间,MFI8和MASM7的浓度。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and treatments |
| 基因沉默 | siRNA序列和转染浓度。 阅读提示:Materials and methods - SiRNA-mediated silencing |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色条件,Mito-SOX浓度和染色时间。 阅读提示:Materials and methods - Mitochondrial membrane potential assay, Mito-SOX staining |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色步骤和细胞数量。 阅读提示:Materials and methods - FITC/PI staining |
| qRT-PCR和Western blot | 引物序列,抗体种类和稀释比例,内参基因。 阅读提示:Materials and methods - Total RNA isolation and quantitative real-time PCR, Western blot analysis |
| 统计设计 | 统计方法,数据表示形式,显著性水平。 阅读提示:Materials and methods - Statistical analysis |