临床样本分析
检测PDGF-BB、CAFs标志物和糖酵解相关蛋白在口腔鳞癌组织中的表达及相关性。
收集84例口腔鳞癌组织和24例癌旁组织,通过免疫组化染色检测PDGF-BB、MCT1、MCT4、LDHA等表达。
PDGF-BB accelerates TSCC via fibroblast lactates limiting miR-26a-5p and boosting mitophagy.
包含临床样本分析、体外细胞模型、体内裸鼠移植瘤模型,并进行功能验证(自噬调控、miR-26a-5p过表达)和机制验证(双荧光素酶实验、Western blot)
人正常口腔黏膜成纤维细胞(hOMF) 口腔舌鳞状细胞癌细胞系Cal-27 原代培养的CAFs和相邻正常成纤维细胞 BALB/c裸鼠混合移植瘤模型
PDGF-BB处理浓度:20 ng/ml,时间:72小时 饥饿处理:无血清DMEM低糖培养基培养48小时 细胞共注射数量:hOMF/CAFs和Cal-27各5×10^6细胞 mdivi-1和CCCP作为自噬抑制剂和增强剂的使用 miR-26a-5p过表达和MCT1基因敲除
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测PDGF-BB、CAFs标志物和糖酵解相关蛋白在口腔鳞癌组织中的表达及相关性。
收集84例口腔鳞癌组织和24例癌旁组织,通过免疫组化染色检测PDGF-BB、MCT1、MCT4、LDHA等表达。
验证PDGF-BB是否诱导成纤维细胞向CAF表型转化并发生有氧糖酵解。
hOMF细胞用20 ng/ml PDGF-BB处理72小时,检测α-SMA、FAP表达,以及葡萄糖摄取、乳酸分泌、线粒体呼吸链复合物活性等。
评估PDGF-BB是否增强饥饿处理的hOMF细胞中的线粒体自噬。
使用JC-1染色、MDC染色、透射电镜、LC3A/B免疫荧光、线粒体自噬染料与溶酶体共定位、Western blot检测自噬相关蛋白。
通过抑制或增强线粒体自噬,验证其对PDGF-BB诱导的CAF表型和有氧糖酵解的影响。
使用mdivi-1(自噬抑制剂)和CCCP(增强剂)处理细胞,检测CAF标志物和糖酵解相关蛋白表达及葡萄糖摄取和乳酸分泌。
探究miR-26a-5p是否通过靶向ULK1调控PDGF-BB诱导的线粒体自噬和有氧糖酵解。
通过miRNA芯片和qRT-PCR检测miR-26a-5p表达;双荧光素酶报告基因验证靶基因ULK1;过表达miR-26a-5p后检测自噬和糖酵解指标。
验证PDGF-BB诱导的CAFs产生的乳酸是否通过MCT1和NF-κB通路促进肿瘤细胞增殖、侵袭和迁移。
用CAF条件培养基或乳酸处理Cal-27细胞,检测增殖、迁移、侵袭及NF-κB通路蛋白;使用CHC和SC75741抑制MCT1和NF-κB;敲低MCT1验证作用。
在体内验证PDGF-BB诱导的CAFs是否促进肿瘤生长及乳酸代谢轴的作用。
将hOMF或CAFs与Cal-27混合皮下注射裸鼠,测量肿瘤体积和重量,进行HE和免疫组化染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| II型胶原酶 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 重组人PDGF-BB蛋白 | Peprotech | -- |
| CCCP | Selleck | -- | |
| Mdivi-1 | Selleck | -- | |
| CHC | Selleck | -- | |
| SC75741 | Selleck | -- | |
| 乳酸 | Sigma | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Kangwei | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 反转录系统 | Promega | -- | |
| SYBR Green试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | -- |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 葡萄糖摄取检测 | 葡萄糖摄取比色检测试剂盒 | Sigma | MAK083 |
| 氧化磷酸化检测 | 线粒体呼吸链复合物I活性检测试剂盒 | 南京建成 | -- |
| 线粒体呼吸链复合物II活性检测试剂盒 | 南京建成 | -- | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 |
| NADH检测 | NADH检测试剂盒 | Beyotime | S0175 |
| ELISA | PDGF-BB ELISA试剂盒 | R&D Systems | DBB00 |
| 线粒体自噬检测 | 线粒体自噬检测试剂盒 | DOJINDO | MD01 |
| 细胞因子芯片 | 人细胞因子抗体芯片1000 | Raybiotech | QAH-CAA-1000 |
| 免疫染色 | DAB底物 | ImmunoPure | -- |
| 免疫荧光 | Dylight 488山羊抗小鼠IgG | Abbkine | -- |
| Dylight 649山羊抗兔IgG | Abbkine | -- | |
| Western blotting | PDGF受体β抗体 | Abcam | ab32570 |
| α平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab5694 | |
| PDGF-BB抗体 | Abcam | ab23914 | |
| FAP-α抗体 | Abcam | ab53066 | |
| β-微管蛋白抗体 | Abcam | ab179513 | |
| GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 | |
| Bcl-2抗体 | Abcam | ab32124 | |
| LDH-B抗体 | Abcam | ab240482 | |
| LC3β抗体 | Abcam | ab53066 | |
| MCT4抗体 | Bioss | bs-2698R | |
| LDHA抗体 | Bioss | bs-18205R | |
| 己糖激酶II抗体 | Bioss | bs-9455R | |
| MCT1/SLC16A3抗体 | Bioss | bs-10249R | |
| NF-κB p65抗体 | Servicebio | GB11142 | |
| MT-ND1多克隆抗体 | Servicebio | GB113284 | |
| NF-κB p65 (phospho S536)抗体 | Servicebio | -- | |
| PINK1抗体 | CST | -- | |
| Parkin抗体 | CST | -- | |
| ULK1抗体 | CST | -- | |
| LC3A/B抗体 | CST | -- | |
| AMPK抗体 | CST | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Abcam | -- |
| MDC | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | hOMF和Cal-27细胞系来源;饥饿处理条件(无血清DMEM低糖培养基,48小时);PDGF-BB处理浓度(20 ng/ml)和持续时间(72小时);原代CAFs和NFs的分离方法 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Isolation of human normal primary fibroblasts and CAFs |
| 自噬调控 | mdivi-1和CCCP的使用浓度和时间;MDC染色浓度(100 μM)和孵育时间(30分钟);线粒体自噬检测试剂盒(DOJINDO MD01)的具体操作步骤 阅读提示:Materials and methods: Assessment of autophagy; Assessment of co-localization of mitophagy dye and lysosomes |
| miR-26a-5p功能实验 | miR-26a-5p过表达载体构建和慢病毒感染方法;双荧光素酶报告基因实验的具体步骤;ULK1作为靶基因的验证 阅读提示:Materials and methods: Plasmid construction and lentivirus Infection; Luciferase assay |
| 肿瘤细胞功能实验 | CAF条件培养基(CAF-CM)的制备比例(2/3:1/3);乳酸刺激的浓度梯度;CHC和SC75741的处理浓度;MCT1基因敲低的方法和效率验证 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Wound healing assay; Transwell invasion assay |
| 体内移植瘤模型 | 裸鼠品系(BALB/c)、周龄(6周)和性别(雄性);细胞注射数量(5×10^6);混合比例和注射部位;肿瘤测量频率(每3天)和终点(24天) 阅读提示:Materials and methods: Tumor xenograft model |