筛选天然化合物库以鉴定上调MHC-I的化合物
鉴定能够上调乳腺癌细胞MHC-I表达的化合物。
使用Natural Compound set V(NCI)处理DCIS.com细胞(5 µM,48小时),通过免疫荧光检测MHC-I表达,初步筛选出Macbecin II、cassythicine和baccatin III进一步验证。
MHC-I upregulation by macbecin II in the solid tumors potentiates the effect of active immunotherapy.
包含体外细胞系筛选、抗原呈递和T细胞杀伤实验、体内小鼠肿瘤模型(E0771、B16-F1)以及机制研究(溶酶体降解),跨多个证据层级。
乳腺癌细胞系DCIS.com和MCF10CA1a 小鼠乳腺癌细胞系E0771和4T1 小鼠黑色素瘤细胞系B16-Ova和B16-F1 E0771乳腺癌小鼠模型和B16-F1黑色素瘤小鼠模型
Macbecin II处理剂量(0.1, 0.5, 5 µM)和处理时间(48小时) 动物实验中Macbecin II给药剂量(2 mg/kg)和给药时间(第0、8、15天) 体内实验中肿瘤细胞植入数量(200K cells)和植入方式(乳腺导管内注射) 联合治疗时疫苗IL2-ep13nsEV的给药方案(肌肉注射,每次50 μg)和抗PD-1的给药方案(腹腔注射,20 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能够上调乳腺癌细胞MHC-I表达的化合物。
使用Natural Compound set V(NCI)处理DCIS.com细胞(5 µM,48小时),通过免疫荧光检测MHC-I表达,初步筛选出Macbecin II、cassythicine和baccatin III进一步验证。
确认Macbecin II在多种乳腺癌细胞中的效应。
用不同浓度Macbecin II(0.1, 0.5 µM)处理DCIS.com、MCF10CA1a、E0771、4T1细胞48小时,通过流式细胞术检测MHC-I和MHC-II表面表达,并通过Western blot验证蛋白水平。
确定Macbecin II是否增强抗原呈递并促进抗原依赖性细胞死亡。
使用B16-Ova细胞和OT-1 T细胞共培养系统,检测H-2Kb/Ova呈递、IFN-γ和TNF-α分泌、CD69表达以及细胞毒性。
评估Macbecin II是否能增强IL2-ep13nsEV诱导的肿瘤细胞杀伤。
用DCIS.com裂解物制备IL2-ep13nsEV,与HLA匹配的PBMCs共培养,然后与DCIS.com或MCF10CA1a细胞在Macbecin II存在下共培养,检测细胞活力和联合指数。
在体内模型中验证联合治疗对肿瘤生长和转移的影响。
使用E0771或B16-F1小鼠模型,通过导管内或皮下注射肿瘤细胞,给予IL2-ep13nsEV和/或Macbecin II,测量肿瘤体积、重量、肺转移灶,并通过流式分析肿瘤浸润淋巴细胞。
测试Macbecin II是否能增强抗PD-1免疫检查点阻断的效果。
在E0771小鼠模型(导管内注射)和MMTV-PyVT自发肿瘤模型中,使用抗PD-1和/或Macbecin II治疗,评估肿瘤生长、重量、转移和T细胞浸润。
阐明Macbecin II上调MHC-I的分子机制。
检测MHC-I mRNA水平、蛋白质稳定性(使用环己酰亚胺)、蛋白酶体和溶酶体抑制剂(MG-132、巴弗洛霉素)的作用,以及C381(溶酶体酸化促进剂)的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | 11875093 |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000044 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 重组小鼠GM-CSF | Peprotech | 315-03 | |
| 重组人GM-CSF | Peprotech | 212-12 | |
| 重组人IL-4 | Peprotech | -- | |
| 疫苗制备 | 脂多糖溶液 | Thermo Fisher Scientific | 00-4976-93 |
| 双环二鸟苷酸 | -- | -- | |
| IL2-MFG-E8融合蛋白质粒 | System Biosciences | -- | |
| pPAX2包装质粒 | -- | -- | |
| pMD2.G包膜质粒 | -- | -- | |
| ExoQuick试剂盒 | -- | -- | |
| 流式分析 | Zombie Aqua固定活性检测试剂盒 | BioLegend | 423101 |
| 抗MHC-I抗体 (HLA ABC) | Abcam | ab134189 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor) | Abcam | ab150077 | |
| MHC II抗体 | BioLegend | 307602 | |
| H-2Kb-ova抗体 | BioLegend | 141603 | |
| PE抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100407 | |
| APC抗小鼠CD8a抗体 | BioLegend | 100711 | |
| FITC抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100203 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠IFN-γ抗体 | BioLegend | 505825 | |
| CD69抗体 | BioLegend | 104507 | |
| PE标记小鼠H-2Kb&B2M&OVA (SIINFEKL)四聚体蛋白 | ACROBiosystems | H2A-MP2H7-25ug | |
| Western blot | GAPDH抗体 | CST | 5174S |
| MHC-I抗体 | Invitrogen | 11-5958-80 | |
| PD-L1 (D4H1Z)兔单克隆抗体 | CST | 60475 | |
| 磷酸化eIF2α抗体 | CST | 3398T | |
| Laemmli上样缓冲液 | Bio-Rad | 161-0737 | |
| SuperSignal™ West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Scientific | 34580 | |
| 细胞毒性实验 | CellTiter 96® AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 (MTS) | Promega | G3582 |
| 结晶紫 | Fisher | S25275B | |
| InVivoMAb抗小鼠PD-1抗体 | Bioxcell | CD279 | |
| InVivoMAb抗小鼠MHC I类抗体 | Bioxcell | BE0077 | |
| 抗HLA-DR抗体 | Sino Biologicals | 105342-T40 | |
| T细胞激活 | CD3/CD28激活试剂盒 | ThermoFisher | 10971 |
| 小鼠T细胞激活/扩增试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-093-627 | |
| T细胞分离 | 小鼠CD8a+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-095-236 |
| 基因表达 | RNA分离试剂盒 | Zymo | R2072 |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 | |
| SYBR Green预混液 | -- | -- | |
| 蛋白定量 | Quick Start™ Bradford蛋白质检测试剂盒 | Bio-Rad | 5000201 |
| 生化检测 | AST活性检测试剂盒 | MilliporeSigma | MAK055-1KT |
| 免疫组织化学 | ImmPACT® DAB EqV底物试剂盒,过氧化物酶 (HRP) | Vector Labs | SK-4103 |
| 细胞因子检测 | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | RayBiotech | ELM-TNFa-1 |
| 药物处理 | Macbecin II | -- | -- |
| MG132 | Adooq Bioscience | A11043 | |
| 巴弗洛霉素 | Adooq Bioscience | A11961 | |
| C381 | -- | -- | |
| OVA肽 | GenScript | RP10611 | |
| 细胞培养 | 红细胞裂解缓冲液 (10X) | BioLegend | 420301 |
| 胞内染色透化洗涤缓冲液 | BioLegend | 421002 | |
| 支原体去除剂 (MRA) | MP Biomedical | 3050044 | |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 仪器 | BD FACS Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 荧光酶标仪 | -- | -- | |
| FEI Tecnai BioTwin透射电子显微镜 | FEI | -- | |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Amersham成像仪 | GE Healthcare | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(如ATCC)、培养基类型(RPMI 1640、DMEM)、FBS浓度(10%)、GM-CSF浓度(20 ng/mL)、培养时间(6天) 阅读提示:Methods - Cell lines and culture methods |
| 化合物筛选与处理 | Macbecin II浓度(0.1-5 µM)、处理时间(48小时)、天然化合物库筛选浓度(5 µM) 阅读提示:Figure 1 legend、Methods - Natural compound library screening |
| 流式细胞术 | 抗体种类、浓度(例如1:500)、孵育时间(30分钟)、温度(室温)、细胞处理(包括固定、透化) 阅读提示:Methods - Flow cytometry |
| T细胞激活与细胞毒性实验 | T细胞来源(脾脏)、激活方法(CD3/CD28微珠)、共培养比例(E:T=10:1)、Macbecin II浓度(0.1-0.5 µM)、处理时间(48小时)、细胞种植密度(500 cells/well) 阅读提示:Methods - T-cell activation and cytotoxicity assay |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6)、细胞植入方式(导管内或皮下)、细胞数量(200K或2×10^5)、Macbecin II剂量(2 mg/kg)、给药时间(第0、8、15天)、疫苗剂量(50 μg)和抗PD-1剂量(20 mg/kg) 阅读提示:Methods - Animal experiments |
| 溶酶体降解机制 | 抑制剂浓度(MG-132 10 µM、巴弗洛霉素100 nM、C381 30 µM)、环己酰亚胺浓度(50 µg/mL)、处理时间(12小时) 阅读提示:Figure 6 legend |