B. infantis灌胃对心肌I/R损伤的保护作用
验证预防性灌胃B. infantis是否能减轻心肌I/R损伤。
小鼠经抗生素清除肠道菌群后,每日灌胃B. infantis或PBS,持续7天,然后进行心肌I/R手术,评估心功能、纤维化、细胞凋亡及血清cTnT水平。
Prophylactic supplementation with Bifidobacterium infantis or its metabolite inosine attenuates cardiac ischemia/reperfusion injury.
包含小鼠心肌I/R模型、B. infantis灌胃及肌苷处理、RNA-seq、流式、ELISA、体外OGDR及siRNA敲低等多层级功能与机制验证。
C57BL/6J小鼠心肌缺血再灌注(I/R)模型 C2C12小鼠成肌细胞氧糖剥夺/再复氧(OGDR)模型
B. infantis灌胃剂量:2×10^7 CFU/天,持续7天 肌苷给药方式:腹腔注射,I/R前7天及I/R后7天每天一次 I/R手术:左前降支冠状动脉结扎40分钟 A2AR抑制剂ZM241385的使用 嘌呤补救途径相关基因siRNA敲低(Hprt1、Aprt)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证预防性灌胃B. infantis是否能减轻心肌I/R损伤。
小鼠经抗生素清除肠道菌群后,每日灌胃B. infantis或PBS,持续7天,然后进行心肌I/R手术,评估心功能、纤维化、细胞凋亡及血清cTnT水平。
验证B. infantis的代谢物肌苷是否能模拟B. infantis的心脏保护效果。
通过腹腔注射肌苷处理I/R小鼠,评估心功能、纤维化、血清cTnT及心脏组织学变化。
通过转录组分析探究肌苷对I/R心脏的基因表达影响及潜在机制。
对I/R后1天的心肌组织进行RNA测序,分析差异表达基因、GO富集和GSEA。
验证肌苷抑制炎症是否通过腺苷A2A受体(A2AR)介导。
给I/R小鼠施用A2AR抑制剂ZM241385,观察肌苷对心功能及炎症因子(IL-1β、IL-6)的影响是否被逆转。
在体外模拟I/R的OGDR条件下,验证肌苷是否通过嘌呤补救途径减少细胞死亡。
将C2C12肌母细胞在OGDR条件下培养,给予肌苷处理,检测细胞活力、死亡及ATP水平,并使用siRNA敲低相关酶(Pgm2, Prps1, Hprt1, Aprt)及药理学抑制剂(forodesine)验证机制。
验证肌苷在体内是否通过提高ATP水平发挥心脏保护作用。
检测I/R后不同时间点及肌苷处理小鼠心脏组织的ATP水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 万古霉素 | Sigma-Aldrich | 1404-94-9 |
| 新霉素 | Macklin | 1405-10-3 | |
| 甲硝唑 | Solarbio | 443-48-1 | |
| 阿斯巴甜 | Macklin | A801109 | |
| 细菌培养 | 双歧杆菌MRS肉汤 | Hopebio | -- |
| DNA提取与定量 | DNeasy PowerSoil Pro 试剂盒 | QIAGEN | 47016 |
| 定量PCR | KAPA SYBR FAST 试剂盒 | KAPA | KK4601 |
| 超声心动图 | Vevo 3100 成像系统 | Visual Sonics | -- |
| 凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A113-03 |
| 纤维化染色 | 天狼星红染料 | Leagene Biotechnology | DC0041 |
| 韦格特铁苏木素 | ZSGB-BIO | ZLI-9610 | |
| 封片 | 中性树胶 | Aladdin | N116470 |
| 纤维化染色 | 三色染色试剂盒 | Scy Tek | TRM-1 |
| 免疫组化 | 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP |
| 山羊抗兔二抗 | Bioss | SP-0022 | |
| DAB显色液 | Cell Signaling Technology | 8059 | |
| HPLC-MS | 安捷伦1290 Infinity II液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| 安捷伦6495三重四极杆液质联用仪 | Agilent Technologies | -- | |
| ZORBAX Eclipse Plus C18色谱柱 | Agilent Technologies | -- | |
| RNA测序 | Illumina链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| ELISA | cTnT ELISA试剂盒 | Yutong | F7649B |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Abclonal | RK00006 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Abclonal | RK00008 | |
| 流式细胞术 | FACS Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | 101319 | |
| BV421抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103134 | |
| BV510抗小鼠CD11b抗体 | BioLegend | 101263 | |
| APC抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100235 | |
| BV605抗小鼠Ly6C抗体 | BioLegend | 128036 | |
| FITC抗小鼠Ly6G抗体 | BioLegend | 127605 | |
| PE抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123109 | |
| PE抗小鼠NK1.1抗体 | BioLegend | 156503 | |
| PE抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | 117307 | |
| APC抗小鼠I-Ab抗体 | BioLegend | 116417 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BI | -- |
| Alamar Blue试剂 | Solarbio | A7631 | |
| 细胞活力检测 | 钙黄绿素-AM | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 荧光检测 | Cytation 5荧光多功能酶标仪 | Agilent Technologies | -- |
| siRNA转染 | JetPrime转染试剂 | Polyplus | 101000046 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| RT-qPCR | RevertAid预混液 | Thermo Fisher Scientific | M1631 |
| TB Green预混液 | Takara | RR420D | |
| AMP测量 | AMP含量检测试剂盒 | Solarbio | BC1024 |
| 安捷伦1260高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- | |
| Diamonsil Plus C18色谱柱 | -- | -- | |
| ATP测量 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 |
| BioTek Cytation 7细胞成像多功能检测仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、周龄(8-10周)、I/R手术方法(LAD结扎40分钟)、I/R后检测时间点 阅读提示:Methods: Animals, I/R studies in vivo; Figure 1 legend |
| B. infantis灌胃 | 菌株(CICC 6069)、灌胃剂量(2×10^7 CFU/天)、灌胃时长(7天)、抗生素预处理 阅读提示:Methods: Bacterial strains and oral administration; Figure 1B,C |
| 肌苷处理 | 给药途径(腹腔注射)、给药方案(I/R前7天至I/R后7天每天一次)、剂量 阅读提示:Methods: I/R studies in vivo; Figure 3B |
| A2AR抑制实验 | A2AR抑制剂(ZM241385)给药方式、剂量、时间 阅读提示:Results: Inosine attenuated cardiac inflammation...; Figure 5E-G |
| 体外OGDR实验 | C2C12细胞培养条件、OGDR条件(0.1% O2, 5% CO2, 94.9% N2,无血清无糖DMEM 8小时,再复氧2小时)、肌苷浓度、siRNA序列、转染试剂 阅读提示:Methods: OGDR induction, siRNA-mediated gene knockdown; Figure 6C-E |