鉴定RXFP2作为AP特异性标志物
确定RXFP2是否仅在雄性和雌性鹿的AP组织中特异性表达。
通过比较AP与FP、LP的bulk RNA-seq数据和scRNA-seq数据,分析RXFP2在不同组织中的表达水平;通过免疫印迹验证蛋白水平表达。
RXFP2-positive mesenchymal stem cells in the antlerogenic periosteum contribute to postnatal development of deer antlers.
包含scRNA-seq、Bulk RNA-seq、CRISPR-Cas9敲除、细胞功能实验(增殖、凋亡、成骨分化)及裸鼠异种移植模型等多层级验证。
雄性梅花鹿鹿茸源性骨膜(AP)组织 雌性梅花鹿鹿茸源性骨膜(AP)组织 RXFP2+ APMCs细胞 裸鼠异种鹿茸移植模型
RXFP2+ APMCs的流式分选纯度 LRP6基因敲除效率(Western blot验证) CSF1R-IN-3给药剂量(0.2 mg/天,尾静脉注射) 异种移植模型构建及观察时间(21天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定RXFP2是否仅在雄性和雌性鹿的AP组织中特异性表达。
通过比较AP与FP、LP的bulk RNA-seq数据和scRNA-seq数据,分析RXFP2在不同组织中的表达水平;通过免疫印迹验证蛋白水平表达。
分离纯的RXFP2+ APMCs,并分析其与RXFP2- APMCs的转录差异。
通过流式细胞术分选THY1+RXFP2+和THY1+RXFP2- APMCs,进行bulk RNA-seq分析。
验证Wnt信号共受体LRP6在RXFP2+ APMCs激活中的作用。
使用CRISPR-Cas9敲除RXFP2+ APMCs中的LRP6基因,检测细胞增殖、凋亡和成骨分化能力的变化。
检验RXFP2+ APMCs是否通过IL-34招募M2巨噬细胞,并影响鹿茸发育。
使用CellChat分析配体受体对,并通过免疫荧光确认IL-34表达;在裸鼠异种移植模型中,用CSF1R抑制剂处理,观察巨噬细胞极化和软骨形成。
揭示RXFP2+ APMCs相比于BMSCs的独特性,特别是HOX基因表达和标志基因差异。
利用scRNA-seq数据比较RXFP2+ APMCs与人类、小鼠LEPR+ BMSCs的HOX基因表达和标志基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| RXFP2抗体 | Abclonal | -- | |
| LRP6抗体 | Abclonal | A22661 | |
| 山羊抗兔IgG | Solarbio | SE134 | |
| 增强化学发光检测试剂 | Thermo | -- | |
| 化学发光成像系统 | Tanon | -- | |
| 流式细胞术 | THY1抗体 | Abcam | ab307736 |
| 山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00013-2 | |
| BD FACSCelesta流式细胞仪 | BD | -- | |
| FACS Aria II分选系统 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞分选验证 | RXFP2抗体 | Abclonal | -- |
| 山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00013-4 | |
| 免疫荧光 | NEGR1抗体 | Bioss | bs-11095R |
| 山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00013-2 | |
| DAPI染料 | -- | -- | |
| EVOS M5000显微镜 | Thermo Fisher | -- | |
| 电转染 | NeonTM转染系统 | -- | -- |
| LRP6 sgRNA表达质粒 | -- | -- | |
| NG-Cas9质粒 | -- | -- | |
| 细胞活力 | 细胞计数试剂盒-8(CCK-8) | Apexbio | K1018 |
| 酶标仪 | Perlong | DNM-9606 | |
| 凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Beyotime | C1089 |
| 成骨分化 | 诱导试剂 | OriCell | HUXMX-90021 |
| 动物实验 | CSF1R抑制剂CSF1R-IN-3 | MCE | HY-139990 |
| CD11b抗体 | Bioss | bsm-54156R | |
| CD206抗体 | Abclonal | A21014 | |
| 组织免疫荧光 | IL34抗体 | Bioss | bs-18170R |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织样本采集 | 梅花鹿年龄(1岁)、性别、组织类型(AP、FP、LP)及生物学重复数(3) 阅读提示:Methods: Tissue sampling |
| 单细胞测序 | 细胞数量(约14,000-20,000)、10X Genomics Chromium平台、测序平台(Illumina HiSeq 6000) 阅读提示:Methods: Single-cell library construction and sequencing |
| 细胞分选 | THY1+细胞比例(86%)、RXFP2+细胞在THY1+中的比例(16%)、抗体稀释比例 阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis, cell sorting and Immunofluorescence confirmation |
| 基因敲除 | 电转条件(13500 V, 30 ms, 1 pulse)、质粒用量(LRP6 sgRNA 20μg, NG-Cas9 30μg)、细胞数量(3×10^6) 阅读提示:Methods: Cell electroporation and screening |
| 异种移植模型 | 小鼠品系(BALB/c-nu)、每组数量(6)、CSF1R-IN-3剂量(0.2 mg/天)及给药方式(尾静脉注射)、观察时间(21天) 阅读提示:Methods: Xenogeneic antler mouse model assay |