建立慢性镉处理细胞模型
模拟长期低剂量镉暴露,诱导细胞恶性转化。
使用1 μmol/L CdSO4处理Beas-2B细胞40代,观察细胞形态、增殖、迁移和凋亡变化。
RNA m6A involves in regulation of oxidative stress and apoptosis may via NF-kB pathway in cadmium-induced lung cells.
包含细胞模型(Beas-2B长期处理)、动物模型(小鼠饮水染毒)、蛋白质组学、功能验证(增殖、迁移、凋亡)及机制验证(m6A通路、NF-κB/NRF2),证据层级独立。
Beas-2B细胞(人支气管上皮细胞) C57BL/6J小鼠(镉暴露模型) 小鼠肺组织
细胞模型:Beas-2B细胞,1 μmol/L CdSO4处理40代 动物模型:C57BL/6J雄性小鼠,饮水暴露50、100、200 mg/L CdSO4,持续18周 m6A抑制剂处理:2.5 μmol/L DAA处理72小时 凋亡检测:Hoechst 33258染色、TUNEL染色 机制验证:Western blot检测NF-κB、NRF2、NQO1、SOD2等蛋白表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟长期低剂量镉暴露,诱导细胞恶性转化。
使用1 μmol/L CdSO4处理Beas-2B细胞40代,观察细胞形态、增殖、迁移和凋亡变化。
探究慢性镉暴露对m6A修饰及其调节蛋白的影响。
通过比色法检测总RNA m6A水平,Western blot检测FTO、ALKBH5、YTHDC2蛋白表达。
验证m6A修饰在镉诱导恶性表型中的功能作用。
使用m6A抑制剂DAA处理Passage 40细胞,检测m6A水平、细胞活力、克隆形成、凋亡、迁移。
识别镉诱导恶性表型中的关键差异蛋白和信号通路,并预测关键mRNA的m6A修饰位点。
对Passage 0和40细胞进行蛋白质组学分析,KEGG富集,预测NF-κB p65和NQO1 mRNA的m6A位点。
探究m6A抑制剂对氧化应激及NF-κB/NRF2通路的影响。
检测ROS、MDA、GSH、SOD活性,Western blot检测NF-κB p65、NRF2、SOD2、NQO1表达。
在体内验证慢性镉暴露对肺组织的影响及m6A修饰变化。
小鼠饮水暴露CdSO4 18周,检测肺组织病理、凋亡、氧化指标、m6A水平及调节蛋白表达。
验证m6A调节蛋白与NF-κB在肺组织中的共定位关系。
通过免疫荧光检测FTO、YTHDC2与NF-κB的共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | Gibco Life Technologies | -- | |
| m6A抑制剂处理 | 3-脱氮腺苷 | Yuanye Bio-Technology Co., Ltd. | -- |
| CCK8实验 | CCK8试剂 | Nanjing Jiancheng Technology Co., Ltd. | -- |
| 细胞凋亡检测 | Hoechst 33258染液 | -- | -- |
| 克隆形成实验 | 吉姆萨染液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | -- | -- |
| ROS检测试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 蛋白质组学 | 非标记定量蛋白质组学服务 | Shanghai Zhongke New Life Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| H&E染色 | 伊红 | -- | -- |
| 二甲苯 | -- | -- | |
| TUNEL检测 | TUNEL DAB原位显色试剂盒 | Wuhan Saiweier Biotechnology Co., Ltd | -- |
| 蛋白酶K | -- | -- | |
| 免疫荧光 | NF-κB p65抗体 | Abcam | AB32536 |
| YTHDC2抗体 | Proteintech | 27779-1-AP | |
| FTO抗体 | Abcam | AB280081 | |
| RT-PCR | 总RNA提取试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| Quant cDNA第一链合成试剂盒 | -- | -- | |
| 超微量紫外-可见分光光度计 | Hangzhou Suizhen Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| QuantStudio 3 & 5实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SuperReal荧光定量预混试剂盒 | Tiangen Biotech | -- | |
| m6A检测 | EpiQuick RNA甲基化定量试剂盒 | Epigentek Group Inc. | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| YTHDC2抗体 | Proteintech | 27779-1-AP | |
| FTO抗体 | Proteintech | 27226-1-AP | |
| ALKBH5抗体 | Proteintech | 16837-1-AP | |
| Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| NRF2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| SOD2抗体 | Proteintech | 24127-1-AP | |
| NQO1抗体 | Proteintech | 11451-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| NF-κB p65抗体 | Abcam | AB32536 | |
| 氧化应激指标检测 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 总SOD活性检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| GSH-PX检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | -- | -- |
| DAPI染液 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 75 cm2培养瓶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型建立 | Beas-2B细胞来源、培养条件、CdSO4浓度(1 μmol/L)、处理时间(40代)、传代方式 阅读提示:见Methods部分“Cell culture and cadmium treatment” |
| m6A抑制剂处理 | DAA浓度(2.5 μmol/L)、处理时间(72小时)、细胞代次(Passage 0和40) 阅读提示:见Results部分“Effect of m6A inhibitor DAA treatment”和Methods部分“Cell apoptosis was detected by Hoechst 33258 staining” |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、体重、CdSO4浓度(0, 50, 100, 200 mg/L)、饮水暴露时间(18周)、饲养条件 阅读提示:见Methods部分“Animal feeding and cadmium treatment”和Results部分“The pathology of lung tissue sections in mice” |
| m6A检测 | RNA提取方法、RNA质量(OD260/280)、试剂盒(EpiQuick)、上样量(200 ng)、阳性/阴性对照 阅读提示:见Methods部分“Levels of m6A modification on total RNA was detected by colorimetric assay” |
| Western blot | 蛋白上样量(50 μg)、抗体稀释比例、二抗浓度、曝光时间 阅读提示:见Methods部分“Protein expressions were detected by western blot”和Table 3 |