高通量筛选揭示硝唑尼特通过靶向NMRAL1作为有效的PRRSV抑制剂

High-throughput screening unveils nitazoxanide as a potent PRRSV inhibitor by targeting NMRAL1.

作者信息Zhanding Cui, Jinlong Liu, Chong Xie, Tao Wang, Pu Sun, Jinlong Wang, Jiaoyang Li, Guoxiu Li, Jicheng Qiu, Ying Zhang, Dengliang Li, Ying Sun, Juanbin Yin, Kun Li, Zhixun Zhao, Hong Yuan, Xingwen Bai, Xueqing Ma, Pinghua Li, Yuanfang Fu, Huifang Bao, Dong Li, Qiang Zhang, Zaixin Liu, Yimei Cao, Jing Zhang, Zengjun Lu
PMID38844461
发布时间2024-06-06
DOI10.1038/s41467-024-48807-y

实验完整度

包含体外细胞筛选、体内猪模型验证、机制研究(靶点鉴定、二聚化验证)等独立证据层级,且包含功能验证和机制验证。

主要模型

Marc-145-GFP报告细胞系 Marc-145细胞 猪肺泡巨噬细胞(PAM) 猪模型(Landrace猪)

重点核对

NTZ给药剂量(25、10、5 mg/kg)及给药方案(预防性-1 dpi、治疗性3 dpi,口服BID×3天) PRRSV感染剂量(1×10^5.5 TCID50,通过鼻内途径) EC50值(VR2332约0.67 μM,GSWW-15约1.17 μM) NMRAL1敲低和过表达对PRRSV复制的影响 TIZ与NMRAL1的结合亲和力(SPR KD约2.872 μM)

摘要

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)对全球养猪业构成重大威胁,但有效的防控措施仍然难以实现。本研究揭示了硝唑尼特(NTZ)在体外和体内均是PRRSV的有效抑制剂。通过高通量筛选技术,从包含FDA批准和药典药物的库中鉴定出16种潜在的抗PRRSV化合物。我们表明,NTZ在猪模型中显示出强大的降低PRRSV增殖和传播的功效,减轻病毒血症和肺损伤。此外,NTZ的主要代谢物替唑尼特(TIZ)被鉴定为NMRAL1二聚化的促进因子。这一发现可能有助于阐明TIZ在增强IFN-β通路敏感性中的作用机制。这些结果表明NTZ作为猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的重新定位治疗药物具有广阔潜力。此外,它们为NTZ有效性的抗病毒机制提供了宝贵的见解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
寻找能够有效控制PRRSV流行的抗病毒策略,特别是通过高通量筛选发现候选药物并阐明其作用机制。
核心机制
NTZ的主要代谢物TIZ通过诱导NMRAL1二聚化,减少抑制性单体的丰度,从而增强RIG-I通路敏感性并提高IFN-β表达,抑制PRRSV复制。
主要证据
体外实验显示NTZ抑制PRRSV复制,体内猪模型显示NTZ降低病毒血症和肺损伤;机制研究中,iTSA和CETSA-WB鉴定出NMRAL1为靶点,SPR和DSF证实TIZ与NMRAL1结合,过表达/敲低NMRAL1影响病毒复制,且TIZ促进NMRAL1二聚化。
研究意义
NTZ作为已批准药物,具有快速重新定位为PRRS治疗剂的潜力,其作用机制的阐明有助于开发类似抗病毒药物。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立PRRSV高通量筛选模型

开发基于表型的筛选系统,用于识别抑制PRRSV感染的化合物。

构建Marc-145-GFP报告细胞系,该细胞系在PRRSV感染后表达GFP。将化合物、GSWW-18病毒(MOI=1)和细胞共孵育,通过荧光检测评估抗病毒活性。

2

筛选化合物的剂量反应和细胞毒性评估

验证初筛得到的候选化合物的抗病毒活性和细胞毒性,以确定优先化合物。

对初筛得到的141种化合物进行浓度梯度筛选,使用IFA检测抗病毒效果,并测定EC50和CC50。

3

体内评价NTZ的抗病毒效果

评估NTZ在猪模型中预防和治疗PRRSV感染的功效。

用GSWW-18株感染猪,分别进行预防性(-1 dpi)和治疗性(3 dpi)口服NTZ给药,检测病毒载量、临床评分、肺损伤等指标。

4

NTZ对病毒传播的抑制

评估NTZ是否减少PRRSV在猪群间的传播。

感染猪和未感染猪混合饲养,给予不同剂量NTZ,监测病毒脱落和传播。

5

鉴定NTZ的靶蛋白

揭示NTZ抑制PRRSV的分子靶点。

使用iTSA、CETSA-WB和CCR方法鉴定NTZ的潜在靶蛋白,包括宿主蛋白NMRAL1和病毒蛋白NSP1α、NSP12。

6

验证NTZ通过靶向NMRAL1的机制

验证NMRAL1在NTZ抗病毒作用中的功能角色,并阐明分子机制。

通过过表达和沉默NMRAL1检测PRRSV复制变化,并检测NTZ对NMRAL1二聚化和IFN-β通路的影响。使用DSF和SPR验证结合。

7

分子对接和动力学模拟

从结构上阐明TIZ与NMRAL1二聚体的结合模式和稳定性作用。

进行分子对接和分子动力学模拟,分析TIZ与NMRAL1的结合位点、结合自由能及二聚体构象变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
杀稻瘟菌素SSolarbioB9300
硝唑尼特AladdinN159057
替唑尼特AladdinT343906
利巴韦林AladdinR101754
FDA批准及药典药物库MCEHY-L066
Cytell细胞成像系统GE29-0567-49
CytoFLEX LX流式细胞仪Beckman--
jetPRIME转染试剂Polyplus--
pLenti6/V5-DEST载体YoubioVT1476
pSPAX2载体YoubioVT1444
pMD2.G载体YoubioVT1443
pCMV-HA载体YoubioVT1710
Luc-IFN-β报告质粒Yeasen--
pTK-RL质粒Yeasen--
SR30抗体RtilabSR30-A
山羊抗小鼠HRP二抗Biossbs-0368G-HRP
山羊抗小鼠FITC二抗Biossbs-0368G-FITC
兔抗GATM抗体SigmaHPA026077
兔抗NMRAL1抗体SolarbioK004351P
小鼠抗HA抗体Abmart26D11
小鼠抗GAPDH抗体Proteintech60004
兔抗PRRSV-N抗体Biossbs-41387R
山羊抗小鼠HRP偶联物Bio-rad1705047
山羊抗兔HRP偶联物Bio-rad1705046
聚肌胞苷酸MERCKP1530
胰蛋白酶Gibco25200072
PVDF膜Merck--
化学发光底物Thermo34577
Gel Doc XR+分子成像仪Bio-Rad--
SYPRO Orange染料ThermoS6650
QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪Thermo--
Biacore T200系统Cytiva--
CM5传感器芯片CytivaBR100530
TSQ Quantum三重四极杆质谱仪Thermo--
UltiMate 3000 RS色谱仪Thermo--
ZORBAX StableBond C18色谱柱Agilent--
timsTOF Pro 2质谱仪Bruker--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和报告细胞系
Marc-145-GFP细胞系的构建和使用,确保GFP表达与PRRSV感染相关
阅读提示:Methods: Cells and viruses
高通量筛选
化合物库(3274种)、96孔板、细胞数、MOI、孵育时间、Z'因子
阅读提示:Methods: Compounds, chemical library, and drug screening; Figure 1d-f
体内药效评估
猪品种、年龄、体重、感染剂量、NTZ给药方案(剂量、时间、途径)、检测指标
阅读提示:Methods: In vivo antiviral effect of NTZ; Figure 3a
靶点鉴定
iTSA和CETSA的实验条件(温度、浓度),抗体浓度,细胞系
阅读提示:Methods: Cellular thermal shift assay; Figure 5
机制验证
siRNA序列、转染条件、NTZ处理浓度、IFN-β报告基因实验条件
阅读提示:Methods: IFN-β dual-luciferase reporter assay; Figure 6