建立奥希替尼耐药细胞系
模拟临床获得性耐药,研究耐药机制。
通过逐步增加奥希替尼浓度处理EGFR突变NSCLC细胞系PC-9和HCC827约6个月,建立耐药细胞系PC-9/OR和HCC827/OR,并利用NGS确认无EGFR激酶域继发突变或MET扩增。
Restoration of Osimertinib sensitivity in lung cancer through BRD4 inhibitor-mediated depalmitoylation of mutant EGFR via APT1.
包含体外细胞实验(耐药细胞系建立、功能验证)、分子机制验证(ChIP、Co-IP、双荧光素酶)、体内异种移植模型,多层级证据。
PC-9/OR 奥希替尼耐药细胞系 HCC827/OR 奥希替尼耐药细胞系 293T 细胞 BABL/c 裸鼠异种移植模型
奥希替尼耐药细胞系PC-9/OR和HCC827/OR的建立及EGFR 19del确认 BRD4抑制剂NHWD870浓度(0-10 nM)处理 APT1敲低(shAPT1)及EGFR C19位点突变体转染 体内实验小鼠分组及给药剂量(Osimertinib 1.25 mg/kg口服,NHWD870 1.5 mg/kg腹腔注射) EGFR核转位检测(免疫荧光及亚细胞分级)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟临床获得性耐药,研究耐药机制。
通过逐步增加奥希替尼浓度处理EGFR突变NSCLC细胞系PC-9和HCC827约6个月,建立耐药细胞系PC-9/OR和HCC827/OR,并利用NGS确认无EGFR激酶域继发突变或MET扩增。
探究CMPK2在奥希替尼耐药中的作用及其是否依赖EGFR二次突变。
在敏感和耐药细胞中检测CMPK2表达及EGFR核转位;通过敲低CMPK2观察细胞活力和增殖变化。
评估BRD4抑制剂NHWD870对耐药细胞活力、增殖及EGFR核转位的影响。
用不同浓度NHWD870处理耐药细胞,检测细胞活力、BRD4和CMPK2表达、EGFR核转位,以及联合奥希替尼的效果。
确定nEGFR与BRD4是否结合CMPK2启动子并激活其转录。
在293T和耐药细胞中过表达nEGFR或BRD4,通过ChIP检测CMPK2启动子结合,双荧光素酶报告基因检测启动子活性,Co-IP检测nEGFR与BRD4相互作用。
探究EGFR棕榈酰化修饰在耐药细胞中的变化及关键半胱氨酸位点。
利用Acyl-RAC检测敏感和耐药细胞的EGFR棕榈酰化水平;用2-BP和Palm B处理;构建C19位点突变体,检测其对CMPK2表达的影响。
研究APT1是否介导EGFR去棕榈酰化并促进其核转位,从而影响奥希替尼敏感性。
在敏感和耐药细胞中敲低APT1,检测EGFR棕榈酰化水平、核转位、CMPK2表达及细胞活力。
探究BRD4抑制剂与APT1敲低联合是否增强对耐药细胞的抑制作用。
在PC-9/OR和HCC827/OR细胞中转染EGFR WT或C19突变体,或敲低APT1,并联合NHWD870处理,检测CMPK2表达、EGFR核转位、细胞活力和增殖。
在异种移植模型中评估BRD4抑制剂联合奥希替尼的治疗效果。
将PC-9/OR或HCC827/OR细胞皮下注射至裸鼠,随机分组并给予药物,测量肿瘤体积,并通过IHC等检测相关标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 奥希替尼 | Selleck Chemicals | -- |
| NHWD870 | -- | -- | |
| 2-溴棕榈酸酯 | -- | -- | |
| 棕榈酸B | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | 抗EGFR抗体 | Abcam | ab52894 |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| 抗APT1抗体 | Boster | A07249 | |
| Western blot | 抗磷酸化EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | #3777 |
| 抗BRD4抗体 | Abcam | ab128874 | |
| 抗CMPK2抗体 | ThermoFisher | PA5-34461 | |
| NE-PER核浆蛋白提取试剂盒 | Thermo Scientific | #78833 | |
| qRT-PCR | SYBR Green 实时荧光定量PCR | Applied Biosystems | 4309155 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA测序 | NEBNext Poly(A) mRNA磁分离模块 | New England Biolabs | #E7490 |
| NEBNext Ultra II 定向RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | #E7760 | |
| ProtoScript II 逆转录酶 | New England Biolabs | #M0368 | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 |
| DAB显色液 | Bioss | -- | |
| 动物实验 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 耐药细胞系建立 | PC-9和HCC827细胞来源、奥希替尼浓度递增方案(0-40 nM)及处理时长(约6个月) 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| BRD4抑制剂处理 | NHWD870浓度梯度(0-10 nM)及处理时间(文中未明确说明) 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment; Results: 图2 |
| EGFR棕榈酰化检测 | Acyl-RAC实验步骤、2-BP(100 µM)和Palm B(50 µM)的处理时间(0-8 h) 阅读提示:Methods: Acyl resin-assisted capture (Acyl-RAC); Results: 图4 |
| 基因敲低与过表达 | shRNA序列(shCMPK2、shAPT1)对应载体pGLVH1、转染试剂Lipofectamine 3000及转染效率 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 体内动物实验 | BABL/c裸鼠周龄和体重、细胞接种量(5×10^6)、分组(n=6)、给药剂量(Osimertinib 1.25 mg/kg口服,NHWD870 1.5 mg/kg腹腔注射,联合剂量减半)及疗程(3周) 阅读提示:Methods: In vivo mouse model |