P. g-OMVs的提取与鉴定
获得并验证P. g-OMVs的形态和粒径特征。
通过超速离心法从P. g培养上清中提取P. g-OMVs,使用TEM观察形态,NTA分析粒径。
Porphyromonas gingivalis-OMVs promote the epithelial-mesenchymal transition of oral squamous cell carcinoma by inhibiting ferroptosis through the NF-κB pathway.
包含体外细胞实验(2D/3D迁移侵袭、增殖、EMT、铁死亡)、体内异种移植瘤模型,以及机制验证(NF-κB抑制剂和铁死亡激活剂/抑制剂干预)。
CAL-27人OSCC细胞系 SCC-9人OSCC细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
P. g-OMVs的浓度(3, 5, 10 μg/ml,后续选用5 μg/ml) erastin处理浓度(10 μM,48小时) BAY 11-7082处理浓度(10 μM,预处理1小时) 体内P. g-OMVs给药剂量(1 mg/kg,瘤内注射) 体内BAY 11-7082和Fer-1给药剂量(2.5 mg/kg和0.655 mg/kg,腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证P. g-OMVs的形态和粒径特征。
通过超速离心法从P. g培养上清中提取P. g-OMVs,使用TEM观察形态,NTA分析粒径。
评估P. g-OMVs对OSCC细胞增殖的影响。
将CAL-27和SCC-9细胞以5×10^3细胞/孔接种于96孔板,用不同浓度P. g-OMVs处理,通过CCK-8法检测细胞增殖,并用qRT-PCR和ICC检测Ki67和PCNA表达。
评估P. g-OMVs对OSCC细胞迁移和侵袭能力的影响。
使用transwell迁移和侵袭实验以及3D细胞迁移和侵袭实验,检测P. g-OMVs处理后的细胞迁移和侵袭能力。
评估P. g-OMVs对OSCC细胞EMT的影响。
通过H&E染色观察细胞形态变化,qRT-PCR检测E-cad、N-cad、Vimentin和MMP9的mRNA表达,免疫荧光检测E-cad和Vimentin蛋白表达。
验证P. g-OMVs是否通过NF-κB通路抑制铁死亡。
通过qRT-PCR检测GPX4、SLC7A11、PTSG2和TFR的mRNA表达,Western blot检测NF-κB磷酸化水平,并用NF-κB抑制剂BAY 11-7082处理细胞。
验证P. g-OMVs诱导的EMT是否由铁死亡抑制介导。
用P. g-OMVs和erastin处理细胞,通过qRT-PCR检测EMT标志物,H&E染色观察形态,免疫荧光检测E-cad和Vimentin表达。
评估P. g-OMVs对OSCC体内生长的影响及NF-κB/铁死亡通路的作用。
将SCC-9细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,建立异种移植瘤模型,分别给予P. g-OMVs、BAY 11-7082和Fer-1处理,测量肿瘤体积和重量,并通过H&E染色和IHC检测Ki67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| P. g培养 | 脑心浸液培养基 | HKM | 028360 |
| P. g-OMVs提取 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PM150210 |
| DMEM/F12培养基 | Procell | PM150312 | |
| 青霉素/链霉素抗生素 | Beyotime | C0222 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Oriscience | CB101 |
| Tecan Spark酶标仪 | Biotek | -- | |
| transwell侵袭实验 | 基质胶 | YEASEN | 40183ES08 |
| Western blot | 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling | 3033 |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling | 8241 | |
| β-actin抗体 | Bioss | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Solarbio | PE0010 | |
| 铁死亡激活剂处理 | erastin | Mackin | E872563 |
| NF-κB抑制 | BAY 11-7082 | MCE | 19542-67-7 |
| 体内实验 | Ferrostain-1 | MCE | HY-100579 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| P. g-OMVs提取 | 超速离心参数(175,000 g,1.5小时,两次) 阅读提示:见Methods中'P. g culture and P. g-OMVs identification'部分 |
| 细胞增殖实验 | P. g-OMVs浓度(5 μg/ml)和处理时间(24、48小时) 阅读提示:见Methods中'Cell proliferation assay'和Results中'P. g-OMVs promote the proliferation of OSCC' |
| 迁移和侵袭实验 | P. g-OMVs浓度(5 μg/ml),transwell迁移24小时,侵袭48小时,3D实验动态监测时间 阅读提示:见Methods中'Tumor cell migration and invasion assays' |
| 铁死亡相关基因检测 | P. g-OMVs处理时间(48小时) 阅读提示:见Methods中'Ferroptosis activator treatment'和Results中'P. g-OMVs inhibit the ferroptosis sensitivity of OSCC cells through the NF-κB pathway' |
| NF-κB抑制实验 | BAY 11-7082浓度(10 μM)和预处理时间(1小时) 阅读提示:见Methods中'Transcription factor nuclear factor kappa B (NF-κB) inhibition' |
| 体内异种移植瘤实验 | 细胞接种量(5×10^6),P. g-OMVs剂量(1 mg/kg),BAY 11-7082剂量(2.5 mg/kg),Fer-1剂量(0.655 mg/kg),给药频率和周期 阅读提示:见Methods中'In vivo mouse model and treatment' |