评估AQP5+胃癌细胞对NK细胞功能的影响
确定AQP5+肿瘤细胞是否损害NK细胞活性
通过体内移植瘤模型、scRNA-seq、流式细胞术和共培养实验,比较AQP5+与AQP5-肿瘤中NK细胞的比例、增殖和细胞毒性。
Targeting AQP5-mediated arginine deprivation in gastric cancer stem cells restores NK cell anti-tumor immunity.
包含细胞实验、小鼠移植瘤模型、单细胞测序、代谢组学、蛋白质组学及临床样本验证,并明确进行了功能与机制验证。
小鼠胃癌细胞系MFC 人胃癌细胞系AGS和HGC-27 NSG小鼠移植瘤模型 患者来源类器官(PDO)和患者来源异种移植(PDOX)模型
AQP5+胃癌细胞与NK细胞共培养体系 L-精氨酸补充剂量(2 g/kg口服) iNOS条件敲除小鼠(Inosfl/flNcr1cre) ULK1抑制剂MRT68921浓度(1 μM体外,20 mg/kg体内)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定AQP5+肿瘤细胞是否损害NK细胞活性
通过体内移植瘤模型、scRNA-seq、流式细胞术和共培养实验,比较AQP5+与AQP5-肿瘤中NK细胞的比例、增殖和细胞毒性。
寻找AQP5+肿瘤细胞分泌的抑制性代谢物
使用条件培养基处理NK细胞,结合非靶向和靶向代谢组学分析差异代谢物。
确认低精氨酸是损害NK细胞功能的关键,并验证补充L-精氨酸能否恢复
在体内外补充L-精氨酸,观察NK细胞功能和肿瘤生长的变化,并使用NK细胞清除实验验证其必要性。
揭示AQP5如何减少精氨酸合成
通过蛋白质组学、Reverse-ChIP、免疫共沉淀、荧光显微镜等实验,证明AQP5与DHX9、KPNB1的竞争性结合。
确认低精氨酸通过限制NO合成影响NK细胞功能
使用iNOS抑制剂和NK细胞特异性iNOS敲除小鼠,评估NO水平、NK细胞增殖和细胞毒性。
探究AQP5+细胞如何适应低精氨酸环境并维持能量代谢
测量ATP、OCR、氨基酸水平,使用U-13C6谷氨酸示踪和代谢组学分析TCA循环和谷氨酰胺代谢。
揭示AQP5如何上调谷氨酰胺合成
通过RNA干扰、泛素化分析、免疫共沉淀和质谱,证明AQP5通过TRIM21促进GLUL的K63泛素化并增加其稳定性。
验证ULK1抑制联合L-精氨酸对AQP5高表达胃癌的治疗效果
在患者来源类器官和异种移植模型中,评估联合治疗的肿瘤抑制作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | 兔多克隆抗AQP5抗体 | Abcam | ab315855 |
| 兔单克隆抗EpCAM抗体 | Abcam | ab223582 | |
| 兔单克隆抗CD3抗体 | Abcam | ab16669 | |
| 兔单克隆抗CD56抗体 | Abcam | ab220360 | |
| 兔单克隆抗ASS1抗体 | Cell Signaling Technology | 70720 | |
| 兔单克隆抗DHX9抗体 | Cell Signaling Technology | 71286 | |
| 兔多克隆抗ARG抗体 | BOSTER | BM3973 | |
| 兔单克隆抗GLUL抗体 | Cell Signaling Technology | 80636 | |
| 兔单克隆抗TRIM21抗体 | BOSTER | A02079-2 | |
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 药物处理 | L-精氨酸 | MedChemExpress | E5036 |
| MRT68921 | CSNpharm | CSN11346 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | GLPBIO | -- |
| CellTrace CFSE细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞毒性检测 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| 代谢物检测 | L-精氨酸ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS728648-96 |
| 谷氨酰胺检测试剂盒-WST | DOJINDO | G268 | |
| NO检测 | DAF-FM DA探针 | Thermo Fisher | D23844 |
| 免疫印迹 | 抗Flag亲和凝胶 | Bimake | B23101 |
| 抗HA标签兔单克隆抗体偶联琼脂糖珠 | Engibody Biotechnology | AT1794 | |
| 抗Myc标签兔单克隆抗体偶联琼脂糖珠 | Engibody Biotechnology | AT0541 | |
| 细胞分离 | 人CD3磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-097-043 |
| 人CD56磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-097-042 | |
| 人NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-657 | |
| 小鼠NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-115-818 | |
| 小鼠CD3磁珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-973 | |
| 小鼠CD19磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-121-301 | |
| CD11b磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-093-634 | |
| RNA-seq | MACS肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi | 130-095-929 |
| RNA提取 | RNA Easy分离试剂 | Vazyme | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | TAKARA | RR037A |
| qPCR | SYBR qPCR预混液试剂盒 | Vazyme | -- |
| 免疫组化 | EnVision-HRP试剂盒 | Dako | K4001 |
| 双荧光素酶报告 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| Reverse-ChIP | Reverse-chip试剂盒 | BersinBio | Bes5005 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Thermo Fisher | A22066 |
| Seahorse分析 | Seahorse XF96细胞外通量分析试剂盒 | Agilent | -- |
| 类器官培养 | 基质胶 | ABWBIO | -- |
| SPY555红色荧光染料 | -- | -- | |
| 细胞系 | 293T细胞系 | ATCC | CRL-3216 |
| AGS细胞系 | ATCC | CRL-1739 | |
| HGC-27细胞系 | National Collection of Authenticated Cell Cultures | SCSP-5263 | |
| NK-92细胞系 | ATCC | CRL-2407 | |
| MGC细胞系 | Procell | CL-0156 | |
| 动物模型 | NSG小鼠 | Beijing Viewsolid Biotech | -- |
| C57BL/6J小鼠 | Beijing Viewsolid Biotech | -- | |
| NV-NSG-hIL15小鼠 | Shanghai Model Organisms Center | -- | |
| 代谢组学 | 安捷伦1290 Infinity II超高效液相色谱系统 | Agilent | -- |
| 安捷伦6460三重四极杆质谱仪 | Agilent | -- | |
| Sciex TripleTOF 6600质谱仪 | Sciex | -- | |
| 蛋白质组学 | Q Exactive质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| 流式细胞术 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 细胞分选 | BD FACSAria III流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 肿瘤转移成像 | OV100显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞共培养 | NK细胞与肿瘤细胞共培养的时间(48小时)、比例、是否使用transwell 阅读提示:方法部分“NK细胞分离和培养”和“NK细胞毒性实验” |
| L-精氨酸补充 | 体内给药剂量(2 g/kg口服)和体外浓度(40 nmol/mL) 阅读提示:结果部分“L-精氨酸补充”描述及图2 |
| 动物模型构建 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞注射数量、肿瘤体积测量方法 阅读提示:方法部分“体内肿瘤异种移植模型”和“尾静脉注射转移模型” |
| 代谢分析 | 细胞培养条件、代谢物提取和LC-MS/MS参数 阅读提示:方法部分“靶向代谢组学”和“非靶向代谢组学” |
| 信号通路验证 | 关键蛋白表达和互作检测条件,如IP、Western blot、CHX处理浓度和时间 阅读提示:方法部分“免疫共沉淀和Western blot”以及图6 |