患者样本分析
探究巨噬细胞表型与人唇肌损伤后纤维化和再生的相关性。
收集29例继发性唇裂修复手术患者的唇肌组织,进行Masson染色、Desmin免疫组化及F4/80、CD86、CD206免疫荧光染色,并分析各肌束中纤维化面积、再生面积与巨噬细胞数量的相关性。
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis.
包含体外细胞实验、动物模型、患者样本分析及单细胞RNA测序,并进行功能验证和机制验证。
小鼠咬肌冷冻损伤模型 RAW264.7巨噬细胞系 HEK-Blue TLR报告细胞 人唇肌组织样本
MSN-PEI浓度及给药时间 巨噬细胞表型标志物(CD86、CD206) Gal3+巨噬细胞比例 Fabp4+ FAPs与Igf1+ FAPs比例 TLR7/9表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究巨噬细胞表型与人唇肌损伤后纤维化和再生的相关性。
收集29例继发性唇裂修复手术患者的唇肌组织,进行Masson染色、Desmin免疫组化及F4/80、CD86、CD206免疫荧光染色,并分析各肌束中纤维化面积、再生面积与巨噬细胞数量的相关性。
建立口面部肌肉纤维化动物模型,并观察巨噬细胞动态变化。
对6周龄C57BL/6小鼠咬肌进行冷冻损伤,在损伤后0、2、4、7天检测巨噬细胞极化和cfDNA浓度。
验证MSN-PEI的理化性质及其捕获cfNA、抑制TLR激活和炎症反应的能力。
合成并表征MSN-PEI,检测其DNA结合能力、细胞毒性、ROS清除活性;利用HEK-Blue TLR报告细胞和RAW264.7细胞检测对TLR激动剂(poly(I:C)、ORN06、CpG DNA)的抑制效果及炎症因子分泌。
评估MSN-PEI在冷冻损伤模型中对肌肉纤维化和功能恢复的治疗效果。
在冷冻损伤后0、2、4、6天局部注射MSN-PEI,于28天后进行组织学分析(H&E、天狼星红、Laminin染色)和咀嚼功能检测(咬合力、进食时长、咀嚼频率、食物摄入量)。
阐明MSN-PEI调节巨噬细胞和FAPs的分子机制。
对损伤后7天的对照组、损伤组、MSN-PEI组肌肉组织进行scRNA-seq,分析巨噬细胞亚群和FAP亚群变化;通过免疫荧光、流式细胞术、qPCR等验证TLR7/9表达、巨噬细胞极化、FAP增殖凋亡及分化等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | 11995065 |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胎牛血清 | GIBCO BRL | A5669701 | |
| TLR激活检测 | 聚肌胞苷酸 | InvivoGen | tlrl-picw |
| ORN06/LyoVec | InvivoGen | tlrl-orn6 | |
| CpG2006 | InvivoGen | tlrl-2006 | |
| QUANTI-Blue™溶液 | InvivoGen | rep-qbs | |
| 组织学染色 | H&E染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1346 | |
| 免疫荧光染色 | 抗F4/80抗体 | Thermo Scientific | MF48000 |
| 抗TLR7抗体 | Huabio | ER30606 | |
| 抗TLR9抗体 | Bioss | BC05301367 | |
| Western blot | 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | #9661 |
| 动物实验 | 氯化钡 | Sigma-Aldrich | 202738 |
| 纳米材料合成 | 正硅酸四乙酯 | Sigma-Aldrich | 8.00658 |
| 支链聚乙烯亚胺(分子量25 kDa) | Sigma-Aldrich | 408727 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | 15596018 |
| PrimeScript™ FAST RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara Bio | RR092A | |
| TB Green® Premix Ex Taq™ | Takara Bio | RR420A | |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Thermo Scientific | BMS607-3 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Thermo Scientific | BMS603-2 | |
| 小鼠IL-10 ELISA试剂盒 | Jiangsu Meimian | MM-0176M1 | |
| DNA定量 | Quant-iT PicoGreen dsDNA检测试剂盒 | Thermo Scientific | P11495 |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | Biolegend | 103108 |
| 抗Ly6C抗体 | Biolegend | 128008 | |
| 抗CX3CR1抗体 | Biolegend | 149008 | |
| 单细胞测序 | Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 患者样本量、样本来源、纤维化与再生区域判定标准、巨噬细胞标记物(F4/80、CD86、CD206) 阅读提示:Methods: Patient samples, Histological and Immunofluorescent staining of human muscle samples; Figure 1a-d |
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别、损伤方式(冷冻损伤/切割损伤)、损伤持续时间、对照处理(BaCl2) 阅读提示:Methods: Animal studies; Figure 3a |
| 纳米材料处理 | MSN-PEI浓度、给药体积、给药时间点(0、2、4、6天)、注射途径 阅读提示:Methods: Animal studies; Figure 3a; Figure S5-S8 |
| 体外炎症实验 | 细胞系、TLR激动剂类型和浓度、纳米材料浓度、处理时间、炎症因子检测方法 阅读提示:Methods: In vitro TLR activation assay, Anti-inflammatory and ROS assay in vitro; Figure 2g |
| 单细胞测序 | 样本获取时间点(7 dpi)、细胞数量、测序平台、数据分析流程(聚类、差异表达) 阅读提示:Methods: Single-cell preparation and analysis; Figure 4b-c |