利用细胞大小分离牙髓来源间充质基质细胞中遗传和功能不同的亚群

Harnessing cell size to separate genetically and functionally distinct dental pulp-derived mesenchymal stromal cell subpopulations.

作者信息Yiyue Jiang, Zheng Zhang, Kangkang Ren, Shujuan Zhou, Yang Qiao, Weilu Huang, Nanyang Zhang, Hanyan Xu, Xinping Xu, Bing Wen, Wei Zhang, Lu Yin
PMID40462207
发布时间2025-06-03
DOI10.1186/s13036-025-00524-w

实验完整度

研究包含细胞分离、功能验证(集落形成、三系分化、T细胞抑制、巨噬细胞极化)、转录组分析及多供体重复,证据层级丰富。

主要模型

人牙髓来源间充质基质细胞(DPMSCs) THP-1细胞来源的巨噬细胞 外周血单个核细胞(PBMCs)

重点核对

DPMSC供体来源:成人第三磨牙 微流控分选流速:3 mL/min、2.5 mL/min、2 mL/min 共培养比例:T细胞抑制实验1:10,巨噬细胞极化实验1:1 诱导剂浓度:LPS 50 ng/mL,IFN-γ 20 ng/mL 统计方法:单因素ANOVA和Student's t检验

摘要

背景:牙髓来源间充质基质细胞(DPMSCs)代表了再生医学的一个有前景的方向。然而,DPMSCs的治疗效力受到体外扩增过程中出现的功能异质性的显著影响。因此,在扩增后识别和选择最有效的DPMSC亚群是提高治疗效果和一致性的关键。然而,传统的干细胞亚群分离方法在临床规模生物加工中大多不可行,主要是由于其高成本和有限的处理量。近期研究揭示了培养扩增的干细胞的生物物理特征与其功能属性之间的强相关性,从而提出了采用高通量、低成本的生物物理分选技术来分离功能不同的亚群的可能性。方法:采用高通量微流控芯片,利用Dean流分馏原理,基于细胞大小对培养扩增的DPMSC亚群进行无标记分离。结果:利用这种微流控技术,从成年供体第三磨牙中分离的培养扩增DPMSCs被分选为四个亚群,每个亚群具有不同的平均细胞直径,范围从14.3到20.5 μm。中等大小的亚群(15.2到18.6 μm)表现出最高的集落形成效率。相比之下,大尺寸亚群(18.6到20.5 μm)在体外表现出增强的成骨和成软骨能力,以及在共培养环境中抑制T细胞增殖和逆转巨噬细胞M1极化的卓越能力。此外,转录组分析揭示随着DPMSC大小的变化,基因表达谱逐渐变化。大和中等大小的亚群上调参与免疫应答、钙信号传导和ECM-受体相互作用的基因,而小尺寸亚群下调与免疫应答途径、细胞周期和生长因子活性相关的基因。结论:本研究阐明了培养扩增DPMSCs的功能异质性与形态学相关性,并提出了一种在临床规模制造中分离功能性DPMSC亚群的可行策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
培养扩增后的DPMSCs是否表现出细胞大小与功能异质性之间的关联,以及能否利用基于大小的微流控分选来富集具有特定功能的亚群?
核心机制
细胞大小与功能相关,大细胞亚群上调免疫应答、钙信号和ECM-受体相互作用相关基因,从而增强免疫调节和分化能力。
主要证据
通过微流控分选获得四个亚群,大亚群(S4)在体外显示增强的成骨、成软骨能力以及更强的T细胞抑制和巨噬细胞M1极化逆转能力,转录组分析显示相应基因表达变化。
研究意义
该研究为临床规模制造中分离功能性DPMSC亚群提供了基于细胞大小的高通量、无标记分选策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

DPMSC分离与扩增

从牙髓组织中分离并培养扩增DPMSCs,获得足够数量的细胞用于后续实验。

从成人第三磨牙中提取牙髓,酶消化后培养扩增,通过贴壁和集落形成特性分离DPMSCs。

2

微流控分选大小依赖的DPMSC亚群

利用细胞大小差异,通过微流控芯片分选获得四个不同的DPMSC亚群。

使用DFF原理的微流控芯片进行连续分选,在不同流速下收集S1至S4亚群。

3

亚群功能表征

评估各亚群的集落形成、多向分化潜能和免疫调节功能。

通过集落形成实验、三系分化实验、T细胞抑制实验和巨噬细胞极化实验比较亚群功能。

4

转录组分析

揭示大小依赖的DPMSC亚群间的基因表达差异。

对未分选及分选后的亚群进行RNA-seq,分析差异表达基因及通路富集。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
I型胶原酶Worthington BiochemicalLS004196
MEMα培养基Wuhan Pricella BiotechnologyPM150421
胎牛血清ExCell BioFSP500
青霉素-链霉素Solarbio Life Science240004003
L-谷氨酰胺Thermo Fisher Scientific25030081
成纤维细胞生长因子2Thermo Fisher Scientific13256-029
NucleoCounter NC-3000细胞计数仪ChemoMetecNC-3000
结晶紫AbMoleM5540
抗人CD73抗体ElabscienceE-AB-F1242C
抗人CD90抗体ElabscienceE-AB-F1167C
抗人CD105抗体ElabscienceE-AB-F1310D
抗人CD29抗体ElabscienceE-AB-F1049C
抗人CD34抗体ElabscienceE-AB-F1001C
抗人CD45抗体ElabscienceE-AB-F1137C
抗人HLA-DR抗体ElabscienceE-AB-F1111C
Cytoflex s流式细胞仪Beckman Coulter--
DAPI染料ChemoMetec--
成骨分化培养基OriCellGUXMX-90021
成脂分化培养基OriCellGUXMX-90031
成软骨分化培养基OriCellGUXMX-90041
茜素红S染色试剂盒OriCellALIR-10001
油红O染色试剂盒OriCellOILR-10001
阿利新蓝染色试剂盒OriCellALCB-10001
抗人II型胶原抗体Bioss Antibodiesbs-10589R
HRP标记的二抗Bioss Antibodiesbs-0295G-HRP
DAB显色剂Servicebio Life ScienceG1212-200T
EVOS M5000成像系统Thermo Fisher Scientific--
徕卡TL LED显微镜Leica--
十六烷基吡啶氯化物Solarbio Life ScienceIC0280
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific15596026
Hifair AdvanceFast一步法RT-gDNA消化SuperMixYeasan Biotechnology11151ES10
Hieff UNICON通用蓝色qPCR SYBR Green Master MixYeasan Biotechnology11184ES08
QuantStudio Dx实时荧光定量PCR系统Thermo Fisher Scientific--
SYLGARD 184硅胶弹性体套装Dow Corning--
空气等离子体机COVANCE, Femato Science--
泊洛沙姆188Thermo Fisher Scientific24040032
注射泵RWD Life ScienceR462
Countstar智能细胞分析计数板CountstarCO010101
Ficoll分离液Solarbio Life ScienceP8900
RPMI 1640培养基Thermo Fisher ScientificC11875500BT
胎牛血清ExCell BioFSP500
青霉素/链霉素Solarbio Life ScienceP1400
CFSE染料Thermo Fisher ScientificC34554
植物血凝素Thermo Fisher Scientific10576015
抗人CD3抗体Thermo Fisher Scientific17-0037-42
THP-1细胞系Wuhan Pricella BiotechnologyCL-0233
β-巯基乙醇Thermo Fisher Scientific2603098
佛波酯Sigma-AldrichL4130
脂多糖Sigma-AldrichL4130
干扰素-γPeprotech122285
抗人CD68抗体Biolegend333807
抗人CD14抗体Biolegend301805
抗人CD11b抗体Biolegend301305
抗人CD86抗体Biolegend305405
抗人CD206抗体Biolegend321109
Novaseq 6000测序平台Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
DPMSC分离与培养
供体来源(第三磨牙)、酶消化条件(Collagenase I 2 mg/mL, 37°C, 1h)、培养条件(MEMα,15% FBS,1% P/S,1% L-谷氨酰胺,10 ng/mL FGF-2,5% CO2,37°C)、传代密度(5000 cells/cm²,每4天)
阅读提示:Methods: DPMSC isolation and expansion
微流控分选
微流控芯片的制造参数、分选流速(3, 2.5, 2 mL/min)、细胞浓度(1×10^6 cells/mL)、F-68预处理(1% 1min)
阅读提示:Methods: Microfluidic design and chip fabrication; Microfluidic sorting of DPMSC
集落形成实验
接种密度(150 cells/well)、培养时间(10天)、结晶紫染色浓度(0.1%)
阅读提示:Methods: Colony formation assay
多向分化实验
成骨分化:4×10^4 cells/well,14天;成软骨分化:3×10^5 cells/孔,21天;成脂分化:6×10^4 cells/well,14天
阅读提示:Methods: Tri-lineage differentiation of DPMSC
T细胞抑制实验
PBMC中CD3+ T细胞的比例、CFSE标记浓度(1 μM)、PHA浓度(0.2%)、共培养比例(1:10)、共培养时间(4天)
阅读提示:Methods: T cell suppression assay
巨噬细胞极化实验
THP-1分化条件(PMA 1 ng/mL 12h)、M1极化条件(LPS 50 ng/mL, IFN-γ 20 ng/mL 24h)、共培养比例(1:1)、Transwell小室
阅读提示:Methods: Macrophage polarization assay
RNA-seq
RNA提取方法、文库制备和测序平台(NovaSeq 6000)、差异表达分析阈值(p<0.05, fold change>2或<0.5)
阅读提示:Methods: RNA-seq