糖尿病模型建立与OTUD1表达检测
观察OTUD1在糖尿病伤口中的表达变化,并建立体内模型。
构建STZ诱导的T1DM和STZ+HFD诱导的T2DM小鼠模型,以及db/db小鼠模型,检测伤口组织中OTUD1的mRNA和蛋白表达。
OTUD1 delays wound healing by regulating endothelial function and angiogenesis in diabetic mice.
包含体外HUVECs细胞实验、OTUD1敲除和敲低小鼠模型、内皮特异性敲低db/db小鼠、质谱、BLI、免疫共沉淀及体内外功能验证和药理学回补实验,多种证据层级支持机制结论。
HUVECs细胞系(体外内皮模型) OTUD1敲除(OTUD1-/-)C57BL/6小鼠(T1DM和T2DM模型) db/db小鼠(自发性2型糖尿病模型,AAV2/BI30介导内皮特异性OTUD1敲低) Hek 293T细胞(用于机制研究)
OTUD1表达:HG+PA处理组与对照组比较,文献未明确说明统计学方法 OTUD1去泛素化β-catenin:需验证K496、K508、K625位点K63链的特异性 β-catenin核转位:需核对磷酸化状态与核浆分布变化 体内伤口愈合:需核对糖尿病模型(STZ/HFD)、伤口大小(6mm)、时间点(0/3/7/12天)及样本量 MSAB(β-catenin抑制剂)剂量:体内20 mg/kg,体外10 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察OTUD1在糖尿病伤口中的表达变化,并建立体内模型。
构建STZ诱导的T1DM和STZ+HFD诱导的T2DM小鼠模型,以及db/db小鼠模型,检测伤口组织中OTUD1的mRNA和蛋白表达。
验证OTUD1对内皮细胞功能的影响。
使用HG+PA处理HUVECs,进行基因沉默(siOTUD1)后检测迁移、管形成、NO释放和ROS水平。
寻找OTUD1的底物并验证直接结合。
通过免疫沉淀和质谱鉴定潜在结合蛋白,用免疫共沉淀、BLI和免疫荧光验证OTUD1与β-catenin的相互作用及共定位。
明确OTUD1对β-catenin的泛素化调控及具体位点。
在Hek 293T细胞中过表达或敲低OTUD1,检测β-catenin泛素化水平,利用泛素突变体和β-catenin位点突变体鉴定K63链和关键赖氨酸残基。
验证OTUD1缺失对β-catenin活性及下游信号的影响。
检测体内外模型中β-catenin磷酸化水平和核浆分布,以及下游血管生成相关因子表达。
验证OTUD1缺失对伤口愈合的改善作用是否依赖β-catenin。
在db/db小鼠中通过AAV2/BI30介导内皮特异性OTUD1敲低,并给予β-catenin抑制剂MSAB,观察伤口愈合、血管生成和纤维化指标。
在细胞水平确认OTUD1缺失的保护作用依赖β-catenin。
在HG+PA处理的OTUD1敲低HUVECs中给予MSAB,检测迁移、管形成、NO/ROS及相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 链脲佐菌素 | Sigma-Aldrich | S0130 |
| 高脂饮食 | Research Diets | D12492I | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞处理 | D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8270 |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 氧化应激检测 | 二氢乙啶 | Invitrogen | D11347 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Takara | 9109 |
| Hifair® III第一链cDNA合成预混液 | YEASEN | 11141ES10 | |
| SYBR Green预混液 | YEASEN | 11198ES08 | |
| 蛋白质提取 | 总蛋白提取试剂盒 | Kang Cheng Bioengineering | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Biosharp | BL612A | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Servicebio | G2007-1/2 | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Beyotime | P2055 | |
| BLI实验 | EZ-Link Sulfo-NHS-LC生物素化试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Octet RED96系统 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | FACSymphony A1流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
| 抗体 | CD31抗体 | R&D Systems | AF3628 |
| OTUD1抗体 | Bioss | bs-17563R | |
| 细胞角蛋白6A抗体 | Proteintech | 10590-1-AP | |
| 波形蛋白抗体 | Abcam | ab8978 | |
| β-catenin抗体 | Proteintech | 51067-2-AP | |
| Western blot | VEGFR2抗体 | ABclonal | A5609 |
| 磷酸化β-catenin抗体 | ABclonal | AP1076 | |
| 磷酸化eNOS抗体 | Proteintech | 28939-1-AP | |
| eNOS抗体 | Proteintech | 27120-1-AP | |
| JUP抗体 | Proteintech | 11146-1-AP | |
| CD44抗体 | Proteintech | 30854-1-AP | |
| ITGA3抗体 | Proteintech | 21992-1-AP | |
| LaminB抗体 | Proteintech | 66095-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 免疫共沉淀 | Flag标签抗体 | Proteintech | 66095-1-Ig |
| His标签抗体 | Proteintech | 10001-0-AP | |
| 小鼠抗兔IgG HRP | Abmart | M21006 | |
| 荧光二抗 | Alexa Fluor® 488偶联山羊抗兔IgG | Servicebio | GB25303 |
| Cy3偶联山羊抗兔IgG | Servicebio | GB21303 | |
| Cy3偶联山羊抗小鼠IgG | Servicebio | GB21301 | |
| Cy3偶联兔抗山羊IgG | Proteintech | SA00009-4 | |
| 免疫荧光 | 四色荧光试剂盒 | Recordbio Biological Technology | RC0086 |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus-transfection® SA | 114-15 |
| 药物处理 | MSAB(β-catenin抑制剂) | MedChemExpress | HY-120697 |
| 管形成实验 | 基质胶 | Corning | 354230 |
| ELISA? | DCFH-DA试剂盒 | -- | -- |
| NO检测 | DAF-FM DA探针 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 糖尿病模型建立 | T2DM:HFD(60.3 kcal% fat)16周,第8周起STZ 35 mg/kg腹腔注射连续3天;T1DM:STZ 120 mg/kg单次腹腔注射;确认FBG>11 mmol/L 阅读提示:见Materials and methods 'STZ combined high-fat diet (HFD)-induced T2DM model' 和 'STZ-induced T1DM model' |
| 内皮特异性OTUD1敲低 | AAV2/BI30-shOTUD1(5×10^11 vg, 200 μL)尾静脉注射,shRNA序列GCTCAGCAATGGACACTATGACTCGAGTCATAGTGTCCATTGCTGAGCTTTTT 阅读提示:见 'Endothelial-specific knockdown of OTUD1 in db/db mice' |
| 伤口模型 | 6mm全层皮肤缺损,3%异氟烷麻醉,观察时间点0/3/7/12天,第12天取样 阅读提示:见 'Skin wound model' |
| 细胞处理 | HUVECs处理:50 mM D-glucose + 300 μM PA,处理时间4h(迁移/管形成24h),siRNA浓度60 nM 阅读提示:见 'Culture and staining of cells' 和 'Cell migration and tube formation assays' |
| β-catenin抑制 | MSAB浓度:体内20 mg/kg隔日一次共2周;体外10 μM预处理1h 阅读提示:见 'Endothelial-specific knockdown of OTUD1 in db/db mice' 和 'OTUD1 knockdown mitigates HG + PA-induced endothelial dysfunction via β-catenin translocation' |
| 去泛素化检测 | MG132浓度10 μM处理6h;β-catenin突变体K496R/K508R/K625R/3KR;泛素突变体K48-only, K63-only, K63R 阅读提示:见 'OTUD1 promotes β-catenin activation through deubiquitylation' |
| 统计方法 | 正态性Shapiro-Wilk检验;方差齐性F检验或Brown-Forsythe检验;组间比较t检验或Welch's t检验;多组比较one-way或two-way ANOVA及Bonferroni post-hoc;非正态Kruskal-Wallis及Dunn's post-hoc;显著性P<0.05 阅读提示:见 'Statistical analysis' |