临床样本表达分析
检测SLC38A家族在正常子宫内膜、在位内膜和异位内膜中的表达差异。
收集10对EU/EC组织和10例CE组织,通过RT-qPCR检测SLC38A1-11的mRNA表达。
SLC38A2 promotes cell proliferation and invasion by promoting glutamine metabolism in adenomyosis.
包含临床组织样本(10对EU/EC及10例CE)的RT-qPCR表达分析,以及原代细胞的体外功能实验(增殖、侵袭、OCR、Gln含量)和机制验证(CB-839抑制实验),但缺少动物模型或体内验证。
原代子宫内膜基质/上皮细胞(CE、EU、EC) 患者子宫内膜组织(CE、EU、EC)
EU/EC原代细胞的分离和培养条件(胶原酶消化、DMEM-F12培养基) SLC38A2敲低和过表达慢病毒的转染效率及稳定筛选(嘌呤霉素浓度1.5 μg/ml) CB-839处理浓度(10 μM) 细胞增殖检测时间点(0、12、24、48小时) Transwell侵袭实验的细胞密度(1x10^5 cells/ml)和孵育时间(48小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测SLC38A家族在正常子宫内膜、在位内膜和异位内膜中的表达差异。
收集10对EU/EC组织和10例CE组织,通过RT-qPCR检测SLC38A1-11的mRNA表达。
评估EU和EC细胞对谷氨酰胺的依赖性。
用1.5 mM谷氨酰胺处理EU和EC细胞48小时,用CCK-8检测细胞活力。
验证敲低SLC38A2对EC细胞增殖、侵袭、谷氨酰胺含量和线粒体功能的影响。
用shSLC38A2慢病毒感染EC细胞,检测增殖、侵袭、Gln含量、OCR和线粒体呼吸链蛋白(NDUFB8、UQCRC2)水平。
验证过表达SLC38A2对EU细胞增殖、侵袭、谷氨酰胺含量和线粒体功能的影响。
用SLC38A2过表达慢病毒感染EU细胞,检测增殖、侵袭、Gln含量、OCR和线粒体呼吸链蛋白水平。
验证SLC38A2的作用是否依赖于谷氨酰胺代谢。
用CB-839(谷氨酰胺酶抑制剂,10 μM)处理SLC38A2过表达的EU细胞,检测增殖、Gln含量和侵袭。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Hank's平衡盐溶液 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| DMEM-F12培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 胶原酶 | -- | -- | |
| 胰酶 | -- | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 慢病毒包装 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Merck KGaA | -- |
| 细胞处理 | 谷氨酰胺 | Merck KGaA | G3126 |
| CB-839 | Merck KGaA | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| High Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| ABI7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| 酶标仪 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| Transwell侵袭 | Transwell小室 | Corning, Inc. | -- |
| 基质胶 | Corning, Inc. | -- | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 光学显微镜 (CX33) | Olympus Corporation | -- | |
| Seahorse分析 | Seahorse XF24分析仪 | Agilent Technologies, Inc. | -- |
| 谷氨酰胺含量 | 谷氨酰胺检测试剂盒 | Abcam | ab197011 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 89901 |
| Pierce Rapid Gold BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | A53226 | |
| 硝酸纤维素膜 | MilliporeSigma | -- | |
| 抗SLC38A2抗体 | BIOSS | bs-12125R | |
| 抗NDUFB8抗体 | Abcam | ab192878 | |
| 抗UQCRC2抗体 | Abcam | ab203832 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech Group, Inc. | 81115-1-RR | |
| ECL-PLUS化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 样本类型(CE, EU, EC)和数量(每组10例);患者月经周期阶段(早期增殖期);排除标准(激素治疗、感染等) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Samples' 部分 |
| 原代细胞分离与培养 | 组织消化酶(0.4%胶原酶、0.05%胰酶、20 μg/ml DNase I);消化时间(2-3小时);培养基(DMEM-F12含10% FBS);细胞传代比例和代数(第3代) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cells' 部分 |
| 慢病毒转染 | MOI(10);嘌呤霉素筛选浓度(1.5 μg/ml)和维持浓度(0.625 μg/ml);筛选时间(14天) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Lentivirus construction' 部分 |
| 细胞处理 | Gln浓度(1.5 mM);CB-839浓度(10 μM);处理时间(48小时);增殖检测时间点(0, 12, 24, 48小时) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cell treatment' 部分 |
| 功能检测 | CCK-8细胞密度(2x10^3/孔);Transwell细胞密度(1x10^5 cells/ml)和孵育时间(48小时);OCR实验重复数(6次);Gln含量检测细胞密度(1x10^4/孔) 阅读提示:Materials and methods 中的 'Cell proliferation assay', 'Transwell assay', 'Seahorse assay', 'Gln content' 部分 |