验证HBsAg抑制IFNβ信号通路
评估HBsAg对I型干扰素产生的影响。
在THP-1细胞中通过LPS、poly(I:C)、HT-DNA刺激或SeV、HSV-1感染,检测IFNB1 mRNA水平;使用TRIF、RIG-I、cGAS等适配体激活IFNβ启动子报告基因;在IFNAR1敲除的Huh7细胞中检测病毒复制。
Hepatitis B surface antigen hijacks TANK-binding kinase 1 to suppress type I interferon and induce early autophagy.
包含体外细胞实验、体内转基因小鼠模型、患者肝组织样本,并进行了机制验证(如TBK1突变体、抑制剂)和功能验证(如自噬检测、病毒复制检测)。
Huh7肝癌细胞系 HepG2肝癌细胞系 HBsAg转基因小鼠(C57BL/6J-TgN(AlblHBV)44Bri) 慢性HBV患者肝组织
HBsAg与TBK1激酶结构域(KD)的相互作用 TBK1二聚化及TBK1-IRF3复合物破坏 TBK1-p62信号轴介导的自噬诱导 SNAP29启动子的抑制 BX795对TBK1活性的抑制浓度(1 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HBsAg对I型干扰素产生的影响。
在THP-1细胞中通过LPS、poly(I:C)、HT-DNA刺激或SeV、HSV-1感染,检测IFNB1 mRNA水平;使用TRIF、RIG-I、cGAS等适配体激活IFNβ启动子报告基因;在IFNAR1敲除的Huh7细胞中检测病毒复制。
确定HBsAg是否与TBK1结合及其结合结构域。
通过免疫共沉淀(IP)检测HBsAg与TBK1及其截短突变体的相互作用;共定位分析;在HBV感染的HepG2-hNTCP细胞中验证内源性相互作用。
探究HBsAg对TBK1和IRF3活化的影响。
转染HBs后检测TBK1和IRF3磷酸化水平;通过native PAGE检测TBK1和IRF3二聚化;通过核质分离检测IRF3核转位;使用TBK1突变体(EE、HIF等)验证二聚化依赖性。
检查HBsAg诱导的自噬是否依赖TBK1及p62。
在Huh7细胞中检测LC3转化和p62磷酸化;使用BX795抑制TBK1观察自噬的变化;在TBK1敲除细胞中回补TBK1或突变体,检测LC3转化和自噬体形成。
探索HBsAg阻碍自噬降解的分子机制。
检测自噬相关基因mRNA水平;构建SNAP29启动子荧光素酶报告基因检测启动子活性;通过mCherry-GFP-LC3质粒检测自噬流;检测LAMP1与LC3共定位。
研究TBK1活性对HBV复制的影响。
在Huh7细胞中抑制TBK1(BX795)或敲除TBK1,检测HBV DNA、HBsAg、HBeAg水平;使用3-MA或shATG7阻断自噬,观察对BX795作用的影响。
在动物模型中验证HBsAg对干扰素信号和自噬的影响。
HBs-Tg小鼠与WT小鼠注射poly(I:C)后检测肝组织IRF3核转位、干扰素和ISG表达;检测LC3、TBK1、p62、SNAP29表达及自噬体。
验证慢性HBV感染中先天免疫和自噬的变化。
收集慢性HBV和非HBV患者肝组织,进行免疫组化和免疫荧光染色检测p-TBK1、p-IRF3、p-p62、p62、SNAP29及LC3和LAMP1。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 阿霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂2000 | Invitrogen | 11668030 |
| 聚乙烯亚胺 | Sigma | 9002-98-6 | |
| 刺激与处理 | 脂多糖 | Sigma Aldrich | L2880 |
| Earle's平衡盐溶液 | Sigma Aldrich | E7510 | |
| 聚肌胞苷酸 | Sigma Aldrich | 31852-29-6 | |
| 胸腺DNA | Solarbio | D8050 | |
| 巴弗洛霉素A1 | Solarbio | A8510 | |
| BX795 | APExbio | A8222 | |
| 雷帕霉素 | APExbio | A8167 | |
| 氯喹 | APExbio | A8628 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | APExbio | A8353 | |
| 病毒制备与感染 | 聚乙二醇8000 | Sigma-Aldrich | 89610 |
| 蛋白提取与检测 | 蛋白酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | HY-K0012 |
| 蛋白A/G琼脂糖 | Pierce | 20421 | |
| 非变性凝胶上样缓冲液 | Servicebio | G2034-1ML | |
| 非变性凝胶 | Servicebio | G2042-50T | |
| RNA提取与检测 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| TRUEscript H Minus M-MuLV逆转录酶 | Aidlab Biotechnologies | PC1703 | |
| 通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal | RK21203 | |
| 荧光素酶检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E2920 |
| 电镜 | Polybed 812树脂 | Polysciences | 025950-1 |
| 透射电子显微镜(JEM-1400plus) | JEOL | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 | GraphPad | -- |
| 抗体 | 抗Flag抗体 | Medical & Biological Laboratories | M185-3L |
| 抗HA抗体 | Medical & Biological Laboratories | M180-3 | |
| 抗Myc抗体 | Medical & Biological Laboratories | M192-3 | |
| 抗TBK1抗体 | ABclonal | A3458 | |
| 抗磷酸化TBK1抗体 | ABclonal | AP1418 | |
| 抗IRF3抗体 | ABclonal | A19717 | |
| 抗磷酸化IRF3抗体 | ABclonal | AP1412 | |
| 抗p62抗体 | ABclonal | A19700 | |
| 抗LC3B抗体 | ABclonal | A19665 | |
| 抗BiP抗体 | ABclonal | A4908 | |
| 抗ATF4抗体 | ABclonal | A0201 | |
| 抗ATG7抗体 | ABclonal | A19604 | |
| 抗SNAP29抗体 | ABclonal | A4290 | |
| 抗LAMP1抗体 | ABclonal | A21194 | |
| 抗GAPDH抗体 | ProteinTech | 60004-1-Ig | |
| 抗GFP抗体 | ProteinTech | 66002-1-Ig | |
| 抗Lamin A/C抗体 | ProteinTech | 10298-1-AP | |
| 抗磷酸化p62抗体 | ImmunoWay | YP1505 | |
| 抗HBsAg抗体 | Bioss | bs-1557G | |
| 抗山羊IgG-Cy3 | Absin | abs20028 | |
| 抗小鼠IgG-CY3 | Absin | abs20142 | |
| 抗小鼠IgG-FITC | Absin | abs20012 | |
| 抗兔IgG-FITC | Absin | abs20023 | |
| 抗小鼠IgG-HRP | Biodragon | BF03001 | |
| 抗兔IgG-HRP | Biodragon | BF03008 | |
| 抗山羊IgG-HRP | Biodragon | BF03015 | |
| 病毒株 | 仙台病毒株 | -- | -- |
| 甲型流感病毒PR/8/34 (H1N1) | -- | -- | |
| 重组水疱性口炎病毒(VSV-GFP) | -- | -- | |
| 重组单纯疱疹病毒(HSV-GFP) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系:Huh7、HepG2、HepG2-hNTCP、HepAD38;培养基:DMEM/F-12、PMM;血清浓度:10% FBS;抗生素:100 U/ml青霉素、100 mg/ml链霉素;培养条件:5% CO2、37°C 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 刺激与感染 | LPS浓度:4 μg/ml;poly (I:C)浓度:10 μg/ml;HT-DNA浓度:10 μg/ml;SeV感染MOI:1;HSV-GFP/VSV-GFP感染 阅读提示:Materials and methods: Plasmids, antibodies, and reagents; Results: HBsAg negatively regulates IFNβ through TBK1 |
| 抑制剂处理 | BX795浓度:1 μM;BafA1浓度:100 nM;CQ浓度:10 μM;RAPA浓度:2.5 μM;3-MA浓度:2.5 mM 阅读提示:Materials and methods: Plasmids, antibodies, and reagents; Results: HBsAg-induced autophagy |
| 转染条件 | 转染试剂:Lipofectamine 2000、PEI;转染时间:例如24h、36h、48h 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 动物实验 | 小鼠品系:C57BL/6J-TgN (AlblHBV) 44Bri(HBs-Tg)和WT C57BL/6;年龄:9周龄;注射剂量:poly (I:C) 5 mg/kg;注射途径:尾静脉;注射体积:1 ml/kg PBS;观察时间:24h 阅读提示:Materials and methods: Mice; Results: HBsAg modulates innate immunity and autophagic flux in HBs-Tg mice |
| HBV制备与感染 | HepAD38细胞培养天数:3天;HBV浓缩:100倍;感染剂量:1000基因组当量;感染时间:约16小时 阅读提示:Materials and methods: Preparation of HBV from HepAD38 cells and infection with HepG2-hNTCP cells |
| 检测方法 | qRT-PCR引物序列:表S3;RNA提取:TRIzol;免疫印迹:抗体稀释浓度未明确;荧光显微镜:LC3阳性斑点计数30个细胞 阅读提示:Materials and methods: RNA quantification; Confocal microscopy; Evaluation of autophagy flux |