siRNA转染敲低COL1A1
在乳腺癌细胞中建立COL1A1低表达模型
使用脂质体RNAiMAX将siRNA-COL1A1或siRNA阴性对照转染至MDA-MB-231细胞,并设置空白对照组。转染后培养48小时。
Down-regulation of COL1A1 inhibits tumor-associated fibroblast activation and mediates matrix remodeling in the tumor microenvironment of breast cancer.
研究包含siRNA转染、外泌体提取与表征、共培养、Western blot、ELISA和RT-qPCR等明确实验方法及结果验证,但缺乏动物实验和体内验证。
MDA-MB-231人乳腺癌细胞系 HKF人成纤维细胞系 外泌体共培养体系
MDA-MB-231细胞中COL1A1的敲低效率 外泌体浓度(50 μg/mL)及共培养时间(24 h) 外泌体鉴定标志物CD63、CD81的表达 成纤维细胞活化标志物α-SMA、FAP及间质标志物E-cadherin、CAV-1的表达变化 COLⅠ、COLⅢ及TGF-β1的分泌水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在乳腺癌细胞中建立COL1A1低表达模型
使用脂质体RNAiMAX将siRNA-COL1A1或siRNA阴性对照转染至MDA-MB-231细胞,并设置空白对照组。转染后培养48小时。
提取并验证细胞外泌体及其COL1A1表达
收集转染后细胞培养上清,通过差速离心提取外泌体,并用Western blot检测CD63、CD81和COL1A1表达。
分析外泌体粒径和浓度
使用Nano Measurer软件分析外泌体粒径大小和分布。
检测外泌体对成纤维细胞活化的影响
将HKF细胞与50 μg/mL外泌体共培养24小时,这些外泌体分别来源于正常培养的MDA-MB-231细胞、siRNA阴性对照转染细胞和siRNA-COL1A1转染细胞。
检测成纤维细胞中基质重塑及活化相关分子表达
收集共培养后的成纤维细胞,分别通过Western blot、ELISA和RT-qPCR检测COLⅠ、COLⅢ、TGF-β1、E-cadherin、α-SMA、FAP和CAV-1的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良 Eagle 培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 最低必需培养基 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| siRNA转染 | 脂质体RNAiMAX | -- | -- |
| Western blot | 兔抗CD63抗体 | Bioss | bs-1523R |
| 兔抗CD81抗体 | Bioss | bs-6934R | |
| 兔抗I型胶原抗体 | Bioss | bs-10423R | |
| 兔抗E-钙黏蛋白抗体 | Bioss | bs-10009R | |
| 兔抗小窝蛋白-1抗体 | Bioss | bs-1453R | |
| 抗成纤维细胞活化蛋白抗体 | Boster | PB0096 | |
| 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205718 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205719 | |
| ChemiScope迷你化学发光仪 | -- | -- | |
| ELISA | 人I型胶原ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E08082h |
| 人III型胶原ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E04799h | |
| 人/小鼠/大鼠TGF-β1 ELISA试剂盒 | Cusabio | 70-EK981-48 | |
| RT-qPCR | SYBR Green(MasterMix-LR) | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | MDA-MB-231细胞培养于含10%胎牛血清的DMEM培养基;HKF细胞培养于含10%胎牛血清和1%非必需氨基酸的MEM培养基,均在37°C、5% CO2条件下培养。 阅读提示:参见Methods 2.1节 |
| siRNA转染 | 使用脂质体RNAiMAX转染siRNA-COL1A1或siRNA阴性对照,转染后培养48小时。 阅读提示:参见Methods 2.2节 |
| 外泌体提取 | 通过差速离心提取,具体步骤包括3,000×g 15分钟、6,000×g 40分钟、10,000×g 40分钟、100,000×g 60分钟,均于4°C进行。 阅读提示:参见Methods 2.3节 |
| 共培养实验 | HKF细胞与50 μg/mL外泌体共培养24小时。 阅读提示:参见Methods 2.4节 |
| 蛋白检测 | Western blot检测蛋白表达,ELISA检测COLⅠ、COLⅢ和TGF-β1含量,RT-qPCR检测mRNA表达。 阅读提示:参见Methods 2.5-2.7节及图2-4 |