构建心肌细胞特异性Aars2敲除和过表达小鼠模型
研究AARS2在成年心肌细胞中的功能及对心肌梗死后心脏损伤的影响。
将Aars2fl/fl小鼠与α-MHC-MerCreMer小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导心肌细胞特异性敲除Aars2;将α-MHC-MerCreMer小鼠与Aars2转基因小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导心肌细胞特异性过表达AARS2。
AARS2 ameliorates myocardial ischemia via fine-tuning PKM2-mediated metabolism.
研究包含心肌细胞特异性敲除和过表达小鼠模型、原代心肌细胞体外实验、Seahorse代谢分析、Ribo-Seq、蛋白质印迹、免疫荧光及TEPP-46干预等多层级验证。
心肌细胞特异性Aars2敲除小鼠 心肌细胞特异性Aars2过表达转基因小鼠 原代新生大鼠心肌细胞
心肌细胞特异性Aars2敲除诱导方案:他莫昔芬腹腔注射20 mg/kg连续5天 心肌梗死模型:8-10周龄小鼠左前降支冠状动脉永久结扎 PKM2激活剂TEPP-46给药方案:10 mg/kg腹腔注射,第1-2周每日一次,第3-4周隔日一次 缺氧复氧处理:NRCMs在0.1% O2、5% CO2、37°C缺氧12小时,再常氧复氧1小时 Aars2 siRNA敲低:NRCMs转染siRNA#3,72小时后检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究AARS2在成年心肌细胞中的功能及对心肌梗死后心脏损伤的影响。
将Aars2fl/fl小鼠与α-MHC-MerCreMer小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导心肌细胞特异性敲除Aars2;将α-MHC-MerCreMer小鼠与Aars2转基因小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导心肌细胞特异性过表达AARS2。
确定Aars2缺失是否导致心肌病表型。
通过超声心动图检测心功能,Masson染色评估纤维化,WGA染色评估心肌细胞肥大,TUNEL染色检测凋亡。
探究Aars2缺失是否导致能量代谢缺陷。
采用Seahorse分析检测成年小鼠心肌细胞和NRCMs的线粒体耗氧率(OCR)和细胞外酸化率(ECAR)。
验证AARS2过表达是否改善心肌梗死后心功能和纤维化。
对Aars2 Tg/+和对照小鼠建立MI模型,通过超声心动图、Masson染色、TUNEL和LDH检测评估心脏功能、纤维化和凋亡。
探究AARS2过表达是否抑制缺血/缺氧诱导的心肌细胞凋亡和线粒体ROS产生。
对NRCMs进行缺氧复氧处理,检测MitoSOX荧光、凋亡蛋白表达和LDH释放。
确定AARS2过表达是否改变代谢模式。
采用质谱检测心脏组织和NRCMs中的代谢物(乳酸、丙酮酸、乙酰辅酶A),Seahorse分析检测OCR和ECAR。
揭示AARS2过表达促进糖酵解的分子机制。
进行Ribo-Seq分析Aars2过表达对翻译的影响,Western blot检测PKM2、PKM1、PDK4、LDHA蛋白水平,非变性凝胶电泳检测PKM2多聚体状态,质谱检测丙氨酸水平,qRT-PCR检测Pkm2 mRNA水平。
确定PKM2激活能否逆转AARS2缺乏引起的心肌病表型。
对Aars2 cKO小鼠给予TEPP-46或溶剂对照,通过超声心动图、Masson染色、LDH和MitoSOX检测心脏功能和细胞损伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | -- |
| TEPP-46 | MCE | -- | |
| 细胞培养 | 胶原酶II | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胰蛋白酶 | Amresco | -- | |
| DMEM培养基 | MacGene | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 16140071 | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 阿糖胞苷 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 心肌细胞分离 | 蛋白酶 | Sigma-Aldrich | P5147 |
| Seahorse分析 | Seahorse XFe24分析仪 | Agilent | -- |
| 线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 | |
| 糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent | 103020-100 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| Super ECL检测试剂 | Yeasen | 36208ES60 | |
| 柱式组织/细胞蛋白提取试剂盒 | Epizyme | PC201 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖 | Beyotime | P2012 |
| 免疫荧光 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1088 |
| MitoSOX线粒体超氧化物指示剂 | Thermo Fisher Scientific | M36008 | |
| DAPI | Abcam | ab104139 | |
| WGA染色 | 麦胚凝集素Alexa Fluor 488偶联物 | Invitrogen | W11261 |
| LDH检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| qRT-PCR | 总RNA提取试剂盒 | Tiangen | DP424 |
| 逆转录预混试剂盒 | Yeasen | 111141ES60 | |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Yeasen | 11184ES08 | |
| AB 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | Axio Scan Z1全玻片扫描仪 | Carl Zeiss | -- |
| 超声心动图 | Vevo 3100小动物超声成像系统 | Visual Sonics | -- |
| 动物手术 | 小动物呼吸机 | Kent Scientific Corp. | -- |
| 组织处理 | 组织脱水机 | Tissue-Tek, Sakura | -- |
| 质谱分析 | Agilent 1200系列高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| 4000-QTRAP质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| Agilent 1290 Infinity高效液相色谱二元泵系统 | Agilent Technologies | -- | |
| 6490-QQQ质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Western blot | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白提取 | 蛋白酶K | Merck | 1245680100 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Aars2fl/fl小鼠品系来源、他莫昔芬剂量和给药方案、TEPP-46剂量和给药频率 阅读提示:Materials and methods - Experimental animals |
| 心肌梗死模型 | 小鼠年龄、麻醉剂及剂量、左前降支结扎方法 阅读提示:Materials and methods - Adult mouse MI |
| 原代心肌细胞分离与转染 | 大鼠品系和日龄、胶原酶II和胰蛋白酶浓度、Aars2 siRNA序列、转染试剂及时间 阅读提示:Materials and methods - Isolation of NRCMs and transfection |
| Seahorse代谢分析 | 细胞接种密度、检测板、培养基、试剂浓度(ADP、oligomycin、FCCP、Rotenone、glucose、2-DG) 阅读提示:Materials and methods - Seahorse metabolic assays |
| 缺氧复氧处理 | 缺氧气体条件(0.1% O2)、缺氧和复氧时间 阅读提示:Materials and methods - Hypoxia and reoxygenation assay |
| Western blot | 抗体信息及稀释比例、蛋白提取方法(RIPA、Native提取) 阅读提示:Materials and methods - Western blot analysis |
| Ribo-Seq | 测序平台、建库方法、数据分析流程 阅读提示:Materials and methods - Ribosome profiling sequencing |