DPMSC分离与扩增
从牙髓组织中分离并培养扩增DPMSCs,获得足够数量的细胞用于后续实验。
从成人第三磨牙中提取牙髓,酶消化后培养扩增,通过贴壁和集落形成特性分离DPMSCs。
Harnessing cell size to separate genetically and functionally distinct dental pulp-derived mesenchymal stromal cell subpopulations.
研究包含细胞分离、功能验证(集落形成、三系分化、T细胞抑制、巨噬细胞极化)、转录组分析及多供体重复,证据层级丰富。
人牙髓来源间充质基质细胞(DPMSCs) THP-1细胞来源的巨噬细胞 外周血单个核细胞(PBMCs)
DPMSC供体来源:成人第三磨牙 微流控分选流速:3 mL/min、2.5 mL/min、2 mL/min 共培养比例:T细胞抑制实验1:10,巨噬细胞极化实验1:1 诱导剂浓度:LPS 50 ng/mL,IFN-γ 20 ng/mL 统计方法:单因素ANOVA和Student's t检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从牙髓组织中分离并培养扩增DPMSCs,获得足够数量的细胞用于后续实验。
从成人第三磨牙中提取牙髓,酶消化后培养扩增,通过贴壁和集落形成特性分离DPMSCs。
利用细胞大小差异,通过微流控芯片分选获得四个不同的DPMSC亚群。
使用DFF原理的微流控芯片进行连续分选,在不同流速下收集S1至S4亚群。
评估各亚群的集落形成、多向分化潜能和免疫调节功能。
通过集落形成实验、三系分化实验、T细胞抑制实验和巨噬细胞极化实验比较亚群功能。
揭示大小依赖的DPMSC亚群间的基因表达差异。
对未分选及分选后的亚群进行RNA-seq,分析差异表达基因及通路富集。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞消化 | I型胶原酶 | Worthington Biochemical | LS004196 |
| 细胞培养 | MEMα培养基 | Wuhan Pricella Biotechnology | PM150421 |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio Life Science | 240004003 | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | 25030081 | |
| 成纤维细胞生长因子2 | Thermo Fisher Scientific | 13256-029 | |
| 细胞计数 | NucleoCounter NC-3000细胞计数仪 | ChemoMetec | NC-3000 |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | AbMole | M5540 |
| 流式细胞术 | 抗人CD73抗体 | Elabscience | E-AB-F1242C |
| 抗人CD90抗体 | Elabscience | E-AB-F1167C | |
| 抗人CD105抗体 | Elabscience | E-AB-F1310D | |
| 抗人CD29抗体 | Elabscience | E-AB-F1049C | |
| 抗人CD34抗体 | Elabscience | E-AB-F1001C | |
| 抗人CD45抗体 | Elabscience | E-AB-F1137C | |
| 抗人HLA-DR抗体 | Elabscience | E-AB-F1111C | |
| Cytoflex s流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞周期分析 | DAPI染料 | ChemoMetec | -- |
| 成骨分化 | 成骨分化培养基 | OriCell | GUXMX-90021 |
| 成脂分化 | 成脂分化培养基 | OriCell | GUXMX-90031 |
| 成软骨分化 | 成软骨分化培养基 | OriCell | GUXMX-90041 |
| 成骨染色 | 茜素红S染色试剂盒 | OriCell | ALIR-10001 |
| 成脂染色 | 油红O染色试剂盒 | OriCell | OILR-10001 |
| 成软骨染色 | 阿利新蓝染色试剂盒 | OriCell | ALCB-10001 |
| 免疫组化 | 抗人II型胶原抗体 | Bioss Antibodies | bs-10589R |
| HRP标记的二抗 | Bioss Antibodies | bs-0295G-HRP | |
| DAB显色剂 | Servicebio Life Science | G1212-200T | |
| 成像 | EVOS M5000成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 显微镜 | 徕卡TL LED显微镜 | Leica | -- |
| 染色定量 | 十六烷基吡啶氯化物 | Solarbio Life Science | IC0280 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| Hifair AdvanceFast一步法RT-gDNA消化SuperMix | Yeasan Biotechnology | 11151ES10 | |
| Hieff UNICON通用蓝色qPCR SYBR Green Master Mix | Yeasan Biotechnology | 11184ES08 | |
| QuantStudio Dx实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 微流控芯片制造 | SYLGARD 184硅胶弹性体套装 | Dow Corning | -- |
| 空气等离子体机 | COVANCE, Femato Science | -- | |
| 微流控分选 | 泊洛沙姆188 | Thermo Fisher Scientific | 24040032 |
| 注射泵 | RWD Life Science | R462 | |
| 细胞大小测量 | Countstar智能细胞分析计数板 | Countstar | CO010101 |
| PBMC分离 | Ficoll分离液 | Solarbio Life Science | P8900 |
| PBMC培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | C11875500BT |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio Life Science | P1400 | |
| T细胞标记 | CFSE染料 | Thermo Fisher Scientific | C34554 |
| T细胞刺激 | 植物血凝素 | Thermo Fisher Scientific | 10576015 |
| T细胞分析 | 抗人CD3抗体 | Thermo Fisher Scientific | 17-0037-42 |
| THP-1培养 | THP-1细胞系 | Wuhan Pricella Biotechnology | CL-0233 |
| β-巯基乙醇 | Thermo Fisher Scientific | 2603098 | |
| 巨噬细胞极化 | 佛波酯 | Sigma-Aldrich | L4130 |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4130 | |
| 干扰素-γ | Peprotech | 122285 | |
| 巨噬细胞极化分析 | 抗人CD68抗体 | Biolegend | 333807 |
| 抗人CD14抗体 | Biolegend | 301805 | |
| 抗人CD11b抗体 | Biolegend | 301305 | |
| 抗人CD86抗体 | Biolegend | 305405 | |
| 抗人CD206抗体 | Biolegend | 321109 | |
| RNA-seq | Novaseq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DPMSC分离与培养 | 供体来源(第三磨牙)、酶消化条件(Collagenase I 2 mg/mL, 37°C, 1h)、培养条件(MEMα,15% FBS,1% P/S,1% L-谷氨酰胺,10 ng/mL FGF-2,5% CO2,37°C)、传代密度(5000 cells/cm²,每4天) 阅读提示:Methods: DPMSC isolation and expansion |
| 微流控分选 | 微流控芯片的制造参数、分选流速(3, 2.5, 2 mL/min)、细胞浓度(1×10^6 cells/mL)、F-68预处理(1% 1min) 阅读提示:Methods: Microfluidic design and chip fabrication; Microfluidic sorting of DPMSC |
| 集落形成实验 | 接种密度(150 cells/well)、培养时间(10天)、结晶紫染色浓度(0.1%) 阅读提示:Methods: Colony formation assay |
| 多向分化实验 | 成骨分化:4×10^4 cells/well,14天;成软骨分化:3×10^5 cells/孔,21天;成脂分化:6×10^4 cells/well,14天 阅读提示:Methods: Tri-lineage differentiation of DPMSC |
| T细胞抑制实验 | PBMC中CD3+ T细胞的比例、CFSE标记浓度(1 μM)、PHA浓度(0.2%)、共培养比例(1:10)、共培养时间(4天) 阅读提示:Methods: T cell suppression assay |
| 巨噬细胞极化实验 | THP-1分化条件(PMA 1 ng/mL 12h)、M1极化条件(LPS 50 ng/mL, IFN-γ 20 ng/mL 24h)、共培养比例(1:1)、Transwell小室 阅读提示:Methods: Macrophage polarization assay |
| RNA-seq | RNA提取方法、文库制备和测序平台(NovaSeq 6000)、差异表达分析阈值(p<0.05, fold change>2或<0.5) 阅读提示:Methods: RNA-seq |