分析OSM和LOXL2表达及预后关联
评估OSM和LOXL2在PDAC中的表达及其与患者生存的关系
利用TCGA、GTEx和GSE62165数据集进行差异表达、生存、ROC和免疫浸润分析。
β-Catenin mediated TAM phenotype promotes pancreatic cancer metastasis via the OSM/STAT3/LOXL2 axis.
包含体外细胞共培养、siRNA敲低、药理学抑制、体内皮下和尾静脉转移模型、RNA-seq和scRNA-seq等多层级验证,并明确机制通路。
THP-1来源巨噬细胞 PANC-1和SW1990人PDAC细胞系 Panc02小鼠PDAC细胞系 C57BL/6小鼠皮下移植瘤和尾静脉肺转移模型
THP-1细胞用10 ng/ml PMA分化24小时,恢复24小时 TAM诱导使用50%肿瘤条件培养基处理48小时 XAV939(5 μM)预处理24小时抑制β-catenin OSM重组蛋白浓度5、10、20 ng/ml处理24或48小时 体内模型使用1×10^6 Panc02细胞,皮下或尾静脉注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估OSM和LOXL2在PDAC中的表达及其与患者生存的关系
利用TCGA、GTEx和GSE62165数据集进行差异表达、生存、ROC和免疫浸润分析。
鉴定PDAC微环境中OSM+ TAM的存在及其β-catenin信号激活状态
对GSE212966数据集进行单细胞转录组分析,聚类并比较正常和肿瘤组织,分析TAMs中CTNNB1和OSM表达。
建立TAM体外模型并验证其混合极化表型
THP-1经PMA分化后,用肿瘤条件培养基(TCM)诱导TAM,通过Western blot、流式、免疫荧光和RNA-seq表征。
评估TAM来源因子对PDAC细胞增殖、迁移、侵袭和体内转移的影响
用MCM处理PDAC细胞,进行CCK-8、Transwell迁移和侵袭实验,以及在Panc02皮下和尾静脉转移模型中验证。
确定β-catenin信号是否调节TAM极化和OSM产生
使用XAV939(β-catenin抑制剂)或siCTNNB1处理TAM,检测β-catenin靶基因、极化标志物和OSM表达;使用IWP-2抑制Wnt分泌。
阐明TAM来源OSM诱导PDAC细胞EMT的分子机制
通过OSM或IL6ST敲低、重组人OSM刺激、STAT3抑制剂WP1066和LOXL2抑制剂CMH处理,检测EMT标志物和LOXL2表达。
评估TAM条件培养基在体内对PDAC生长和转移的影响
Panc02细胞经MCM预处理后,皮下或尾静脉注射入C57BL/6小鼠,监测肿瘤体积和肺转移结节。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875093 |
| 胎牛血清 | Gibco | 26140079 | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 药物处理 | 佛波酯 | MilliporeSigma | P8139 |
| XAV939 | MedChemExpress | HY-15147 | |
| IWP-2 | MedChemExpress | HY-13912 | |
| WP1066 | AbMole | M2125 | |
| CMH | AbMole | M14566 | |
| 二甲基亚砜 | Beyotime | ST2336 | |
| 重组人OSM | Arcobiosystems | OSM-H5213 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 条件培养基制备 | 0.22 μm过滤器 | MilliporeSigma | SLGP033NS |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| 细胞迁移侵袭检测 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 基质胶 | Corning | 354234 | |
| 结晶紫 | MilliporeSigma | V5265 | |
| 免疫印迹 | SDS裂解液 | Beyotime | P0013G |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| PVDF膜 | MilliporeSigma | IPVH00010 | |
| 封闭液 | Wuhan Boster Biological Technology | AR0041 | |
| HRP标记二抗 | ProteinTech | SA00001-2 | |
| 流式细胞术 | 流式染色缓冲液 | ProteinTech | PF00018 |
| FITC标记抗CD206抗体 | ProteinTech | FITC-65155 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio | RR047B |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25743 | |
| 免疫荧光 | 共聚焦培养皿 | NEST | 801002 |
| QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0260 | |
| FITC标记二抗 | ProteinTech | SA00003-2 | |
| 免疫组化 | 生物素化二抗 | BD Biosciences | 550338 |
| 链霉亲和素-HRP复合物 | BD Biosciences | 550946 | |
| DAB显色试剂盒 | BD Biosciences | 550880 | |
| ELISA | 人OSM ELISA试剂盒 | Animaluni | LV10395 |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| R540小动物麻醉机 | RWD Life Science | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | THP-1分化使用PMA浓度10 ng/ml,处理24小时,恢复24小时。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Drugs and cytokine treatment” |
| TAM诱导 | TCM制备:80%融合度PANC-1或SW1990细胞无血清培养24小时;MCM制备:M0巨噬细胞以50% TCM处理48小时,再换无血清培养24小时。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Preparation of conditioned medium” |
| β-catenin抑制 | XAV939使用浓度5 μM,预处理24小时。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Drugs and cytokine treatment” |
| STAT3抑制 | WP1066使用浓度5 μM,预处理24小时。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Drugs and cytokine treatment” |
| OSM刺激 | 重组人OSM浓度5-20 ng/ml,处理24-48小时。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Drugs and cytokine treatment” |
| 体内实验 | C57BL/6小鼠皮下注射1×10^6 Panc02细胞(与Matrigel 1:1),尾静脉注射1×10^6细胞,监测时间及肿瘤体积测量方法。 阅读提示:参见Materials and methods中的“Establishment of murine subcutaneous xenograft and tail vein metastasis models” |