检测ZBTB7A在结直肠癌细胞系中的表达
验证ZBTB7A在结直肠癌细胞系中的基础表达水平。
通过Western blot检测SW620、HT-29、HCT8和HCT116细胞系中ZBTB7A的蛋白表达。
ZBTB7A regulates CD95-mediated cell growth in colorectal cancer cell lines.
文献包含细胞系体外实验:CRISPR/Cas9敲低、过表达、CCK8、Annexin V、Western blot、RT-qPCR、ChIP,但缺少动物模型和临床样本验证。
HCT116人结直肠癌细胞系 HT29人结直肠癌细胞系 HCT8人结直肠癌细胞系 SW620人结直肠癌细胞系
ZBTB7A敲低HCT116细胞系(#2和#3)的生长抑制效果 CD95 mRNA和蛋白水平在ZBTB7A敲低和过表达条件下的变化 姜黄素处理(50μM,24h)对结直肠癌细胞增殖的影响 ZBTB7A与CD95启动子区域(791-1039)的结合(ChIP实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ZBTB7A在结直肠癌细胞系中的基础表达水平。
通过Western blot检测SW620、HT-29、HCT8和HCT116细胞系中ZBTB7A的蛋白表达。
为研究ZBTB7A功能提供敲低模型。
使用基于慢病毒的CRISPR/Cas9系统,将靶向ZBTB7A的sgRNA导入HCT116细胞,经嘌呤霉素筛选获得稳定敲低细胞系(#2和#3)。
探究ZBTB7A对结直肠癌细胞增殖和凋亡的影响。
通过CCK8实验检测敲低细胞系的生长曲线,并通过Annexin V/PI染色检测凋亡比例。
确定ZBTB7A是否影响CD95及其下游信号分子的表达。
通过Western blot检测敲低和过表达ZBTB7A后CD95、Caspase2、JNK2等蛋白的表达变化。
验证ZBTB7A是否在转录水平调控CD95。
通过RT-qPCR检测ZBTB7A敲低和过表达条件下CD95 mRNA的表达水平。
证明ZBTB7A直接结合CD95启动子区域。
通过ChIP实验,使用抗Flag抗体富集ZBTB7A-Flag结合的DNA片段,并通过qPCR检测CD95启动子区域(791-1039)。
验证药理性抑制ZBTB7A对结直肠癌细胞生长和CD95表达的影响。
用姜黄素处理四种结直肠癌细胞系,通过CCK8检测细胞增殖,并通过Western blot检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 姜黄素 | Yeasen | 53828ES60 |
| Western blot | 抗β-actin抗体 | CST | 5125S |
| 抗ZBTB7A抗体 | Abcam | ab175918 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz | sc-32233 | |
| 抗CD95抗体 | CST | 8023S | |
| 抗JNK2抗体 | CST | 9258S | |
| 抗Caspase2抗体 | Bioss | bs-5802R | |
| 抗NF-κB-P65抗体 | Santa Cruz | sc-372 | |
| 抗磷酸化NF-κB-P65抗体 | CST | 3033S | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Bioin | -- | |
| 基因敲低 | lentiCRISPRv2载体 | Addgene | 52961 |
| 细胞增殖分析 | CCK8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 酶标仪 | Bio-Tek | -- | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/碘化丙啶(PI)试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 流式细胞仪(Celesta) | BD Biosciences | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 增强化学发光检测试剂 | Millipore | -- | |
| ChIP | 甲醛 | Invitrogen | -- |
| 甘氨酸 | Sangon Biotech | -- | |
| 超声破碎仪 | Vibra cell | -- | |
| A/G琼脂糖珠 | Invitrogen | -- | |
| 抗Flag M2琼脂糖珠 | Sigma | -- | |
| 蛋白酶K | Sigma-Aldrich | -- | |
| TIANamp基因组DNA提取试剂盒 | TIANGEN Biotech | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | TIANGEN | -- |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Toyobo | -- | |
| TaqMan基因表达检测试剂盒 | Toyobo | -- | |
| 7500实时定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白质降解分析 | MG132 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源及培养条件:DMEM培养基、10% FBS、37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| ZBTB7A敲低细胞系构建 | sgRNA序列(primer-pair2和primer-pair3)、载体(lentiCRISPRv2)、嘌呤霉素筛选浓度和时间(1 mg/mL,14天) 阅读提示:Materials and methods: Generation of ZBTB7A knockdown Cell lines |
| 细胞增殖检测 | CCK8实验条件:每孔10000个细胞,检测时间点0、24、48、72小时,重复次数 阅读提示:Materials and methods: Growth curve assay |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V/PI染色步骤:细胞密度5x10^6 cells/mL,Annexin V孵育15分钟,PI染色 阅读提示:Materials and methods: Annexin V Staining |
| Western blot | 抗体信息(anti-ZBTB7A、anti-CD95、anti-JNK2等)、一抗孵育条件(4°C过夜)、二抗和ECL检测 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |
| RT-qPCR | RNA提取方法、cDNA合成试剂盒、qPCR试剂盒和仪器型号 阅读提示:Materials and methods: Real-time qPCR |
| ChIP实验 | 细胞固定条件(1%甲醛10分钟)、超声条件、抗体(anti-Flag)、qPCR检测CD95启动子区域(791-1039) 阅读提示:Materials and methods: ChIP assay |
| 药物处理 | 姜黄素浓度(50μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:Figure 4 legend |