斑马鱼MAFLD模型构建与优化
确定诱导斑马鱼MAFLD的最佳饲料胆固醇和脂肪添加量
通过正交试验,分别喂食不同脂肪含量(实验1)和不同胆固醇/脂肪组合(实验2)的饲料6周,检测体长、体重、BMI,确定最佳造模条件。
An integrative pharmacology-based study on the pharmacological activity and mechanism of xiaoji-chenpi formula (XCF) against MAFLD.
包含斑马鱼MAFLD模型建立与药物筛选、小鼠HFD模型药效验证、HPLC成分分析、转录组学及Western blot机制验证等多个独立证据层级,并具有阳性药物对照。
雌性AB品系成年斑马鱼MAFLD模型(4%胆固醇和20%脂肪饲料诱导) 雄性昆明小鼠MAFLD模型(高脂饮食诱导)
斑马鱼饲料中胆固醇和脂肪添加量:4%和20% XCF给药方式:斑马鱼5 mg/L浸泡12小时/天,小鼠200 mg/kg灌胃,持续12周 小鼠分组:NC、HFD、XCF组,每组n=8 转录组学与Western blot涉及的肝脏组织样本:小鼠n=3,斑马鱼n=5(组织学) 阳性对照药物:斑马鱼实验中使用水飞蓟素和白藜芦醇(5 mg/L)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定诱导斑马鱼MAFLD的最佳饲料胆固醇和脂肪添加量
通过正交试验,分别喂食不同脂肪含量(实验1)和不同胆固醇/脂肪组合(实验2)的饲料6周,检测体长、体重、BMI,确定最佳造模条件。
比较XCF、XJF及阳性药物对斑马鱼MAFLD的药理活性
使用构建的斑马鱼MAFLD模型,通过浸泡给药方式处理XCF、XJF、白藜芦醇和水飞蓟素,检测BMI、肝脏H&E染色评估药物效果。
鉴定XCF中主要活性化合物及其含量
采用HPLC法,通过与标准品比对保留时间和紫外光谱,鉴定XCF中的主要峰成分,并计算含量。
评估XCF对HFD诱导的MAFLD小鼠模型的药理活性
使用HFD喂养建立小鼠MAFLD模型,通过灌胃给予XCF提取物,检测血浆和肝脏生化指标,并进行肝脏组织学染色评估脂质积聚、炎症和纤维化情况。
寻找XCF改善MAFLD的潜在关键基因和通路
采用RNA-seq对小鼠肝脏组织进行转录组分析,通过差异表达基因筛选、功能富集分析和PPI网络构建,结合GeneCards数据库鉴定关键基因。
验证转录组学筛选出的关键基因在蛋白水平的表达变化
提取小鼠肝脏总蛋白,通过Western blot检测脂质代谢(INSIG1、SREBP1、FASN、ACC)、纤维化(SPP1、LGALS3)和炎症(IL-1β、TNF-α)相关蛋白的表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 生化检测 | 总胆固醇(TC)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 |
| 甘油三酯(TG)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 | |
| 低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A113-1-1 | |
| 高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A112-1-1 | |
| 丙氨酸氨基转移酶(ALT)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C009-2-1 | |
| 天冬氨酸氨基转移酶(AST)试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C011-2-1 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Qiagen | -- |
| RNA测序 | Illumina TruSeqTM RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | LC Science | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| BCA试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| 抗TNF-α抗体 | Proteintech | 17590-1-AP | |
| 抗SPP1抗体 | Proteintech | 30200-1-AP | |
| 抗LGALS3抗体 | Proteintech | 14979-1-AP | |
| 抗INSIG1抗体 | Proteintech | 55282-1-AP | |
| 抗SREBP1抗体 | Proteintech | 14088-1-AP | |
| 抗ACC抗体 | ABclonal | A15606 | |
| 抗FASN抗体 | Bioss | bs-1498R | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗兔二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 增强化学发光(ECL)检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| HPLC分析 | 绿原酸标准品 | Shanghai Yuanye Biological Technology Co., Ltd. | B20782 |
| 柚皮苷标准品 | Shanghai Yuanye Biological Technology Co., Ltd. | B21594 | |
| 橙皮苷标准品 | Shanghai Yuanye Biological Technology Co., Ltd. | B20182 | |
| 槲皮素标准品 | Shanghai Yuanye Biological Technology Co., Ltd. | B20527 | |
| 动物实验 | 白藜芦醇 | -- | -- |
| 水飞蓟素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 斑马鱼MAFLD模型构建 | 斑马鱼品系、性别、年龄;饲料脂肪和胆固醇含量(最佳为20%脂肪和4%胆固醇);喂养周期6周;每日喂食次数 阅读提示:Methods 2.3.1 斑马鱼实验;Figure 1 |
| 斑马鱼药物筛选实验 | XCF、XJF、白藜芦醇、水飞蓟素处理浓度(5 mg/L);浸泡时间(12小时/天);处理周期(6周);样本量(每组n=8) 阅读提示:Methods 2.3.1 实验3;Figure 2 |
| XCF的HPLC分析 | 色谱柱型号(Shim-pack GIST C18-AQ);流动相(100%甲醇和0.2%磷酸水);流速(1.0 mL/min);检测波长(276 nm和254 nm);标准品来源与货号 阅读提示:Methods 2.2;Figure 3 |
| 小鼠MAFLD模型建立与XCF给药 | 小鼠品系、性别、周龄(6周龄雄性昆明小鼠);分组(NC、HFD、XCF,每组n=8);高脂饲料持续时间(12周);XCF给药剂量(200 mg/kg)和方式(口服灌胃);溶剂(80 mg/mL水溶液) 阅读提示:Methods 2.3.2;Figure 4 |
| 转录组学分析 | 肝脏组织样本量(每组n=3);测序平台(Illumina NovaSeq 6000);参考基因组版本;差异表达基因筛选标准(P-adjust <0.05且|log2FC|≥1) 阅读提示:Methods 2.6;Figure 5 |
| Western blot验证 | 肝脏组织样本量(每组n=3);抗体种类、稀释比例及来源;内参蛋白(β-actin) 阅读提示:Methods 2.7;Figure 6 |