FGF2敲除验证
验证FGF2在基因和蛋白水平的缺失,确保模型建立。
通过ELISA检测血清FGF2水平,实时PCR检测肺、脾、肝中FGF2 mRNA表达,Western blot和免疫荧光检测肺组织和BMDM中FGF2蛋白表达。
Deleting fibroblast growth factor 2 in macrophages aggravates septic acute lung injury by increasing M1 polarization and inflammatory cytokine secretion.
研究包含体外BMDM极化与凋亡实验、体内巨噬细胞清除重建和CLP脓毒症模型,并通过流式、PCR、Western blot及RNA-seq验证功能与机制。
FGF2基因敲除小鼠来源的BMDM C57BL/6小鼠CLP脓毒症模型 巨噬细胞清除重建的C57BL/6小鼠
BMDM分化使用100 ng/ml M-CSF培养7天 M1极化使用LPS刺激(100 ng/ml或10 ng/ml,处理24或48小时) M2极化使用IL4刺激(10 ng/ml,处理24或48小时) 巨噬细胞清除使用0.2 ml氯膦酸盐脂质体尾静脉注射 BMDM移植剂量为2×10^6细胞,移植后36小时进行CLP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证FGF2在基因和蛋白水平的缺失,确保模型建立。
通过ELISA检测血清FGF2水平,实时PCR检测肺、脾、肝中FGF2 mRNA表达,Western blot和免疫荧光检测肺组织和BMDM中FGF2蛋白表达。
评估FGF2缺失对BMDM凋亡和极化的影响。
从WT和FGF2 KO小鼠骨髓分离BMDM,用M-CSF分化7天,然后用LPS或IL4刺激诱导极化,通过流式细胞术检测M1/M2标志物和凋亡。
检测FGF2缺失对巨噬细胞促炎细胞因子表达的影响。
通过实时PCR检测iNOS、CXCL1、IL18、IL6、IL1β、TNFα、CD206、Ym1、Arg1、IL10等基因表达。
探究FGF2缺失是否影响NF-κB信号通路。
通过免疫荧光检测p65 NF-κB的核转位,并检测MMP9表达。
揭示FGF2缺失对巨噬细胞转录组的影响及富集通路。
对WT和FGF2 KO BMDM(有无LPS处理)进行RNA-seq,分析差异表达基因、KEGG富集和GSEA。
评估FGF2缺失巨噬细胞对CLP诱导脓毒症急性肺损伤的影响。
用氯膦酸盐脂质体清除内源性巨噬细胞,然后尾静脉注射WT或FGF2 KO BMDM,随后进行CLP手术诱导脓毒症,24小时后分析。
评估FGF2缺失巨噬细胞对脓毒症诱导的肺损伤的影响。
检测BALF中细胞数、蛋白浓度、炎性细胞因子(IL1β、TNFα、IL6)、肺湿干比、Evans blue渗漏、肺组织HE染色及肺损伤评分、血气分析。
检测肺组织中M1/M2巨噬细胞标志物和细胞凋亡情况。
通过免疫荧光检测CD86、CD206、F4/80表达,TUNEL染色检测凋亡,Western blot检测BCL2和BAX蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | CORNING | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | Gibco | A5669701 | |
| 青霉素-链霉素 | BasalMedia | P4333 | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | GenScript | Z03275 | |
| 极化刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4391 |
| 白细胞介素4 | Sigma-Aldrich | SRP3211 | |
| 细胞消化 | 胰蛋白酶 | Labgic | BL512B |
| 流式分析 | FITC偶联抗小鼠CD86抗体 | Invitrogen | 11-0862-81 |
| PE偶联抗小鼠iNOS抗体 | Invitrogen | 12-5920-82 | |
| APC偶联抗小鼠Arg-1抗体 | Invitrogen | 17-3697-80 | |
| PE偶联抗小鼠CD206抗体 | Invitrogen | 12-2061-80 | |
| FITC偶联抗小鼠F4/80抗体 | Biolegend | 123108 | |
| 抑制剂处理 | IMD-0354 | MCE | HY-10172 |
| MCC950 | MCE | HY-12815 | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V/PI凋亡检测试剂盒 | KeyGEN Biotech | KGA1101-20 |
| 免疫荧光 | 正常山羊血清 | Beyotime | A7007 |
| FGF2抗体 | Boster | MA00121 | |
| P65抗体 | CST | 8242 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Boster | BA1054 | |
| DAPI | MedChemExpress | HY-D0814 | |
| CD206抗体 | Boster | A02285-2 | |
| CD86抗体 | Boster | BM4121 | |
| F4/80抗体 | Proteintech | 29414-1-AP | |
| NLRP3抗体 | Proteintech | 68102-1-Ig | |
| Caspase-1 p20抗体 | Bioss | bs-10743R | |
| ASC/TMS1抗体 | Proteintech | 10500-1-AP | |
| 成像 | 3D全景扫描仪(Pannoramic Confocal) | 3DHISTECH | -- |
| qPCR | TRIzol试剂 | Toroivd | A211-01 |
| 逆转录试剂盒 | Toroivd | RTM-002 | |
| TOROGreen qPCR预混液 | Toroivd | QST-103 | |
| QuantStudio5检测仪 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Boster | AR0102-100 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Boster | AR0197 | |
| SDS-PAGE凝胶 | ygyr-biotech | PAGE10008 | |
| PVDF膜 | ygyr-biotech | D032217 | |
| 脱脂奶粉溶液 | Beyotime | P0216-300g | |
| PBST缓冲液 | Boster | AR0194-10 | |
| BCL2抗体 | Boster | BM4985 | |
| BAX抗体 | Boster | BM3964 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Boster | BM1623 | |
| 流式分析 | MHCII-FITC抗体 | Biolegend | 107606 |
| 肺血管渗漏检测 | 伊文思蓝染料 | Maokang Bio | MS4049 |
| 甲酰胺 | AMRESCO | 24390-14-5 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BMDM分离与培养 | 小鼠周龄(8-12周),骨髓细胞来源(胫骨和股骨),M-CSF浓度(100 ng/ml),培养天数(7天),培养基成分(RPMI 1640, 10% FBS, 1% 青霉素-链霉素) 阅读提示:Materials and methods: Method for BMDMs isolation and culture |
| FGF2敲除验证 | ELISA检测血清FGF2,实时PCR检测肺、脾、肝FGF2表达,Western blot检测肺组织FGF2,免疫荧光检测BMDM FGF2 阅读提示:Results: FGF2 deficiency in macrophages increases their susceptibility to apoptosis...; Figure 1 |
| 体外极化实验 | LPS浓度(100 ng/ml和10 ng/ml),IL4浓度(10 ng/ml),处理时间(24或48小时),流式抗体克隆及浓度(CD86, iNOS, CD206, Arg1) 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry; Figure 2 |
| NF-κB通路检测 | p65抗体浓度(1:500),免疫荧光定量方法(ImageJ) 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence staining, Results: FGF2 deficiency in macrophage resulted in elevated expression...; Figure 3 |
| RNA-seq | LPS处理浓度(10 ng/ml)和时间(24小时),每组样本数(3),差异表达基因阈值(log2 fold change>0.5, Q value<0.05) 阅读提示:Materials and methods: RNA-seq analysis; Figure 4 |
| 体内巨噬细胞清除与重建 | 氯膦酸盐脂质体剂量(0.2 ml),注射途径(尾静脉),清除效率验证(F4/80+细胞比例),BMDM移植剂量(2×10^6),移植时间(2天后),CLP手术时间(移植后36小时) 阅读提示:Materials and methods: Macrophage depletion and reconstitution; Figure 5 |
| CLP模型 | 小鼠性别(雄性),年龄(10周龄),麻醉剂量(1%戊巴比妥40 mg/kg),穿刺针型号(21G),穿刺孔数(2个),液体复苏(1 ml预热生理盐水) 阅读提示:Materials and methods: CLP model |
| 肺损伤评估 | BALF收集方法(PBS冲洗),细胞计数仪器(Countess II),ELISA试剂盒测量细胞因子,Evans blue注射剂量(1%溶液),formamide提取条件(60℃ 24小时),肺湿干比测定(60℃ 72小时) 阅读提示:Materials and methods: Analysis of lung inflammation and lung vascular leak |
| 组织学评分 | HE染色,Smith评分标准(评分0-4) 阅读提示:Materials and methods: Lung histology and lung injury score |