CAFs与Huh7细胞共培养及SERPINE1表达验证
验证CAFs对Huh7细胞SERPINE1表达的影响。
将CAFs与Huh7细胞在transwell系统中共培养48小时,以无CAFs的transwell作为对照,然后通过RT-qPCR检测SERPINE1 mRNA水平。
CAF-derived miR-642a-3p supports migration, invasion, and EMT of hepatocellular carcinoma cells by targeting SERPINE1.
包含体外共培养、功能获得/丧失实验、双荧光素酶报告实验、拯救实验及原位异种移植动物模型的验证,覆盖从机制到体内效果的多个独立证据层级。
Huh7人肝癌细胞系 人肝癌CAFs共培养体系 BALB/c裸鼠原位肝肿瘤模型
CAFs与Huh7细胞共培养时间:48小时 miR-642a-3p mimics/inhibitor及si-SERPINE1转染浓度:20 μM,转染时间:48小时 双荧光素酶报告实验中SERPINE1 3'UTR野生型与突变体质粒共转染 动物模型中AAV-shmiR-642a-3p注射剂量:2×10^11 vg,注射时间:接种后1周 原位注射Huh7-luc细胞密度:2×10^8 cells/mL,体积:100 μL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CAFs对Huh7细胞SERPINE1表达的影响。
将CAFs与Huh7细胞在transwell系统中共培养48小时,以无CAFs的transwell作为对照,然后通过RT-qPCR检测SERPINE1 mRNA水平。
探究SERPINE1在Huh7细胞增殖和侵袭中的功能。
将SERPINE1 siRNA或si-NC转染入Huh7细胞48小时,通过CCK-8实验检测细胞增殖,通过Transwell实验检测细胞侵袭。
预测并筛选靶向SERPINE1的候选miRNA。
使用starBase、miRwalk、TargetScan和miRDB数据库预测靶向SERPINE1 3'UTR的miRNA,并通过Venn图取交集,然后通过共培养RT-qPCR验证候选miRNA的表达变化。
验证miR-642a-3p与SERPINE1 3'UTR的直接结合。
构建pmirGLO-SERPINE1-WT和MUT质粒,与miR-642a-3p mimics或NC共转染293T细胞,48小时后用双荧光素酶报告实验检测荧光活性。
评估miR-642a-3p在Huh7细胞迁移、侵袭和EMT中的作用。
将miR-642a-3p mimics、inhibitor或相应NC转染入Huh7细胞48小时,通过伤口愈合实验检测迁移,Transwell实验检测侵袭,Western blot检测EMT标志物蛋白表达。
确认miR-642a-3p通过抑制SERPINE1发挥作用。
在Huh7细胞中共转染miR-642a-3p inhibitor和SERPINE1 siRNA,检测迁移、侵袭和EMT标志物表达,比较与单独inhibitor的效果。
评估miR-642a-3p敲低对体内肿瘤生长和EMT的影响。
将Huh7-luc细胞原位注射到裸鼠肝脏,一周后注射AAV-shmiR-642a-3p或AAV-vector,观察肿瘤生长,通过HE染色、免疫组化Ki67、RT-qPCR和Western blot分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | KeyGEN BioTECH | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| Transwell小室 | Corning Incorporated | -- | |
| 基质胶包被 | 基质胶 | BD | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM培养基 | -- | -- | |
| P3000™试剂 | -- | -- | |
| 增殖检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- |
| ELx800酶标仪 | BioTek | -- | |
| 伤口愈合实验 | IX51显微镜 | Olympus | -- |
| Transwell侵袭实验 | 结晶紫 | Sigma | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Nano100分光光度计 | Hangzhou Allsheng Instruments Co., Ltd. | -- | |
| 逆转录 | PrimeScript™ RT试剂盒 | Takara | -- |
| Bulge-Loop™ miRNA RT-PCR Starter Kit | RiboBio | -- | |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Takara | -- |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | ABI | -- | |
| Western blot | 总蛋白提取试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| SERPINE1抗体 | Abcam | ab222754 | |
| E-cadherin抗体 | Abcam | ab76055 | |
| N-cadherin抗体 | Proteintech | 66219-1-Ig | |
| vimentin抗体 | Bioss | bsm-33170m | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 抗兔IgG二抗 | Abcam | ab6721 | |
| ECL检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| ChemiDoc Touch 1708370成像系统 | Bio-Rad | 1708370 | |
| 双荧光素酶报告实验 | Dual-Glo®荧光素酶试剂 | Promega | -- |
| Dual-Glo® Stop & Glo®试剂 | Promega | -- | |
| Tecan Spark酶标仪 | Tecan | -- | |
| 动物模型 | BALB/c裸鼠 | Shanghai Lingchang Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| Huh7-luc细胞 | Shanghai Zhong Qiao Xin Zhou Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| AAV-shmiR-642a-3p | -- | -- | |
| HE染色 | SLIDEVIEW VS200研究型玻片扫描仪 | Olympus | -- |
| 免疫组织化学 | Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| HRP标记二抗 | MXB Biotechnologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 共培养实验 | CAFs与Huh7细胞的共培养时间(48小时)及transwell系统设置 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 细胞转染 | miR-642a-3p mimics/inhibitor/si-SERPINE1的浓度(20 μM)、转染时间(48小时)及转染试剂(Lipofectamine™ 3000) 阅读提示:Methods - Cell transfection |
| 双荧光素酶报告实验 | 293T细胞共转染的质粒(WT/MUT)和miR-642a-3p mimics或NC,转染时间48小时 阅读提示:Methods - Dual-luciferase reporter assay |
| 动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(4-6周)、性别(雄性)、每组数量(5只)、细胞注射剂量(2×10^8 cells/mL,100 μL)、AAV注射剂量(2×10^11 vg)及时间(接种后1周) 阅读提示:Methods - Animal model |
| 免疫组织化学 | Ki67抗体稀释度(1:50)及染色步骤 阅读提示:Methods - Immunohistochemistry |