EAE模型诱导及PKM2核转位观察
建立多发性硬化小鼠模型,并检测星形胶质细胞中PKM2的表达和核转位情况。
使用MOG35-55肽和CFA及PTX免疫C57BL/6小鼠诱导EAE,在发病、高峰和慢性期收集脊髓组织,通过免疫荧光染色观察PKM2与GFAP共定位,并定量核PKM2比例。
Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis.
包括EAE动物模型、原代星形胶质细胞体外模型、单细胞RNA测序及体内敲低/药物干预等多个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。
EAE小鼠模型(MOG35-55诱导的C57BL/6小鼠) 小鼠原代星形胶质细胞 MOG35-55刺激的脾细胞上清(MOGsup)激活的原代星形胶质细胞
EAE小鼠模型使用MOG35-55肽和CFA及PTX诱导,C57BL/6雌性小鼠 DASA-58抑制PKM2核转位的体外浓度(50 μM)及预处理时间(30 min) TEPP-46腹腔注射剂量(50 mg/kg)及给药方案(从免疫后第0天至第8天隔天一次) shTRIM21慢病毒脑室内注射剂量(1×10^7 IU/只)及注射时间(免疫后第15天) MOGsup刺激原代星形胶质细胞的浓度(30%上清)和时间(12小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立多发性硬化小鼠模型,并检测星形胶质细胞中PKM2的表达和核转位情况。
使用MOG35-55肽和CFA及PTX免疫C57BL/6小鼠诱导EAE,在发病、高峰和慢性期收集脊髓组织,通过免疫荧光染色观察PKM2与GFAP共定位,并定量核PKM2比例。
验证体外激活的星形胶质细胞中PKM2的核转位是否重现体内现象。
分离新生小鼠原代星形胶质细胞,用MOG35-55刺激的EAE小鼠脾细胞上清(MOGsup)处理不同时间,通过免疫荧光检测PKM2和GFAP表达。
探究PKM2核转位对星形胶质细胞糖酵解、增殖和炎症因子表达的影响。
用DASA-58预处理原代星形胶质细胞,再以MOGsup刺激,检测PKM2核转位、糖酵解水平(葡萄糖消耗和乳酸产生)、细胞增殖(CCK-8和EdU)、炎症因子mRNA表达及信号通路蛋白磷酸化。
寻找调控PKM2核转位的上游分子,特别是泛素化相关蛋白。
对未刺激和MOGsup刺激的原代星形胶质细胞进行PKM2免疫沉淀,结合质谱鉴定相互作用蛋白,并通过生物信息学分析(GO、KEGG)筛选候选分子,重点关注TRIM21。
确认TRIM21与PKM2之间的物理相互作用及结合结构域。
通过内源性免疫共沉淀、外源性共转染和截短突变体免疫共沉淀,验证TRIM21与PKM2的结合及关键结构域。
验证TRIM21是否通过泛素化修饰促进PKM2核转位。
在原代星形胶质细胞中过表达或敲低TRIM21,检测PKM2的核转位和K63连接泛素化水平。
评估TRIM21促进PKM2核转位后,对PKM2核内伴侣结合、信号通路激活、糖酵解和增殖的影响。
在TRIM21过表达的星形胶质细胞中,检测PKM2与STAT3、NF-κB、c-myc的结合,STAT3和NF-κB磷酸化,以及DASA-58处理对糖酵解和增殖的逆转作用。
在EAE小鼠模型中验证靶向TRIM21-PKM2轴的治疗潜力。
通过脑室内注射shTRIM21慢病毒(GFAP启动子)或腹腔注射TEPP-46,评估EAE疾病严重程度、脊髓炎症、脱髓鞘及星形胶质细胞和小胶质细胞活化情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| EAE诱导 | MOG35-55肽 | -- | -- |
| 完全弗氏佐剂(CFA) | -- | -- | |
| 不完全弗氏佐剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 百日咳毒素 | List Biological Laboratories | -- | |
| 动物处理 | TEPP-46 | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清(FBS) | -- | -- | |
| 细胞分离 | 神经组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotech | -- |
| 抗GLAST磁珠试剂盒 | Miltenyi Biotech | -- | |
| 单细胞测序 | 成年脑解离试剂盒 | Miltenyi | -- |
| Chromium单细胞3'文库 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina NovaSeq6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 免疫沉淀 | Dynabeads M-270环氧磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质谱 | Q-Exactive Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher | -- |
| 糖酵解检测 | 葡萄糖氧化酶法 | Applygen Technologies | -- |
| 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 免疫荧光 | 抗PKM2抗体 | Bioss | bs-0101R |
| 抗GFAP抗体 | Huabio | EM140707 | |
| 抗TRIM21抗体 | Proteintech | 12108-1-AP | |
| 抗MBP抗体 | Proteintech | 10458-1-AP | |
| 抗IBA1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| Alexa Fluor 488或Cy3偶联二抗 | Zhuangzhibio | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞增殖 | EdU-488或EdU-594细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | C0071S、C0078S |
| CCK-8 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Topscience | -- | |
| 核质提取试剂盒 | Solarbio | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL检测系统 | Tanon 4600 | -- | |
| 抗PKM2抗体 | Proteintech | 60268-1-Ig | |
| 抗磷酸化c-myc抗体 | Huabio | ET1609-64 | |
| 抗c-myc抗体 | Cohesion Biosciences | CPA1778 | |
| 抗LDHA抗体 | Huabio | ET1608-57 | |
| 抗STAT3抗体 | Proteintech | 60199-1-Ig | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Bioss | bs-1658R | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Servicebio | GB113882-100 | |
| 抗p65抗体 | Cohesion Biosciences | CPA2000 | |
| 抗磷酸化IKK抗体 | Bioss | bs-3237R | |
| 抗IKK抗体 | ServiceBio | GB11292-1-100 | |
| 抗Lamin抗体 | Cohesion Biosciences | CPA1693 | |
| 抗Tubulin抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| 抗Flag抗体 | Abclonal | AE004 | |
| 抗Myc抗体 | Abclonal | AE010 | |
| 抗TRIM21抗体 | Proteintech | 12108-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 | ServiceBio | GB12001-100 | |
| qPCR | TRIzol | -- | -- |
| 逆转录试剂盒 | DEEYEE | -- | |
| 2×qPCR SmArt Mix | DEEYEE | -- | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher | -- | |
| 组织染色 | LFB染色液 | Servicebio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EAE诱导 | 小鼠品系、性别、年龄;MOG35-55剂量;CFA成分及体积;PTX剂量及注射时间 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments |
| 原代星形胶质细胞分离与培养 | 新生小鼠组织来源;解离试剂盒和磁珠分选方法;培养条件(DMEM+10% FBS) 阅读提示:Materials and methods: Isolation and culture of primary astrocytes |
| MOGsup刺激 | 脾细胞来源(EAE小鼠发病时间);MOG35-55刺激浓度;刺激时间;上清收集方法及使用比例 阅读提示:Materials and methods: Splenocyte isolation and supernatant of MOG35-55-stimulated-splenocytes |
| DASA-58处理 | DASA-58浓度(50 μM)和预处理时间(30 min);刺激时间(12 h) 阅读提示:Figure 2 legend |
| TRIM21过表达/敲低 | 慢病毒载体(GFAP启动子);感染复数(MOI)或滴度;敲低序列;处理时间 阅读提示:Materials and methods: Lentivirus-mediated short hairpin RNA interference and overexpression |
| TEPP-46治疗 | 剂量(50 mg/kg);给药方式(腹腔注射);给药时间点(第0-8天隔天一次) 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments; Figure 7—figure supplement 2 |
| 体内敲低TRIM21 | 病毒滴度(1×10^7 IU/只);注射方式(脑室内);注射坐标;注射时间(免疫后第15天) 阅读提示:Materials and methods: In vivo injection of lentivirus; Figure 7 legend |
| 单细胞RNA测序 | 组织来源(脑);解离方法(10x Genomics);测序平台;分析流程(Cell Ranger版本) 阅读提示:Materials and methods: Single-cell RNA sequencing |