miRNA-27a表达与迁移评估
检测miRNA-27a在成骨分化中的表达变化及对细胞迁移的影响。
通过RT-qPCR检测成骨诱导培养基中miRNA-27a的表达;划痕实验评估miRNA-27a过表达对hDPSCs迁移的影响。
MicroRNA-27a transfected dental pulp stem cells undergo odonto/osteogenic differentiation via targeting DKK3 and SOSTDC1 in Wnt/BMP signaling in vitro and enhance bone formation in vivo.
包含体外细胞分化实验、荧光素酶报告基因验证靶点、动物体内移植实验及免疫组化等多层级验证。
hDPSCs(人牙髓干细胞) 小鼠颅骨缺损模型 小鼠背部皮下移植模型
miRNA-27a-5p mimic/inhibitor转染hDPSCs LiCl (20 mM)作为Wnt信号激活剂 3D Honeycomb Boosted collagen scaffold(Koken, Tokyo, Japan) miRNA-27a靶基因DKK3和SOSTDC1的3'UTR结合位点验证 动物实验使用雄性ICR小鼠(n=6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测miRNA-27a在成骨分化中的表达变化及对细胞迁移的影响。
通过RT-qPCR检测成骨诱导培养基中miRNA-27a的表达;划痕实验评估miRNA-27a过表达对hDPSCs迁移的影响。
评估miRNA-27a对hDPSCs牙/成骨分化能力的影响。
用miRNA-27a mimic或inhibitor转染hDPSCs,在成骨培养基中培养,检测成骨标记物、ALP活性和矿化结节形成。
验证miRNA-27a是否通过调控Wnt信号影响分化。
检测miRNA-27a过表达对Wnt报告基因活性、β-catenin核转位及Wnt信号相关分子表达的影响。
验证DKK3和SOSTDC1是否为miRNA-27a的直接靶基因。
通过qPCR和Western blot检测miRNA-27a过表达/抑制对DKK3和SOSTDC1表达的影响;双荧光素酶报告基因检测验证3'UTR结合位点。
验证miRNA-27a是否通过调控BMP信号影响分化。
检测miRNA-27a过表达对BMP信号分子(GREM1、pSMAD1/5、SMAD4)表达的影响。
评估miRNA-27a过表达的hDPSCs在体内促进新骨形成的能力。
将转染miRNA-27a mimic或NC的hDPSCs接种于胶原支架,移植入小鼠颅骨缺损和背部皮下,28天后进行micro-CT、组织学染色和免疫组化分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Fujifilm Wako Pure Chemical | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗生素和抗真菌溶液 | Fujifilm Wako | -- | |
| 转染 | mirVana miRNA模拟物 hsa-miRNA-27a-5p | Thermo Fisher Scientific | -- |
| mirVana miRNA抑制剂 hsa-miRNA-27a-5p | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| mirVana miRNA模拟物阴性对照#1 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| mirVana miRNA抑制剂阴性对照#1 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 成骨分化 | β-甘油磷酸 | Fujifilm Wako | -- |
| 抗坏血酸 | Fujifilm Wako | -- | |
| 地塞米松 | Fujifilm Wako | -- | |
| LabAssay ALP试剂盒 | Fujifilm Wako | -- | |
| 茜素红S | Fujifilm Wako | -- | |
| 甲醇 | Fujifilm Wako | -- | |
| 萘酚ASMX磷酸盐 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 快蓝BB盐 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氯化镁 | Fujifilm Wako | -- | |
| RNA提取和cDNA合成 | QuickGene RNA培养细胞试剂盒S | Fujifilm Wako | -- |
| PrimeScript™ RT预混液 | Takara Bio | -- | |
| RT-qPCR | GoTaq qPCR预混液 | Promega | -- |
| CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| miRNA表达检测 | mirVana miRNA分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| MicroRNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TaqMan通用预混液II | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blotting | cOmplete蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- |
| PhosSTOP磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| NE-PER核和胞质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Immobilon P聚偏二氟乙烯膜 | Merck Millipore | -- | |
| PVDF封闭试剂 | Toyobo | -- | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #37447 | |
| 抗Lamin B1抗体 | GeneTex | GTX103292 | |
| 抗DKK3抗体 | Proteintech Group, Inc. | #10365-1-AP | |
| 抗SOSTDC1抗体 | Abcam | ab99340 | |
| 抗LEF1抗体 | Cell Signaling Technology | #2230 | |
| 抗TCF7抗体 | Cell Signaling Technology | #2203 | |
| 抗SMAD4抗体 | Cell Signaling Technology | #9515 | |
| 抗磷酸化SMAD1/5抗体 | Cell Signaling Technology | #9516 | |
| HRP标记的抗微管蛋白抗体 | Medical & Biological Laboratories | PM054-7 | |
| HRP标记的抗GAPDH抗体 | Medical & Biological Laboratories | PM053-7 | |
| HRP标记的抗兔IgG抗体 | Promega | W4011 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG抗体 | Promega | W4021 | |
| Immobilon底物 | Merck Millipore | -- | |
| LAS-3000 mini成像系统 | Cytiva | -- | |
| 免疫荧光 | 8孔腔室玻片 | IbidiFitchburg | -- |
| 正常驴血清 | Abcam | -- | |
| Triton X-100 | Fujifilm Wako | -- | |
| 抗RUNX2抗体 | Cell Signaling Technology | #12556 | |
| 抗骨钙素抗体 | Cell Signaling Technology | #59757 | |
| Alexa Fluor 568标记的抗小鼠IgG | Abcam | ab175472 | |
| Alexa Fluor 488标记的抗兔IgG | Abcam | ab150073 | |
| 含DAPI的封片剂 | Abcam | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜(Leica TCS-SP8) | Leica Microsystems | -- | |
| 荧光素酶实验 | pGL4.49[luc2P/TCF-LEF/Hygro]载体 | Promega | -- |
| pMIR-REPORT载体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 动物实验 | 3D蜂窝增强胶原支架 | Koken | -- |
| 显微计算机断层扫描(inspeXio SMX-100CT) | Shimadzu | -- | |
| 免疫组化 | 抗BCL9抗体 | Bioss Antibodies | bs-12393R |
| DAB底物试剂盒 | Abcam | ab64264 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | hDPSCs来源:新鲜拔除的智齿(n=7);培养基:α-MEM + 10% FBS + 抗生素和抗真菌溶液;培养条件:37°C,5% CO2;使用2-6代细胞 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 转染 | miRNA-27a mimic/inhibitor及阴性对照;转染试剂:Lipofectamine RNAiMAX;转染浓度未明确说明 阅读提示:Materials and methods, miRNA-27a-5p mimic/inhibitor transfection |
| 成骨分化 | 成骨培养基组成:10 mM β-甘油磷酸、50 mg/L抗坏血酸、10 nM地塞米松;培养时间及换液频率 阅读提示:Materials and methods, Odonto/osteoblastic differentiation |
| Wnt信号检测 | LiCl浓度:20 mM;Wnt报告基因载体;检测方法 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and Luciferase assay; Results, Fig. 3 |
| 体内实验 | 动物:雄性ICR小鼠(n=6);细胞数量:1×10^5;支架:3D Honeycomb Boosted collagen scaffold;颅骨缺损直径:2.5 mm;移植时间:28天;麻醉:Ketamine/Xylazine (100/10 mg/kg) 阅读提示:Materials and methods, Animal experiments; Results, Fig. 7 |