患者样本分析
评估IFIT3在UC患者结肠组织中的表达及其与临床特征的相关性。
收集22例UC患者和20例健康对照的肠黏膜样本,进行免疫组化染色,分析IFIT3表达与Mayo临床评分和粪便钙卫蛋白水平的相关性。
Downregulation of IFIT3 Relieves the Inflammatory Response in Ulcerative Colitis via Selectively Regulating Macrophage M1 Polarization and the STAT1/2 Signaling Pathway.
包含患者样本分析、DSS诱导小鼠模型、体外THP-1细胞实验等多个证据层级,且进行功能验证(敲低IFIT3)和机制验证(STAT1/2通路)。
UC患者肠黏膜样本 DSS诱导的UC小鼠模型 THP-1巨噬细胞
患者样本:22例UC患者和20例健康对照的肠黏膜样本 动物模型:C57BL/6小鼠,AAV9-shIFIT3或AAV9-shNC腹腔注射,2.5% DSS饮水诱导7天 体外细胞:THP-1细胞,PMA分化,LPS刺激诱导M1极化 处理条件:siRNA敲低IFIT3,或UPA(100 nM、400 nM)处理 检测指标:IFIT3、TNF-α、IL-1β、IL-6表达,STAT1/2磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估IFIT3在UC患者结肠组织中的表达及其与临床特征的相关性。
收集22例UC患者和20例健康对照的肠黏膜样本,进行免疫组化染色,分析IFIT3表达与Mayo临床评分和粪便钙卫蛋白水平的相关性。
验证IFIT3敲低对DSS诱导的UC小鼠肠道炎症的影响及STAT1/2通路的变化。
对C57BL/6小鼠腹腔注射AAV9-shIFIT3或AAV9-shNC,72小时后给予2.5% DSS饮水7天诱导UC。记录体重变化,取结肠组织进行H&E染色、qRT-PCR和Western blot检测。
探讨IFIT3对巨噬细胞M1极化的影响及其分子机制。
THP-1细胞经PMA分化后,用LPS或LPS+IFN-γ诱导M1极化。通过siRNA敲低IFIT3或用UPA处理,检测M1标志物、炎症因子表达和STAT1/2通路变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | 超敏SP检测试剂盒 | Maxim | KIT-9730 |
| 抗IFIT3抗体 | Proteintech | 15201-1-AP | |
| 动物实验 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | 9011-18-1 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞分化 | 佛波醇-12-十四酸酯-13-乙酸酯 | Beyotime | S1819 |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Beyotime | S1732 |
| 干扰素-γ | Novoprotein | C104 | |
| 白细胞介素-4 | Beyotime | P5129 | |
| 细胞转染 | siRNA转染试剂盒 | LeapWal | P09410 |
| 药物处理 | 乌帕替尼 | Medchemexpress | HY-19569 |
| 流式细胞术 | FITC标记的抗人CD68抗体 | Biolegend | 333805 |
| PE标记的抗人CD86抗体 | Biolegend | 374206 | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | ABclonal | RK30120 |
| 逆转录 | Primescript RT预混液 | Takara | RR036A |
| qRT-PCR | TB Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820A |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| 抗STAT1抗体 | Zenbio | R25799 | |
| 抗pSTAT1抗体 | Bioss | bsm-52209R | |
| 抗STAT2抗体 | Zenbio | R381419 | |
| 抗pSTAT2抗体 | Bioss | bs-3428R | |
| 抗GAPDH抗体 | Servicebio | GB15002-100 | |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 | Proteintech | 28058-1-AP |
| Cy3标记二抗 | Servicebio | GB | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| DAPI | Servicebio | G1012 | |
| 动物实验 | AAV9-shIFIT3 | Obio | -- |
| AAV9-shNC | Obio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 样本来源:上海第五人民医院;UC患者22例,健康对照20例;Mayo临床评分和粪便钙卫蛋白水平;IFIT3 IHC评分方法(染色强度×阳性细胞百分比)。 阅读提示:Materials and Methods: Patients and Samples 和 Immunohistochemistry |
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别:C57BL/6雄性,7周龄;AAV9-shIFIT3或AAV9-shNC的剂量和给药方式:腹腔注射100 µL 1×10^12 ng/mL;DSS浓度和给药时间:2.5%饮水7天;体重记录频率;每组样本量(n=5)。 阅读提示:Materials and Methods: IFIT3 Silencing in DSS-Induced UC Mice 和 Figure 3 legend |
| 体外细胞实验 | THP-1细胞来源;PMA浓度和处理时间:100 ng/mL 24小时;LPS浓度:100 ng/mL;IFN-γ浓度:20 ng/mL;IL-4浓度:20 ng/mL;siRNA转染序列和转染试剂盒;UPA浓度:100 nM和400 nM;处理时间:48小时(RNA)和96小时(蛋白/流式)。 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture and Differentiation, Cell Transfection and Upadacitinib (UPA) Treatment, 和 Figure 5, 7 legends |
| 分子检测 | qRT-PCR引物序列(表1);Western blot抗体稀释度:IFIT3 1:3000, STAT1 1:1000, pSTAT1 1:1000, STAT2 1:1000, pSTAT2 1:1000, GAPDH 1:1000;内参基因:ACTB;统计学方法:t检验或方差分析。 阅读提示:Materials and Methods: Quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR), Western Blot, 和 Table 1 |