表达分析
评估RRS1在乳腺癌组织和细胞系中的表达水平。
通过Western blot和RT-qPCR检测乳腺癌组织及邻近正常组织中RRS1蛋白和mRNA表达,并在正常乳腺上皮细胞(HMEC)和四种乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、BT-549、MDA-MB-468、MCF-7)中检测RRS1表达。
Regulator of Ribosome Synthesis 1 (RRS1) Stabilizes GRP78 and Promotes Breast Cancer Progression.
包含体外细胞实验、组织样本分析、Co-IP/MS互作验证、蛋白稳定性实验及通路机制验证,符合两个及以上独立证据层级。
乳腺癌组织样本 BT-549细胞系 MDA-MB-231细胞系 MCF-7、MDA-MB-468细胞系
RRS1在乳腺癌组织和细胞系中高表达 sh-RRS1敲低后细胞增殖、侵袭和迁移能力下降 RRS1与GRP78存在相互作用 RRS1通过泛素-蛋白酶体途径稳定GRP78蛋白 GRP78介导PI3K/AKT通路激活
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估RRS1在乳腺癌组织和细胞系中的表达水平。
通过Western blot和RT-qPCR检测乳腺癌组织及邻近正常组织中RRS1蛋白和mRNA表达,并在正常乳腺上皮细胞(HMEC)和四种乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、BT-549、MDA-MB-468、MCF-7)中检测RRS1表达。
验证RRS1对乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。
通过慢病毒感染在BT-549和MDA-MB-231细胞中敲低或过表达RRS1,然后进行CCK-8增殖实验、集落形成实验、划痕实验和Transwell侵袭实验。
鉴定RRS1相互作用蛋白并验证RRS1与GRP78的相互作用。
通过Co-IP结合质谱分析鉴定与RRS1互作的蛋白,并用Co-IP和免疫荧光验证RRS1与GRP78的相互作用及共定位。
研究RRS1是否影响GRP78蛋白稳定性。
使用CHX处理细胞,观察GRP78蛋白半衰期;使用蛋白酶体抑制剂MG132处理细胞,检测GRP78蛋白水平;通过免疫沉淀和Western blot检测GRP78泛素化水平。
验证RRS1是否通过GRP78调控PI3K/AKT通路。
在RRS1敲低或过表达细胞中检测PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT等蛋白表达;通过siRNA敲低GRP78,观察对RRS1过表达引起的PI3K/AKT通路激活的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Hyclone | SH30243.01 |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 药物处理 | MG132 | Selleck | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | -- |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G试剂盒 | Epizyme | -- |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | -- |
| 免疫共沉淀 | 抗GRP78抗体 | Proteintech | 66574-1-Ig |
| 免疫球蛋白G | Bioss | bs-0297R | |
| 质谱分析 | 胰蛋白酶 | Promega | -- |
| Obitrap-Elite质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | 抗RRS1抗体 | Abcam | ab188161 |
| 荧光二抗 | ABclonal | AS039、AS011 | |
| DAPI染色液 | Epizyme | -- | |
| 激光共聚焦显微镜 | Leica | Stellaris 5 | |
| Western blot | 瑞斯托霉素诱导血小板聚集缓冲液 | Shandong Sparkjade Scientific Instruments Co., Ltd. | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| GRP78抗体 | Proteintech | ab32072 | |
| GAPDH抗体 | Abclonal | AC002 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Abmart | T40067 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Proteintech | AP0427 | |
| PI3K抗体 | Abclonal | A4992 | |
| AKT抗体 | Abmart | T55561 | |
| 泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| ECL化学发光底物 | Abclonal | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:MDA-MB-231、BT-549、MDA-MB-468、MCF-7、HMEC;DMEM高糖培养基含10% FBS。 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.2 |
| 基因敲低/过表达 | 慢病毒感染MOI=20,细胞融合度20-30%,感染后48小时进行后续实验。 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.3 |
| 细胞增殖、迁移和侵袭检测 | CCK-8检测:2×10^3细胞/孔,培养1-5天;划痕实验:细胞密度2×10^5/孔,观察0、24、48小时;Transwell侵袭实验:细胞密度1×10^4/孔,接种于Matrigel包被的Transwell小室,培养48小时。 阅读提示:Materials and Methods, Sections 4.5-4.7 |
| 蛋白稳定性分析 | CHX浓度710 μM;MG132浓度10 μM处理6小时;泛素化检测:IP使用抗GRP78抗体,WB使用抗泛素抗体。 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.11;Figure 4 |
| 通路验证 | siRNA敲低GRP78,序列信息;WB检测GRP78、PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT表达。 阅读提示:Materials and Methods, Section 4.3;Figure 6 |