SCI大鼠模型建立与外泌体提取
建立脊髓损伤模型并从损伤脊髓组织提取外泌体,以研究其作用。
使用改良Allen法建立SCI大鼠模型,通过超速离心从损伤和正常脊髓组织提取外泌体,并通过TEM、NTA和Western blot进行表征。
Spinal cord injury-derived exosomes exacerbate damage: miR-155-5p mediates inflammatory responses.
包含体外BV2细胞实验、体内SCI大鼠模型、外泌体miRNA测序和qPCR验证、Western blot机制验证等多层级证据,并进行功能获得和抑制实验。
BV2小胶质细胞系 Sprague-Dawley大鼠SCI模型
SCI-Exos处理浓度(1×10^10颗粒/mL) BV2细胞培养条件(低糖DMEM,10%FBS,37°C,95%O2/5%CO2) agomiR-155-5p剂量(0.5 nmol/μL,10 μL鞘内注射) miR-155-5p mimic浓度(0-500 nM) LPS浓度(1 µg/mL)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立脊髓损伤模型并从损伤脊髓组织提取外泌体,以研究其作用。
使用改良Allen法建立SCI大鼠模型,通过超速离心从损伤和正常脊髓组织提取外泌体,并通过TEM、NTA和Western blot进行表征。
观察SCI-Exos是否被BV2细胞摄取并诱导M1极化。
用DiI标记的SCI-Exos和Sham-Exos处理BV2细胞,通过荧光显微镜观察摄取,并通过qPCR检测炎症因子表达和形态学观察。
评估SCI-Exos对脊髓损伤严重程度和神经功能的影响。
将SCI-Exos或PBS鞘内注射到假手术和SCI大鼠中,通过BBB评分评估运动功能,并通过HE、Nissl染色和Western blot评估组织病理和神经元损伤。
鉴定SCI-Exos中可能介导炎症反应的差异表达miRNA。
对SCI-Exos和Sham-Exos进行miRNA微阵列分析,筛选差异表达miRNA并用qPCR验证。
确定miR-155-5p是否促进小胶质细胞M1极化和炎症反应。
在体内使用agomiR-155-5p治疗SCI大鼠,在体外使用miR-155-5p mimics处理BV2细胞,检测炎症因子、趋化因子和M1标记物表达。
阐明SCI-Exos来源的miR-155-5p调控小胶质细胞M1极化的分子机制。
通过Western blot检测SCI-Exos或miR-155-5p mimic处理BV2细胞后FoxO3a磷酸化、NF-κB p65磷酸化和IκB表达,并使用miR-155-5p inhibitor进行回复实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 脊髓撞击器 | RWD | 68097 |
| 外泌体分离 | 0.1% II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 外泌体表征 | 透射电子显微镜 | Hitachi | HT-7700 |
| NanoFCM | -- | N30E | |
| Western blot | 抗CD9抗体 | Proteintech | 20597-1-AP |
| 抗CD81抗体 | Proteintech | 27855-1-AP | |
| 抗TSG101抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| 细胞培养 | 低糖DMEM培养基 | Meilunbio | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Meilunbio | -- | |
| 细胞毒性实验 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞计数试剂盒-8 | Meilunbio | -- | |
| 荧光标记 | DiI染料 | Meilunbio | -- |
| DiR染料 | Meilunbio | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染液 | Sigma-Aldrich | D9542-10MG |
| 抗IBA1抗体 | Abcam | ab283319 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11001 | |
| miRNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 小RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Sangon Biotech | -- | |
| Hiseq/Miseq测序系统 | Illumina | -- | |
| 体内实验 | agomiR-155-5p | Sangon Biotech | -- |
| agomiR-Nc | Sangon Biotech | -- | |
| 细胞转染 | riboFECT CP转染试剂 | RiboBio | -- |
| RNA提取与qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Promega | -- |
| GoTaq qPCR预混液 | Promega | -- | |
| Western blot | BCA试剂 | Beyotime | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| 抗NeuN抗体 | Proteintech | 26975-1-AP | |
| 抗p-FoxO3a抗体 | Abcam | ab47285 | |
| 抗FoxO3a抗体 | Abcam | ab23683 | |
| 抗p-NF-κB p65抗体 | Abcam | ab76302 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Abcam | ab16502 | |
| 抗IκBα抗体 | Proteintech | 10268-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG(H+L) HRP | Multi Sciences | GAR007 | |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD86抗体 | Bioss | bs-1035R |
| 山羊抗兔IgG H&L Alexa Fluor 594 | Invitrogen | A-11012 | |
| 组织学染色 | 尼氏染色液 | Solarbio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体分离与表征 | 酶消化时间、离心速度和时间、过滤孔径 阅读提示:Methods中的Exosome isolation and characterization部分 |
| 体外细胞实验 | SCI-Exos浓度、处理时间、细胞培养条件 阅读提示:Cell viability and cytotoxic assays和Culture conditions for cell lines部分 |
| 体内动物实验 | 动物品系、性别、年龄、体重、手术方法、SCI-Exos剂量和注射方式、BBB评分时间点 阅读提示:Establishment of the SCI rat model和Intrathecal administration部分 |
| miRNA干预实验 | agomiR剂量、注射方式、时间点,mimic/inhibitor浓度和转染试剂 阅读提示:In vivo miRNA agomir therapy和miRNA mimics and inhibitors transfection部分 |
| 机制检测 | 蛋白提取时间、抗体稀释比例、内参 阅读提示:Western blotting部分 |