组织样本中PLEC表达检测
验证PLEC在卵巢癌组织中的表达水平是否高于正常组织
使用包含正常卵巢组织和多种卵巢癌亚型的组织微阵列进行免疫组化染色,检测PLEC表达并统计H-Score。
Plectin, a novel regulator in migration, invasion and adhesion of ovarian cancer.
包含细胞系体外功能实验(增殖、迁移、侵袭、黏附)、动物皮下移植瘤和原位瘤模型,以及免疫组化和蛋白互作机制验证,多个独立证据层级。
人卵巢癌细胞系SKOV3 人卵巢癌细胞系A2780 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 BALB/c裸鼠原位移植瘤模型
PLEC敲低效率通过Western blot和qRT-PCR验证 细胞增殖检测:CCK-8和克隆形成实验 迁移和侵袭:划痕实验和Transwell实验(含Matrigel) 体内实验:皮下和原位移植瘤模型,肿瘤体积和转移灶计数 机制验证:通过STRING预测和免疫荧光共定位、免疫组化验证与COL17A1和ITGβ4的关联
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PLEC在卵巢癌组织中的表达水平是否高于正常组织
使用包含正常卵巢组织和多种卵巢癌亚型的组织微阵列进行免疫组化染色,检测PLEC表达并统计H-Score。
建立PLEC敲低的卵巢癌细胞系以研究其功能
通过慢病毒载体携带PLEC shRNA转染SKOV3和A2780细胞,经嘌呤霉素筛选,并用Western blot和qRT-PCR验证敲低效率。
评估PLEC敲低对卵巢癌细胞增殖、迁移、侵袭和黏附的影响
分别进行CCK-8实验、克隆形成实验、划痕实验、Transwell迁移和侵袭实验、细胞分离实验和黏附实验。
验证PLEC在体内对肿瘤生长和转移的影响
将A2780对照和PLEC敲低细胞皮下注射BALB/c裸鼠构建皮下移植瘤模型,测量肿瘤体积;同时原位注射到卵巢,5周后通过IVIS成像和肉眼观察统计转移灶。
揭示PLEC调控细胞黏附的分子机制
利用STRING数据库预测与PLEC互作的蛋白,选择COL17A1和ITGβ4进行免疫荧光共定位、免疫组化验证,并通过siRNA敲低COL17A1和ITGβ4观察对黏附的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MCCOY'S 5A培养基 | Solarbio | -- |
| 1640培养基 | Hyclone, Cytiva | -- | |
| 胎牛血清 | TIANHANG | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | -- | |
| 蛋白提取 | 柱式组织/细胞蛋白提取试剂盒 | Epizyme | -- |
| Western blot | SDS-PAGE上样缓冲液 | Rui Biotech | RB005-001 |
| Plectin抗体 | Abcam | ab32528 | |
| β-actin抗体 | Abways | AB0501 | |
| AffiniPure山羊抗兔IgG H&L/HRP | Bioss | bs-40295G-HRP | |
| Omni-ECL™Femto超敏化学发光试剂盒 | Epizyme | SQ201 | |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | BioFlux | BSC52M1 |
| cDNA合成 | ReverTra Ace® qPCR RT试剂盒 | TOYOBO | FSQ-101 |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | TransGen | AQ601 |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | Proteintech | -- |
| 划痕实验 | 光学显微镜CKX53 | Olympus | CKX53 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| Transwell侵袭实验 | 基质胶 | Corning | 354234 |
| 细胞分离实验 | 胰酶-EDTA溶液 | Solarbio | -- |
| 黏附实验 | 细胞黏附检测试剂盒 | BestBio Company | -- |
| 免疫荧光 | Plectin抗体 | Abcam | ab32528 |
| COL17A1抗体 | Abcam | ab184996 | |
| ITGβ4抗体 | Abcam | ab182120 | |
| Cy3标记山羊抗兔IgG (H+L) | Beyotime | A0516 | |
| FITC标记山羊抗兔IgG (H+L) | Beyotime | A0562 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜TCS SP8 | Leica | TCS SP8 | |
| 免疫组化 | 卵巢癌组织微阵列 | Alenabio | Ova-809 |
| 山羊两步法检测试剂盒 | ZSGB-BIO | PV-9003 | |
| 光学显微镜U-HGLGPS | Olympus | U-HGLGPS | |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠 | Charles River | -- |
| 基质胶 | Corning | 354248 | |
| 体内成像 | IVIS Spectrum成像系统 | PerkinElmer | PE IVIS Spectrum |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PLEC表达检测 | 组织微阵列类型、抗体稀释比例、H-Score评分标准 阅读提示:见Materials and methods中Immunohistochemical analysis及Fig.1 legend |
| 构建PLEC敲低细胞系 | 慢病毒MOI、感染时间、嘌呤霉素筛选浓度、验证方法 阅读提示:见Materials and methods中Lentivirus infection和Fig.2 legend |
| 细胞增殖实验 | 细胞接种密度、检测时间点、CCK-8孵育时间、克隆形成时间 阅读提示:见Materials and methods中Colony formation和CCK-8 assay及Fig.3 legend |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞接种数、Matrigel用量、固定和染色时间、观察时间点 阅读提示:见Materials and methods中Cell migration and invasion assays及Fig.4和Fig.5 legend |
| 黏附实验 | 细胞接种密度、孵育时间、染色和测定时间 阅读提示:见Materials and methods中Adhesion assay和Dissociation assay及Fig.6和Fig.7 legend |
| 体内实验 | 小鼠品系、周龄、每组数量、细胞注射数量和体积、肿瘤测量频率 阅读提示:见Materials and methods中In vivo assays及Fig.3和Fig.4 legend |
| 机制验证 | STRING预测参数、抗体信息、siRNA序列和转染条件 阅读提示:见Results中PLEC modulates cell adhesion...及Materials and methods中siRNA transfection |