建立RA-ILD动物模型
模拟RA-ILD病理状态
使用鸡II型胶原和完全弗氏佐剂诱导C57BL/6小鼠关节炎模型,随后白藜芦醇灌胃处理10天。
Resveratrol attenuates inflammation and fibrosis in rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease via the AKT/TMEM175 pathway.
包含体内CIA模型、体外MRC-5细胞模型,并进行分子对接、动力学模拟、功能验证(CCK8、EDU)及机制验证(Co-IP、自噬检测)。
C57BL/6小鼠胶原诱导关节炎(CIA)模型 MRC-5人胚肺成纤维细胞
CIA模型诱导:鸡II型胶原(2 g/L)与完全弗氏佐剂乳化后注射 白藜芦醇给药:10 mg/kg,灌胃,持续10天 体外模型:TGF-β1(10 ng/mL)+ IL-1β(5 ng/mL)刺激MRC-5细胞24小时 白藜芦醇处理浓度:10 μM AKT激动剂SC79(2 μM)、抑制剂MK2206(4 μM)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟RA-ILD病理状态
使用鸡II型胶原和完全弗氏佐剂诱导C57BL/6小鼠关节炎模型,随后白藜芦醇灌胃处理10天。
模拟RA-ILD微环境,评估白藜芦醇作用
用TGF-β1和IL-1β刺激MRC-5细胞,并用白藜芦醇处理,观察细胞增殖、自噬和纤维化指标。
验证白藜芦醇是否直接结合并抑制TGF-β1
通过分子对接和分子动力学模拟预测结合,并用Western blot和免疫荧光检测TGF-β1表达。
评估白藜芦醇对RA-ILD炎症和氧化应激的影响
通过免疫组化、Western blot、qRT-PCR检测炎症因子TNF-α、IL-1β,以及氧化应激标志物MDA、SOD1、SOD2,并检测ROS和线粒体膜电位。
确定白藜芦醇对自噬异常的影响
通过Western blot检测LC3-II、P62、LAMP2等自噬相关蛋白,使用MDC染色检测自噬囊泡,mCherry-GFP-LC3双荧光追踪自噬流。
探讨TMEM175对自噬溶酶体融合的影响
检测TMEM175表达,使用SiRNA敲低TMEM175,评估自噬流、溶酶体酸性和纤维化指标。
验证AKT是否与TMEM175形成复合物并调控其功能
使用AKT激动剂SC79和抑制剂MK2206处理细胞,通过Co-IP验证AKT与TMEM175结合,并检测自噬和纤维化指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 鸡II型胶原 | Chondrex | -- |
| 完全弗氏佐剂 | Chondrex | -- | |
| 药物处理 | 白藜芦醇 | Aladdin | 501-36-0 |
| 组织染色 | EDTA脱钙液 | Boster | -- |
| Masson染色试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 生化检测 | 羟脯氨酸检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 丙二醛检测试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Life Technologies/Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞模型诱导 | 转化生长因子-β1 | MedChemExpress | -- |
| 白细胞介素-1β | MedChemExpress | -- | |
| 细胞处理 | SC79 | MedChemExpress | 305834-79-1 |
| MK2206 | MedChemExpress | 1032350-13-2 | |
| 氯喹 | MedChemExpress | 54-05-7 | |
| 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | 88899-55-2 | |
| MG132 | Selleckchem | 133407-82-6 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | -- |
| 细胞增殖检测 | EdU检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime Biotechnology | 4091-99-0 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 自噬检测 | mCherry-GFP-LC3质粒 | -- | -- |
| MDC染色液 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 溶酶体检测 | 溶酶体红色荧光探针 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白质印迹 | SDS裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 | |
| I型胶原抗体 | Arigo Biolaboratories | ARG21965 | |
| TGF-β1抗体 | ImmunoWay | YT4632 | |
| 磷酸化NF-κB抗体 | Wanleibio | WL02169 | |
| NF-κB抗体 | Bioss | bsm-33117M | |
| 肿瘤坏死因子-α抗体 | Proteintech | 60291-1-Ig | |
| IL-1β抗体 | Wanleibio | WLH3903 | |
| HIF-1α抗体 | Proteintech | 20960-1-AP | |
| SOD1抗体 | Wanleibio | WL01846 | |
| SOD2抗体 | Boster | BA4566 | |
| LC3-II抗体 | Cell Signaling Technology | 12741 | |
| P62抗体 | Cell Signaling Technology | 16177S | |
| LAMP2抗体 | Proteintech | 66301-1-Ig | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Abmart | T56571 | |
| mTOR抗体 | Abmart | T55306 | |
| 磷酸化ULK1抗体 | ImmunoWay | YP1544 | |
| ULK1抗体 | Abmart | T56902 | |
| Beclin1抗体 | Boster | PB0014 | |
| Atg5抗体 | Bioss | bs-4005r | |
| BNIP3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-56167 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Abmart | T40067 | |
| AKT抗体 | Abmart | BM4400 | |
| TMEM175抗体 | Proteintech | 19925-1-AP | |
| HRP标记二抗 | ZSGB-BIO | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G磁珠 | GenScript | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green荧光染料 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | Bestbio | 25535-16-4 |
| 分子模拟 | AutoDock软件 | -- | -- |
| AutoDock Vina软件 | -- | -- | |
| PyMol软件 | -- | -- | |
| Gromacs软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别、体重范围、诱导方法(CCII和CFA剂量)、分组、白藜芦醇剂量和给药途径、给药时间 阅读提示:Materials and methods: Animal model |
| 细胞模型 | 细胞系(MRC-5)、培养条件(DMEM+10%FBS)、刺激因子TGF-β1和IL-1β的浓度、作用时间、白藜芦醇处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture, Cell transfection and processing |
| 药物处理 | SC79浓度(2 μM)、MK2206浓度(4 μM)、CQ浓度(20 μM)、BAFA1浓度(40 nM)、MG132浓度(10 μM) 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection and processing; Results: Figure 5E-G, 7E-F |
| 分子对接与模拟 | 软件版本、结合自由能阈值、模拟时间、力场参数 阅读提示:Materials and methods: Molecular docking, Molecular dynamics simulations |
| 自噬检测 | mCherry-GFP-LC3质粒转染条件、MDC染色步骤、Lyso-Tracker Red染色浓度 阅读提示:Materials and methods: mCherry-GFP-LC3 dual fluorescence, MDC staining, Lyso-tracker red staining |
| 蛋白检测 | 抗体信息、稀释比例、检测蛋白 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |