PD-L1表达及临床相关性分析
明确PD-L1在NSCLC细胞和组织中的表达情况及其与临床病理特征和预后的关系。
通过Western blot检测NSCLC细胞系A549、H1299、PC9和正常肺上皮BEAS-2B中PD-L1表达;对100例NSCLC组织进行免疫组化染色检测PD-L1表达,PAS-CD31双染检测VM结构,并分析PD-L1表达与临床病理特征及生存的关系。
PD-L1 knockdown suppresses vasculogenic mimicry of non-small cell lung cancer by modulating ZEB1-triggered EMT.
包含体外细胞实验(siRNA/shRNA敲低、管形成、迁移侵袭、增殖凋亡)、临床样本免疫组化及生物信息学分析,并进行了EMT及VM相关标志物的功能验证与机制验证。
A549细胞 H1299细胞 NSCLC患者肿瘤组织样本
PD-L1敲低效率:使用siRNA #3,Western blot和q-PCR验证 ZEB1敲低效率:使用shRNA #5,Western blot和q-PCR验证 VM检测:PAS-CD31双染,CD31阴性且PAS阳性判定为VM 细胞增殖:CCK8检测,每孔2000细胞,24/48/72/96小时 迁移和侵袭:Transwell实验,上室1×10^5细胞,24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确PD-L1在NSCLC细胞和组织中的表达情况及其与临床病理特征和预后的关系。
通过Western blot检测NSCLC细胞系A549、H1299、PC9和正常肺上皮BEAS-2B中PD-L1表达;对100例NSCLC组织进行免疫组化染色检测PD-L1表达,PAS-CD31双染检测VM结构,并分析PD-L1表达与临床病理特征及生存的关系。
验证PD-L1敲低是否影响NSCLC细胞的管形成、增殖、迁移和侵袭能力。
采用siRNA转染敲低A549和H1299细胞中PD-L1表达,通过管形成实验检测VM形成能力,CCK8检测增殖,流式检测凋亡,划痕和Transwell检测迁移和侵袭。
探究PD-L1敲低对ZEB1及EMT标志物表达的影响。
通过Western blot和q-PCR检测PD-L1敲低后ZEB1、E-cadherin、N-cadherin、VE-cadherin、MMP9、MMP2和VEGFA的mRNA和蛋白水平;结合生物信息学分析PD-L1与ZEB1的相关性。
验证ZEB1敲低是否模拟PD-L1敲低对EMT、VM形成和细胞功能的影响。
利用慢病毒转染shRNA敲低A549和H1299细胞ZEB1,通过Western blot和q-PCR验证敲低效率;检测EMT标志物表达、管形成能力、增殖、迁移和侵袭能力;免疫组化分析ZEB1表达与VM的关系。
验证PD-L1与ZEB1在NSCLC组织中的共表达情况。
对100例NSCLC组织进行连续切片免疫组化染色,检测PD-L1和ZEB1的表达,并分析两者分布的一致性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| siRNA转染 | LIPO8000转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| 慢病毒转导 | 对照慢病毒 | Shanghai He Yuan Biotechnology Company | -- |
| 靶向ZEB1的shRNA慢病毒 | Shanghai He Yuan Biotechnology Company | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 脱脂奶粉 | -- | -- | |
| 兔抗PD-L1抗体 | Proteintech | 17952-1-AP | |
| 兔抗ZEB1抗体 | Bioss | bs-21785R | |
| 兔抗N-cadherin抗体 | Boster | BST17153912 | |
| 兔抗E-cadherin抗体 | Bioss | bs-1519R | |
| 兔抗VE-cadherin抗体 | Affinity | AF6265 | |
| 兔抗MMP9抗体 | Affinity | AF5228 | |
| 兔抗VEGFA抗体 | Proteintech | 26157-1AP | |
| 小鼠抗MMP2抗体 | Proteintech | 66366-1-Ig | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Abways | AB0037 | |
| 山羊抗兔二抗 | Biosharp | BL003A | |
| 抗小鼠IgG二抗 | Biosharp | BL001A | |
| ECL化学发光液 | Beyotime | -- | |
| RT-qPCR | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme Biotech | -- |
| NovoScript Plus 一步法第一链cDNA合成预混液(去除基因组DNA) | NOVO protein | -- | |
| NovoStart SYBR qPCR预混液Plus | NOVO protein | -- | |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | ABW | -- |
| 细胞活力实验 | CCK8试剂 | Beyotime | C0039 |
| 细胞凋亡实验 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者样本纳入标准、PD-L1评分标准、VM判定标准(CD31阴性PAS阳性) 阅读提示:Methods: Clinical specimens and immunohistochemistry; Results: 图1C, D; 表1-4 |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基条件、培养环境(37℃, 5% CO2) 阅读提示:Methods: Cell lines and culture |
| PD-L1敲低 | siRNA序列信息(文中未提供)、转染剂量和试剂(LIPO8000, C0533)、敲低效率验证方法 阅读提示:Methods: SiRNA transfection assay; Results: 图2B,C |
| ZEB1敲低 | shRNA序列信息、慢病毒来源、转导及筛选条件(嘌呤霉素,2周)、敲低效率验证 阅读提示:Methods: Lentiviral transduction; Results: 图5A-C |
| 管形成实验 | 细胞铺板密度(5×10^4/孔)、基质胶用量(55μL/孔)、观察时间(16小时) 阅读提示:Methods: Three-dimensional tube formation assay |
| 增殖、凋亡、迁移和侵袭实验 | CCK8检测时间点(24/48/72/96h)、细胞密度(2000/孔);凋亡检测染料用量;迁移和侵袭的细胞数量(1×10^5)和时间(24h) 阅读提示:Methods: Cell viability assay, Cell apoptosis assay, Cell migration assay, Cell invasion assay, Wound-healing assay |