单细胞转录组学将禽冠状病毒初次免疫接种效果与抗原呈递细胞偏好相关联

安全有效的疫苗迫切需要用于预防和控制禽传染性支气管炎病毒（IBV），这是首个被发现的冠状病毒，尽管数十年来进行了广泛疫苗接种。然而，由于我们对初次免疫接种的理解有限，其开发受到阻碍，而初次免疫接种对于合理的疫苗设计至关重要。在此，我们构建了用减毒活疫苗或灭活IBV免疫的鸡的体内动态单细胞分辨率的血液免疫图谱。生物信息学分析结合体内检查揭示，减毒活疫苗和灭活疫苗通过不同机制重塑淋巴细胞并导致相同的组成。灭活疫苗通过树突状细胞激活T淋巴细胞，随后在初次免疫时依赖T淋巴细胞的B淋巴细胞扩增，但仅在加强免疫后诱导病原体特异性抗体。使用减毒活疫苗进行初次免疫接种导致初始偏好单核细胞/巨噬细胞作为抗原呈递细胞（APCs），随后广泛激活主要APC，这促进了快速的T淋巴细胞扩增并引发满意的体液免疫。随着APC利用的差异，减毒活疫苗和灭活疫苗产生了不同的TCR谱系，并引发了不同的B淋巴细胞动态，尽管它们最终的BCR库相似。此外，APC偏好与疫苗有效性相关，而非与疫苗类型相关，因为初次禽流感疫苗接种触发了有效的适应性免疫应答，其APC偏好与减毒活IBV相同。本研究全面表征了禽冠状病毒初次免疫接种，并强调了APC偏好的关键作用。